21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0370 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_0723  conserved hypothetical protein  49.42 
 
 		 1520 aa  1401    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02792  hypothetical protein  48.67 
 
 		 1517 aa  1389    Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00846982  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3251  hypothetical protein  48.84 
 
 		 1518 aa  1386    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2636  inner membrane lipoprotein  37.65 
 
 		 1426 aa  843    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.98205  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3432  hypothetical protein  49.59 
 
 		 1506 aa  1389    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3142  hypothetical protein  48.84 
 
 		 1503 aa  1385    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0370  putative lipoprotein  100 
 
 		 1443 aa  2984    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02842  predicted inner membrane lipoprotein  48.67 
 
 		 1517 aa  1389    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00831057  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1514  hypothetical protein  26.79 
 
 		 660 aa  90.1  3e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.767692  hitchhiker  0.00000248553 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2078  fam139a; Protein FAM139A  27.5 
 
 		 785 aa  70.1  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4770  wall-associated protein  25.57 
 
 		 1273 aa  57.4  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000568341  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4574  hypothetical protein  23.32 
 
 		 827 aa  55.5  0.000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.552406  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5203  hypothetical protein  20.65 
 
 		 1067 aa  55.1  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.226365  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0040  wall-associated protein  27.87 
 
 		 1476 aa  53.9  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.218443  hitchhiker  4.78109e-16 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5623  fibronectin type III domain-containing protein  22.96 
 
 		 749 aa  52.4  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.198115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2335  S-layer domain-containing protein  21.21 
 
 		 869 aa  51.6  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0205694  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5171  wall-associated protein  24.89 
 
 		 1277 aa  51.6  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2851e-37 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1695  S-layer domain protein  21.31 
 
 		 735 aa  50.1  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000200571 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4790  wall-associated protein  23.85 
 
 		 1467 aa  48.5  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4929  hypothetical protein  23.85 
 
 		 554 aa  47  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4248  hypothetical protein  21.16 
 
 		 824 aa  45.1  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>