17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2636 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001637  EcDH1_0723  conserved hypothetical protein  39.06 
 
 
1520 aa  961    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02842  predicted inner membrane lipoprotein  38.36 
 
 
1517 aa  944    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00831057  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02792  hypothetical protein  38.36 
 
 
1517 aa  944    Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00846982  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0370  putative lipoprotein  37.65 
 
 
1443 aa  825    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3142  hypothetical protein  38.49 
 
 
1503 aa  950    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3432  hypothetical protein  38.76 
 
 
1506 aa  931    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2636  inner membrane lipoprotein  100 
 
 
1426 aa  2968    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.98205  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3251  hypothetical protein  38.49 
 
 
1518 aa  949    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1514  hypothetical protein  32.99 
 
 
660 aa  86.7  0.000000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.767692  hitchhiker  0.00000248553 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2078  fam139a; Protein FAM139A  25.42 
 
 
785 aa  80.1  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5203  hypothetical protein  23.7 
 
 
1067 aa  50.1  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.226365  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5171  wall-associated protein  25.4 
 
 
1277 aa  49.3  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2851e-37 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4770  wall-associated protein  22.6 
 
 
1273 aa  47.4  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000568341  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2532  hypothetical protein  23.35 
 
 
770 aa  47.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5623  fibronectin type III domain-containing protein  24.26 
 
 
749 aa  45.8  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.198115  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0040  wall-associated protein  24.19 
 
 
1476 aa  45.8  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.218443  hitchhiker  4.78109e-16 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2335  S-layer domain-containing protein  23.6 
 
 
869 aa  45.1  0.01  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0205694  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>