36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2532 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2532  hypothetical protein  100 
 
 		 770 aa  1590    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2078  fam139a; Protein FAM139A  29.96 
 
 		 785 aa  302  2e-80  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1514  hypothetical protein  24.89 
 
 		 660 aa  152  2e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.767692  hitchhiker  0.00000248553 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5623  fibronectin type III domain-containing protein  26.33 
 
 		 749 aa  105  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.198115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5171  wall-associated protein  26.67 
 
 		 1277 aa  99.4  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2851e-37 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1885  S-layer domain protein  26.29 
 
 		 591 aa  99.4  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.726885  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4929  hypothetical protein  25.84 
 
 		 554 aa  99  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5203  hypothetical protein  25.07 
 
 		 1067 aa  97.4  8e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.226365  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4770  wall-associated protein  25.26 
 
 		 1273 aa  96.7  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000568341  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1695  S-layer domain protein  25.51 
 
 		 735 aa  95.5  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000200571 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3446  S-layer domain-containing protein  25.32 
 
 		 876 aa  94.7  6e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4790  wall-associated protein  26.29 
 
 		 1467 aa  94  9e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0040  wall-associated protein  26.94 
 
 		 1476 aa  93.2  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.218443  hitchhiker  4.78109e-16 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2335  S-layer domain-containing protein  25 
 
 		 869 aa  92.4  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0205694  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4888  wall-associated protein precursor  25.46 
 
 		 1475 aa  89  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5208  wall-associated protein  24.17 
 
 		 1068 aa  87.8  6e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0553155  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5221  wall-associated protein  24.17 
 
 		 1270 aa  87.8  7e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.632679  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09730  hypothetical protein  24.75 
 
 		 464 aa  77.8  0.0000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.50179  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0723  conserved hypothetical protein  22.25 
 
 		 1520 aa  67.4  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5172  wall-associated protein  24.42 
 
 		 1081 aa  66.6  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000236947 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5331  hypothetical protein  23.42 
 
 		 630 aa  65.9  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4574  hypothetical protein  23.28 
 
 		 827 aa  65.1  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.552406  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0627  hypothetical protein  22.79 
 
 		 506 aa  58.9  0.0000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.300902 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02792  hypothetical protein  19.91 
 
 		 1517 aa  57.8  0.0000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00846982  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02842  predicted inner membrane lipoprotein  19.91 
 
 		 1517 aa  57.8  0.0000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00831057  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3142  hypothetical protein  24.35 
 
 		 1503 aa  57.4  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3251  hypothetical protein  24.35 
 
 		 1518 aa  57.4  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3432  hypothetical protein  20.64 
 
 		 1506 aa  53.9  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4889  hypothetical protein  22.65 
 
 		 607 aa  53.1  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4248  hypothetical protein  23.22 
 
 		 824 aa  53.1  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0675  hypothetical protein  20.32 
 
 		 908 aa  48.1  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2636  inner membrane lipoprotein  23.35 
 
 		 1426 aa  47.4  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.98205  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1278  leucine rich repeat domain-containing protein  24.51 
 
 		 1465 aa  46.6  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0180436  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07430  hypothetical protein  23.66 
 
 		 923 aa  45.8  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.333671 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2001  putative lipoprotein  18.49 
 
 		 679 aa  45.4  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.629311  normal  0.117944 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1489  F5/8 type C domain-containing protein  23.55 
 
 		 1687 aa  44.3  0.01  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>