61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1489 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_1278  leucine rich repeat domain-containing protein  91.23 
 
 		 1465 aa  2575    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0180436  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1489  F5/8 type C domain-containing protein  100 
 
 		 1687 aa  3428    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1073  discoidin domain-containing protein  45.99 
 
 		 2142 aa  1229    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.742063  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3211  alpha-fucosidase  44.94 
 
 		 1193 aa  137  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.084179  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2129  fibronectin type III domain-containing protein  42.86 
 
 		 1479 aa  131  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1817  coagulation factor 5/8 type domain protein  24.76 
 
 		 1787 aa  119  6e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.29404 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1221  beta-galactosidase  38.71 
 
 		 1455 aa  103  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2666  glycosy hydrolase family protein  36.07 
 
 		 970 aa  93.2  4e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2665  glycosy hydrolase family protein  37.21 
 
 		 693 aa  91.7  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.472135  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2644  glycosy hydrolase family protein  32.63 
 
 		 601 aa  89  8e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1051  endoglucanase-related protein  39.04 
 
 		 1295 aa  88.2  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.222685 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2672  glycosy hydrolase family protein  37.35 
 
 		 1193 aa  88.2  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.947842  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2289  glycosy hydrolase family protein  37.31 
 
 		 1069 aa  87.4  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4349  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  36.18 
 
 		 1236 aa  86.3  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.165187 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2680  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  34.62 
 
 		 1206 aa  80.1  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.117789 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1842  hyaluronoglucosaminidase domain-containing protein  37.25 
 
 		 248 aa  77.8  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2670  glycosy hydrolase family protein  31.01 
 
 		 812 aa  77  0.000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5171  wall-associated protein  24.59 
 
 		 1277 aa  70.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2851e-37 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3446  S-layer domain-containing protein  23.5 
 
 		 876 aa  69.3  0.0000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3712  Beta-galactosidase  26.18 
 
 		 1392 aa  67.4  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173046  normal  0.0203648 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5172  wall-associated protein  23.04 
 
 		 1081 aa  65.1  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000236947 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4634  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  30.15 
 
 		 1424 aa  63.9  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.893507  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5203  hypothetical protein  22.9 
 
 		 1067 aa  63.9  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.226365  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1044  Alpha-galactosidase  32.65 
 
 		 693 aa  63.5  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2581  neutral protease  29.13 
 
 		 884 aa  62.8  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000011855 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4770  wall-associated protein  23.13 
 
 		 1273 aa  62.4  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000568341  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5221  wall-associated protein  21.3 
 
 		 1270 aa  60.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.632679  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5208  wall-associated protein  21.3 
 
 		 1068 aa  60.8  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0553155  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4929  hypothetical protein  21.94 
 
 		 554 aa  60.1  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2393  thermolysin metallopeptidase  28.8 
 
 		 530 aa  59.7  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4888  wall-associated protein precursor  21.69 
 
 		 1475 aa  59.7  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4790  wall-associated protein  21.48 
 
 		 1467 aa  59.3  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2534  neutral protease  27.3 
 
 		 887 aa  59.3  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.596256  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0040  wall-associated protein  23.29 
 
 		 1476 aa  58.2  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.218443  hitchhiker  4.78109e-16 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2624  bacillolysin  38.89 
 
 		 891 aa  57.4  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000636329  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1808  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  28.8 
 
 		 413 aa  57  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.145973  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2348  bacillolysin (neutral protease)  38.37 
 
 		 890 aa  53.9  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00113983  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1087  pullulanase family protein  32.53 
 
 		 2638 aa  53.5  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2608  hypothetical protein  36.45 
 
 		 197 aa  53.9  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2310  bacillolysin  35.56 
 
 		 886 aa  53.9  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.105645  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2571  neutral protease A, bacillolysin  37.78 
 
 		 891 aa  53.9  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000442231  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2335  S-layer domain-containing protein  23.44 
 
 		 869 aa  52.8  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0205694  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1475  YD repeat-containing protein  32.69 
 
 		 2294 aa  52.4  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.705972 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4248  hypothetical protein  23.81 
 
 		 824 aa  51.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1695  S-layer domain protein  23.49 
 
 		 735 aa  51.2  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000200571 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4574  hypothetical protein  22.26 
 
 		 827 aa  49.3  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.552406  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5623  fibronectin type III domain-containing protein  22.78 
 
 		 749 aa  49.3  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.198115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3655  glycoside hydrolase family protein  33.33 
 
 		 727 aa  48.9  0.0008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0607  internalin, putative  29.2 
 
 		 1088 aa  48.5  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2789  bacillolysin  38.75 
 
 		 893 aa  48.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000716183  hitchhiker  0.000000152737 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0627  hypothetical protein  25.41 
 
 		 506 aa  48.1  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.300902 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0647  chitinase-related protein  38.75 
 
 		 105 aa  48.5  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1885  S-layer domain protein  21.81 
 
 		 591 aa  47.8  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.726885  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09730  hypothetical protein  27.46 
 
 		 464 aa  47  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.50179  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1379  leucine-rich repeat-containing protein  38.03 
 
 		 1052 aa  46.6  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4085  chitinase A  32.18 
 
 		 699 aa  47  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1144  hypothetical protein  37.5 
 
 		 105 aa  46.2  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0791111  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1122  hypothetical protein  37.5 
 
 		 105 aa  46.2  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0136739  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05656  chitinase  37.5 
 
 		 565 aa  45.8  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05899  chitinase  36.71 
 
 		 729 aa  45.4  0.01  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00548  chitinase  36.71 
 
 		 729 aa  45.4  0.01  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>