24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_5331 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_5331  hypothetical protein  100 
 
 		 630 aa  1292    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4889  hypothetical protein  72.77 
 
 		 607 aa  889    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09730  hypothetical protein  28.04 
 
 		 464 aa  115  2.0000000000000002e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.50179  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5172  wall-associated protein  24.83 
 
 		 1081 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000236947 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4888  wall-associated protein precursor  25.68 
 
 		 1475 aa  108  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5171  wall-associated protein  26.85 
 
 		 1277 aa  105  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2851e-37 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5208  wall-associated protein  26.09 
 
 		 1068 aa  104  5e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0553155  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4770  wall-associated protein  25 
 
 		 1273 aa  103  8e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000568341  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5221  wall-associated protein  26.09 
 
 		 1270 aa  103  9e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.632679  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0040  wall-associated protein  27.01 
 
 		 1476 aa  100  7e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.218443  hitchhiker  4.78109e-16 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5203  hypothetical protein  24.51 
 
 		 1067 aa  100  8e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.226365  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3446  S-layer domain-containing protein  26.5 
 
 		 876 aa  100  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1885  S-layer domain protein  25.5 
 
 		 591 aa  99.8  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.726885  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5623  fibronectin type III domain-containing protein  25.93 
 
 		 749 aa  94.4  6e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.198115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2335  S-layer domain-containing protein  26.22 
 
 		 869 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0205694  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4929  hypothetical protein  24.26 
 
 		 554 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1695  S-layer domain protein  26.22 
 
 		 735 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000200571 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4790  wall-associated protein  24.26 
 
 		 1467 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4574  hypothetical protein  24.73 
 
 		 827 aa  74.3  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.552406  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2532  hypothetical protein  23.42 
 
 		 770 aa  70.5  0.00000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1514  hypothetical protein  22.05 
 
 		 660 aa  59.3  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.767692  hitchhiker  0.00000248553 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0627  hypothetical protein  23.35 
 
 		 506 aa  59.3  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.300902 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4248  hypothetical protein  23.4 
 
 		 824 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0140  enhancin family protein  23.28 
 
 		 548 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.141445  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>