22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0480 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_0480  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  100 
 
 		 794 aa  1650    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.133222 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0200  ATP/GTP-binding site  39.89 
 
 		 564 aa  388  1e-106  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1842  hypothetical protein  30.05 
 
 		 612 aa  287  5e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3656  hypothetical protein  28.65 
 
 		 608 aa  249  1e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0159137  normal  0.0559089 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1248  hypothetical protein  26.95 
 
 		 610 aa  213  1e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000368006  unclonable  0.0000000216996 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1463  hypothetical protein  30.04 
 
 		 596 aa  198  4.0000000000000005e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4392  Alpha-galactosidase  26.87 
 
 		 589 aa  195  2e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941976  normal  0.0174119 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2644  glycosy hydrolase family protein  39.25 
 
 		 601 aa  65.5  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2672  glycosy hydrolase family protein  37.61 
 
 		 1193 aa  64.3  0.000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.947842  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2289  glycosy hydrolase family protein  31.65 
 
 		 1069 aa  63.9  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1073  discoidin domain-containing protein  35.77 
 
 		 2142 aa  53.5  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.742063  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2666  glycosy hydrolase family protein  34.21 
 
 		 970 aa  52  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2665  glycosy hydrolase family protein  33.64 
 
 		 693 aa  50.8  0.00009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.472135  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3211  alpha-fucosidase  36.54 
 
 		 1193 aa  50.8  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.084179  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3712  Beta-galactosidase  26.53 
 
 		 1392 aa  50.4  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173046  normal  0.0203648 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1051  endoglucanase-related protein  31.25 
 
 		 1295 aa  50.1  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.222685 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4349  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  35.33 
 
 		 1236 aa  50.1  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.165187 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4634  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  32.71 
 
 		 1424 aa  47.4  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.893507  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2670  glycosy hydrolase family protein  30.36 
 
 		 812 aa  46.2  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2680  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  32.38 
 
 		 1206 aa  46.2  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.117789 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1278  leucine rich repeat domain-containing protein  26.32 
 
 		 1465 aa  44.7  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0180436  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1489  F5/8 type C domain-containing protein  26.9 
 
 		 1687 aa  44.3  0.008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>