20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A3142 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_0723  conserved hypothetical protein  93.29 
 
 		 1520 aa  2800    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02792  hypothetical protein  92.29 
 
 		 1517 aa  2790    Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00846982  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3251  hypothetical protein  99.53 
 
 		 1518 aa  3111    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2636  inner membrane lipoprotein  38.36 
 
 		 1426 aa  950    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.98205  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3432  hypothetical protein  93.1 
 
 		 1506 aa  2787    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3142  hypothetical protein  100 
 
 		 1503 aa  3122    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0370  putative lipoprotein  48.77 
 
 		 1443 aa  1361    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02842  predicted inner membrane lipoprotein  92.29 
 
 		 1517 aa  2790    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00831057  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0727  hypothetical protein  91.41 
 
 		 143 aa  120  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2078  fam139a; Protein FAM139A  28.81 
 
 		 785 aa  95.9  6e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1514  hypothetical protein  27.8 
 
 		 660 aa  95.1  9e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.767692  hitchhiker  0.00000248553 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2532  hypothetical protein  25.35 
 
 		 770 aa  57.8  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1386  hypothetical protein  41.18 
 
 		 529 aa  49.7  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0257961  normal  0.650962 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0945  intradiol ring-cleavage dioxygenase  35.29 
 
 		 288 aa  48.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0899  hypothetical protein  23.27 
 
 		 987 aa  48.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0750964  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0836  hypothetical protein  53.7 
 
 		 268 aa  47.8  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000351202 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4013  peptidoglycan-binding LysM  37.5 
 
 		 203 aa  46.2  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0332681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1054  hypothetical protein  23.56 
 
 		 991 aa  46.2  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0106  surface layer domain protein  53.33 
 
 		 444 aa  45.8  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000000230469  hitchhiker  0.00000000000214595 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4248  hypothetical protein  22.3 
 
 		 824 aa  45.4  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>