40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2644 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2644  glycosy hydrolase family protein  100 
 
 		 601 aa  1223    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1984  hypothetical protein  48.2 
 
 		 417 aa  320  6e-86  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2658  hypothetical protein  53.56 
 
 		 300 aa  263  8.999999999999999e-69  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2670  glycosy hydrolase family protein  53.58 
 
 		 812 aa  256  6e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2666  glycosy hydrolase family protein  62.96 
 
 		 970 aa  206  9e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2665  glycosy hydrolase family protein  62.82 
 
 		 693 aa  202  9.999999999999999e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.472135  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2672  glycosy hydrolase family protein  49.78 
 
 		 1193 aa  191  2.9999999999999997e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.947842  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2680  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  50 
 
 		 1206 aa  150  8e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.117789 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4349  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  54.29 
 
 		 1236 aa  149  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.165187 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3712  Beta-galactosidase  43.02 
 
 		 1392 aa  138  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173046  normal  0.0203648 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2289  glycosy hydrolase family protein  44.3 
 
 		 1069 aa  137  4e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1051  endoglucanase-related protein  48.15 
 
 		 1295 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.222685 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1044  Alpha-galactosidase  47.33 
 
 		 693 aa  134  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4634  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  47.26 
 
 		 1424 aa  134  5e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.893507  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2660  hypothetical protein  47.5 
 
 		 129 aa  105  3e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.554627  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1073  discoidin domain-containing protein  34.1 
 
 		 2142 aa  100  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.742063  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2129  fibronectin type III domain-containing protein  37.01 
 
 		 1479 aa  95.5  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3211  alpha-fucosidase  38.93 
 
 		 1193 aa  95.9  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.084179  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1489  F5/8 type C domain-containing protein  32.63 
 
 		 1687 aa  89  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1278  leucine rich repeat domain-containing protein  32.63 
 
 		 1465 aa  87  8e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0180436  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5007  Alpha-galactosidase  32.48 
 
 		 850 aa  76.6  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.285302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1221  beta-galactosidase  30.43 
 
 		 1455 aa  68.6  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2887  Alpha-galactosidase  33.62 
 
 		 658 aa  67.4  0.0000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00523951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2885  Alpha-galactosidase  30.83 
 
 		 677 aa  64.3  0.000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.14976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1378  hypothetical protein  32.58 
 
 		 430 aa  63.5  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1842  hyaluronoglucosaminidase domain-containing protein  29.7 
 
 		 248 aa  62.4  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1049  hypothetical protein  31.21 
 
 		 279 aa  58.9  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1808  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  27.52 
 
 		 413 aa  58.5  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.145973  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0156  glycosyl hydrolase family 31 protein  27.56 
 
 		 1108 aa  56.6  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0105603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1438  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  39.08 
 
 		 639 aa  55.5  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0480  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  35.96 
 
 		 794 aa  53.9  0.000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.133222 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2412  Alpha-galactosidase  32.03 
 
 		 631 aa  52.4  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00268404  normal  0.284448 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2846  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  28.3 
 
 		 624 aa  51.6  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.646989  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3814  glycoside hydrolase family 31  30 
 
 		 1119 aa  51.6  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0313  Alpha-galactosidase  34.83 
 
 		 636 aa  51.2  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5107  hypothetical protein  22.65 
 
 		 794 aa  48.1  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.819284 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0029  membrane-bound dehydrogenase domain protein  30.34 
 
 		 1201 aa  48.1  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.167421  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0714  hypothetical protein  31.82 
 
 		 283 aa  44.7  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5069  hypothetical protein  24.28 
 
 		 778 aa  43.9  0.009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.134968 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4608  hypothetical protein  24.28 
 
 		 778 aa  43.9  0.009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.042259 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>