34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_4248 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4574  hypothetical protein  49.09 
 
 
827 aa  790    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.552406  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4248  hypothetical protein  100 
 
 
824 aa  1717    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1885  S-layer domain protein  33.61 
 
 
591 aa  201  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.726885  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3446  S-layer domain-containing protein  34.87 
 
 
876 aa  196  1e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2335  S-layer domain-containing protein  30.04 
 
 
869 aa  196  2e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0205694  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5623  fibronectin type III domain-containing protein  31.93 
 
 
749 aa  196  2e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.198115  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4888  wall-associated protein precursor  32.48 
 
 
1475 aa  195  3e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1695  S-layer domain protein  30.63 
 
 
735 aa  190  9e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000200571 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5208  wall-associated protein  32.92 
 
 
1068 aa  188  4e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0553155  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5221  wall-associated protein  32.92 
 
 
1270 aa  188  4e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.632679  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5171  wall-associated protein  30.73 
 
 
1277 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2851e-37 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4790  wall-associated protein  31.18 
 
 
1467 aa  174  5e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0040  wall-associated protein  30.71 
 
 
1476 aa  174  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.218443  hitchhiker  4.78109e-16 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4770  wall-associated protein  32.8 
 
 
1273 aa  174  9e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000568341  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5203  hypothetical protein  32.54 
 
 
1067 aa  173  9e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.226365  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4929  hypothetical protein  30.97 
 
 
554 aa  170  8e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5172  wall-associated protein  30.47 
 
 
1081 aa  168  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000236947 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09730  hypothetical protein  26.49 
 
 
464 aa  89  3e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.50179  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0627  hypothetical protein  30.43 
 
 
506 aa  70.9  0.0000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.300902 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4889  hypothetical protein  24.93 
 
 
607 aa  68.2  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2001  putative lipoprotein  24.28 
 
 
679 aa  58.5  0.0000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.629311  normal  0.117944 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1514  hypothetical protein  26.04 
 
 
660 aa  55.8  0.000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.767692  hitchhiker  0.00000248553 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2532  hypothetical protein  23.22 
 
 
770 aa  53.1  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5331  hypothetical protein  22.93 
 
 
630 aa  53.1  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1278  leucine rich repeat domain-containing protein  24.18 
 
 
1465 aa  52  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0180436  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1489  F5/8 type C domain-containing protein  23.81 
 
 
1687 aa  51.6  0.00006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2078  fam139a; Protein FAM139A  28.03 
 
 
785 aa  47.8  0.0009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0723  conserved hypothetical protein  24.87 
 
 
1520 aa  47.8  0.0009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3432  hypothetical protein  22.98 
 
 
1506 aa  47  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3251  hypothetical protein  22.3 
 
 
1518 aa  45.4  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3142  hypothetical protein  22.3 
 
 
1503 aa  45.4  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02792  hypothetical protein  23.05 
 
 
1517 aa  44.7  0.007  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00846982  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0370  putative lipoprotein  21.34 
 
 
1443 aa  44.7  0.007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02842  predicted inner membrane lipoprotein  23.05 
 
 
1517 aa  44.7  0.007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00831057  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>