30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_09730 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_09730  hypothetical protein  100 
 
 
464 aa  926    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.50179  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5203  hypothetical protein  31.36 
 
 
1067 aa  172  2e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.226365  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5171  wall-associated protein  29.11 
 
 
1277 aa  171  3e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2851e-37 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4770  wall-associated protein  31.62 
 
 
1273 aa  171  3e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000568341  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4888  wall-associated protein precursor  30.65 
 
 
1475 aa  171  4e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0040  wall-associated protein  30.92 
 
 
1476 aa  161  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.218443  hitchhiker  4.78109e-16 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5208  wall-associated protein  27.03 
 
 
1068 aa  159  1e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0553155  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5221  wall-associated protein  28.16 
 
 
1270 aa  158  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.632679  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4790  wall-associated protein  30.95 
 
 
1467 aa  152  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4929  hypothetical protein  30.18 
 
 
554 aa  152  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5172  wall-associated protein  29.34 
 
 
1081 aa  141  3e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000236947 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1885  S-layer domain protein  28.5 
 
 
591 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.726885  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5623  fibronectin type III domain-containing protein  28.42 
 
 
749 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.198115  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1695  S-layer domain protein  27.04 
 
 
735 aa  117  6e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000200571 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4889  hypothetical protein  29.85 
 
 
607 aa  116  7.999999999999999e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5331  hypothetical protein  28.54 
 
 
630 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2335  S-layer domain-containing protein  28.39 
 
 
869 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0205694  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3446  S-layer domain-containing protein  26.21 
 
 
876 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4574  hypothetical protein  28.54 
 
 
827 aa  109  9.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.552406  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4248  hypothetical protein  26.49 
 
 
824 aa  90.1  7e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1514  hypothetical protein  24.5 
 
 
660 aa  78.6  0.0000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.767692  hitchhiker  0.00000248553 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2532  hypothetical protein  24.75 
 
 
770 aa  77.4  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2078  fam139a; Protein FAM139A  25.25 
 
 
785 aa  74.3  0.000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2001  putative lipoprotein  24.3 
 
 
679 aa  53.5  0.000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.629311  normal  0.117944 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1489  F5/8 type C domain-containing protein  27.46 
 
 
1687 aa  47  0.0007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0627  hypothetical protein  22.37 
 
 
506 aa  46.6  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.300902 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0675  hypothetical protein  28.07 
 
 
908 aa  46.2  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0370  putative lipoprotein  22.19 
 
 
1443 aa  46.6  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07430  hypothetical protein  27.63 
 
 
923 aa  46.6  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.333671 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1278  leucine rich repeat domain-containing protein  26.94 
 
 
1465 aa  45.8  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0180436  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>