77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1073 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_1278  leucine rich repeat domain-containing protein  45.76 
 
 		 1465 aa  1014    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0180436  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1489  F5/8 type C domain-containing protein  45.99 
 
 		 1687 aa  1189    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1073  discoidin domain-containing protein  100 
 
 		 2142 aa  4340    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.742063  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2129  fibronectin type III domain-containing protein  50 
 
 		 1479 aa  162  4e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3211  alpha-fucosidase  48.19 
 
 		 1193 aa  149  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.084179  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2666  glycosy hydrolase family protein  27.44 
 
 		 970 aa  111  1e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2665  glycosy hydrolase family protein  26.74 
 
 		 693 aa  108  1e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.472135  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1817  coagulation factor 5/8 type domain protein  23.4 
 
 		 1787 aa  103  5e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.29404 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2289  glycosy hydrolase family protein  40 
 
 		 1069 aa  101  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2644  glycosy hydrolase family protein  34.1 
 
 		 601 aa  100  3e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2680  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  39.76 
 
 		 1206 aa  98.2  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.117789 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1221  beta-galactosidase  38.98 
 
 		 1455 aa  97.4  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4349  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  37.3 
 
 		 1236 aa  97.8  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.165187 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1051  endoglucanase-related protein  40.94 
 
 		 1295 aa  95.5  9e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.222685 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2670  glycosy hydrolase family protein  33.97 
 
 		 812 aa  87.4  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2672  glycosy hydrolase family protein  43.97 
 
 		 1193 aa  87  0.000000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.947842  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1842  hyaluronoglucosaminidase domain-containing protein  43.14 
 
 		 248 aa  85.9  0.000000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1044  Alpha-galactosidase  36.62 
 
 		 693 aa  80.9  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3712  Beta-galactosidase  32.58 
 
 		 1392 aa  75.1  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173046  normal  0.0203648 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1087  pullulanase family protein  50.68 
 
 		 2638 aa  75.1  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3446  S-layer domain-containing protein  24.47 
 
 		 876 aa  70.9  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4634  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  29.15 
 
 		 1424 aa  70.9  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.893507  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4888  wall-associated protein precursor  22.04 
 
 		 1475 aa  70.1  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2348  bacillolysin (neutral protease)  40 
 
 		 890 aa  69.3  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00113983  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5221  wall-associated protein  21.81 
 
 		 1270 aa  68.9  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.632679  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5208  wall-associated protein  21.81 
 
 		 1068 aa  68.6  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0553155  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2534  neutral protease  25.85 
 
 		 887 aa  67  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.596256  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2310  bacillolysin  25.08 
 
 		 886 aa  66.2  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.105645  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5171  wall-associated protein  23.5 
 
 		 1277 aa  65.9  0.000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2851e-37 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2789  bacillolysin  26.19 
 
 		 893 aa  65.5  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000716183  hitchhiker  0.000000152737 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0627  hypothetical protein  25.07 
 
 		 506 aa  63.2  0.00000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.300902 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5172  wall-associated protein  23.29 
 
 		 1081 aa  62  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000236947 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1475  YD repeat-containing protein  43.42 
 
 		 2294 aa  62  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.705972 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1557  hypothetical protein  42.11 
 
 		 498 aa  61.6  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000266916 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2624  bacillolysin  23.32 
 
 		 891 aa  60.5  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000636329  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00548  chitinase  40 
 
 		 729 aa  60.5  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05899  chitinase  40 
 
 		 729 aa  60.5  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5203  hypothetical protein  23.23 
 
 		 1067 aa  60.1  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.226365  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1045  hypothetical protein  39.36 
 
 		 356 aa  59.7  0.0000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0229946 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2581  neutral protease  42.67 
 
 		 884 aa  59.3  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000011855 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0949  chitinase B  54.55 
 
 		 64 aa  58.2  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00782065  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2393  thermolysin metallopeptidase  22.71 
 
 		 530 aa  58.2  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1438  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  37.5 
 
 		 639 aa  57.4  0.000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4770  wall-associated protein  23.01 
 
 		 1273 aa  56.6  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000568341  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2571  neutral protease A, bacillolysin  22.53 
 
 		 891 aa  56.2  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000442231  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1885  S-layer domain protein  23.83 
 
 		 591 aa  55.1  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.726885  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0647  chitinase-related protein  40.23 
 
 		 105 aa  55.5  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1144  hypothetical protein  40.23 
 
 		 105 aa  54.3  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0791111  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1122  hypothetical protein  40.23 
 
 		 105 aa  54.3  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0136739  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0040  wall-associated protein  22.06 
 
 		 1476 aa  54.3  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.218443  hitchhiker  4.78109e-16 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0480  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  33.06 
 
 		 794 aa  53.5  0.00004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.133222 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2412  Alpha-galactosidase  27.69 
 
 		 631 aa  53.5  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00268404  normal  0.284448 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2383  putative surface protein  43.04 
 
 		 929 aa  53.5  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.13211  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05656  chitinase  41.54 
 
 		 565 aa  53.1  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0859  alpha-N-acetylglucosaminidase family protein  26.55 
 
 		 2095 aa  53.1  0.00006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3655  glycoside hydrolase family protein  36.56 
 
 		 727 aa  52.8  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4085  chitinase A  34.38 
 
 		 699 aa  52.8  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1614  glycosy hydrolase family protein  26.23 
 
 		 1471 aa  52.4  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0850  alpha-N-acetylglucosaminidase family protein  25.66 
 
 		 2095 aa  51.6  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.871673  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2885  Alpha-galactosidase  30.07 
 
 		 677 aa  51.6  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.14976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0394  polysaccharide lyase family protein 8  35.8 
 
 		 1003 aa  51.6  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0390  polysaccharide lyase family protein 8  34.57 
 
 		 985 aa  50.4  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.918566  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2335  S-layer domain-containing protein  22.48 
 
 		 869 aa  50.1  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0205694  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0532  putative exo-alpha-sialidase  26.02 
 
 		 1173 aa  48.9  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0029  membrane-bound dehydrogenase domain protein  34.48 
 
 		 1201 aa  48.1  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.167421  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0156  glycosyl hydrolase family 31 protein  27.62 
 
 		 1108 aa  47.8  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0105603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1301  glycosyl hydrolase family 31 protein  27.95 
 
 		 1965 aa  48.1  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.449133  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1695  S-layer domain protein  21.69 
 
 		 735 aa  47.4  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000200571 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1542  Leucine-rich repeat, ribonuclease inhibitor subtype  35 
 
 		 344 aa  47  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.400143  hitchhiker  0.0000648259 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0313  Alpha-galactosidase  28.57 
 
 		 636 aa  46.6  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2887  Alpha-galactosidase  30.36 
 
 		 658 aa  46.6  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00523951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  28.89 
 
 		 1351 aa  46.6  0.006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0607  internalin, putative  36.59 
 
 		 1088 aa  46.2  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2608  hypothetical protein  34.78 
 
 		 197 aa  46.2  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4790  wall-associated protein  21.08 
 
 		 1467 aa  46.2  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5623  fibronectin type III domain-containing protein  22.35 
 
 		 749 aa  45.8  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.198115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  33.72 
 
 		 6885 aa  45.8  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>