24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1386 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1386  hypothetical protein  100 
 
 		 529 aa  1090    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0257961  normal  0.650962 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3150  hypothetical protein  29.82 
 
 		 541 aa  171  2e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30460  hypothetical protein  29.96 
 
 		 754 aa  162  9e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0534112  normal  0.427386 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3575  hypothetical protein  26.71 
 
 		 536 aa  135  1.9999999999999998e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.196145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0510  hypothetical protein  27.27 
 
 		 536 aa  134  3.9999999999999996e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3155  glycosyltransferase 36  25 
 
 		 2870 aa  64.7  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1872  hypothetical protein  25.17 
 
 		 461 aa  61.2  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4026  glycosyltransferase 36  29.82 
 
 		 2748 aa  61.2  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.301518 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3093  glycosyltransferase 36  20.4 
 
 		 2731 aa  54.7  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1306  cyclic beta 1-2 glucan synthase  23.08 
 
 		 2884 aa  54.3  0.000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0108  cyclic beta 1-2 glucan synthetase  25 
 
 		 2864 aa  53.5  0.000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.602283  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4370  beta (1-->2) glucan biosynthesis protein  23.19 
 
 		 2833 aa  52.8  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0111  cyclic beta 1-2 glucan synthetase  24.49 
 
 		 2732 aa  52.4  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.888748  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0124  glycosyltransferase 36  25 
 
 		 2888 aa  52.4  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4173  glycosyltransferase 36  24.68 
 
 		 2839 aa  51.6  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0791  putative carbohydrate binding  25.42 
 
 		 2716 aa  50.4  0.00008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3845  glycosyltransferase 36  24.35 
 
 		 2839 aa  49.7  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3184  glycosyltransferase 36  27.57 
 
 		 2748 aa  50.1  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5841  putative carbohydrate binding  26.14 
 
 		 2730 aa  49.7  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1221  glycosyltransferase 36  21.45 
 
 		 2922 aa  48.1  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3296  glycosyltransferase 36  27.78 
 
 		 2747 aa  47.4  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1569  hypothetical protein  28.66 
 
 		 939 aa  46.2  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.150987 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3379  putative carbohydrate binding  28.11 
 
 		 2758 aa  45.8  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1870  glycosyltransferase 36  22.38 
 
 		 2864 aa  44.3  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>