103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4173 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR0111  cyclic beta 1-2 glucan synthetase  54.86 
 
 
2732 aa  3010    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.888748  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2046  putative carbohydrate binding:glycosyltransferase 36:glycosyltransferase 36 associated  36.63 
 
 
2932 aa  1689    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1304  cyclic beta 1-2 glucan synthetase  37.29 
 
 
2859 aa  1701    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3613  glycosyltransferase  44.47 
 
 
2769 aa  2233    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1183  glycosyltransferase 36  37.8 
 
 
2905 aa  1767    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3184  glycosyltransferase 36  41.17 
 
 
2748 aa  1100    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3667  cyclic beta 1-2 glucan synthetase  37.06 
 
 
2793 aa  1650    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1517  putative cyclic beta 1-2 glucan synthetase  43.61 
 
 
2901 aa  2223    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.302513  normal  0.43916 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1346  putative cyclic beta 1-2 glucan synthetase  44.2 
 
 
2868 aa  2231    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2531  glycosyltransferase 36  44.65 
 
 
2845 aa  2273    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5267  glycosyltransferase 36  42.95 
 
 
2868 aa  2159    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5592  glycosyltransferase 36  43.23 
 
 
2831 aa  2159    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4755  putative carbohydrate binding  43.99 
 
 
2779 aa  2286    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3093  glycosyltransferase 36  38.98 
 
 
2731 aa  1048    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1306  cyclic beta 1-2 glucan synthase  48.25 
 
 
2884 aa  2778    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1221  glycosyltransferase 36  36.08 
 
 
2922 aa  1811    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4245  glycosyltransferase 36  35.87 
 
 
2860 aa  1707    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.342744 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3489  hypothetical protein  44.49 
 
 
2761 aa  2174    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.731415 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3139  glycosyltransferase 36  45.26 
 
 
2842 aa  2322    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4340  glycosyltransferase 36  35.62 
 
 
3021 aa  1629    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0108  cyclic beta 1-2 glucan synthetase  54.38 
 
 
2864 aa  3086    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.602283  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2737  glycosyltransferase 36  37.95 
 
 
2864 aa  1783    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2993  glycosyltransferase 36  39.79 
 
 
1303 aa  898    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3155  glycosyltransferase 36  69.05 
 
 
2870 aa  4091    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0124  glycosyltransferase 36  53.61 
 
 
2888 aa  3070    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4026  glycosyltransferase 36  41.46 
 
 
2748 aa  1155    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.301518 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1870  glycosyltransferase 36  37.96 
 
 
2864 aa  1801    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3285  glycosyltransferase 36  36.59 
 
 
2880 aa  1781    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0980  putative carbohydrate binding  36.94 
 
 
2887 aa  1902    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2133  glycosyltransferase 36  37.9 
 
 
2881 aa  1768    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.150749 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1711  glycosyltransferase 36  43.56 
 
 
2874 aa  2133    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.122848  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3888  glycosyltransferase 36  43.18 
 
 
2875 aa  2172    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3296  glycosyltransferase 36  41.89 
 
 
2747 aa  1150    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3845  glycosyltransferase 36  96.16 
 
 
2839 aa  5527    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0623  glycosyltransferase 36  38.93 
 
 
2929 aa  1147    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3379  putative carbohydrate binding  41.12 
 
 
2758 aa  1115    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2577  putative carbohydrate binding  35.89 
 
 
2823 aa  1731    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4370  beta (1-->2) glucan biosynthesis protein  68.26 
 
 
2833 aa  4073    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5841  putative carbohydrate binding  39.99 
 
 
2730 aa  1051    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4173  glycosyltransferase 36  100 
 
 
2839 aa  5831    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3706  glycosyltransferase 36  33.87 
 
 
2453 aa  1142    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2188  glycosyltransferase 36  35.8 
 
 
2916 aa  1706    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0791  putative carbohydrate binding  37.35 
 
 
2716 aa  976    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1675  glycosyltransferase 36  39.54 
 
 
2786 aa  1150    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3648  glycosyltransferase 36 associated  45.45 
 
 
624 aa  511  1e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0953  glycosyltransferase 36  33.12 
 
 
786 aa  474  1.0000000000000001e-131  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.862285  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0091  glycosyltransferase 36  37.61 
 
 
849 aa  472  1.0000000000000001e-131  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00140222  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0459  glycosyltransferase 36  29.62 
 
 
790 aa  328  1e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1439  glycosyltransferase 36  29.87 
 
 
784 aa  322  9e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0951  glycosyltransferase 36  28.8 
 
 
813 aa  307  2.0000000000000002e-81  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0220582  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0968  glycosyltransferase 36  28.8 
 
 
813 aa  307  2.0000000000000002e-81  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.547767  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1363  glycosyltransferase 36  28.86 
 
 
815 aa  302  6e-80  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19760  glycosyltransferase 36  27.32 
 
 
784 aa  293  5.0000000000000004e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1364  glycosyltransferase 36  30.24 
 
 
785 aa  293  5.0000000000000004e-77  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19750  glycosyltransferase 36  27.34 
 
 
819 aa  292  6e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0275  cellobiose phosphorylase  26.37 
 
 
811 aa  290  2.9999999999999996e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3274  glycosyltransferase 36  28.54 
 
 
822 aa  288  9e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0460  glycosyltransferase 36  27.07 
 
 
811 aa  275  9e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1318  cellobiose phosphorylase  26.72 
 
 
811 aa  274  2e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0462617  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1053  glycosyltransferase 36  28.42 
 
 
829 aa  267  2e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.753195  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0649  glycosyl transferase 36  27.14 
 
 
811 aa  265  6.999999999999999e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0225062  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002578  chitobiose phosphorylase  26.35 
 
 
802 aa  261  1e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03431  hypothetical protein  26.18 
 
 
802 aa  259  6e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0148  glycosyltransferase 36  26.54 
 
 
822 aa  258  8e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0233043 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2109  glycosyltransferase 36  25.41 
 
 
811 aa  258  2.0000000000000002e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0141  cellulose degradation product phosphorylase  26.01 
 
 
801 aa  254  2e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1745  glycosyltransferase 36  25.9 
 
 
815 aa  249  4e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.414629  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3412  glycosyltransferase 36  27.09 
 
 
824 aa  249  8e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1929  glycosyltransferase 36  26.09 
 
 
797 aa  246  5e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2312  glycosyltransferase 36  25.62 
 
 
797 aa  244  1e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.26995 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0430  glycosyltransferase 36  24.6 
 
 
831 aa  242  8e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.948087  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2584  chitobiose phosphorylase (glycosyl transferase)  25.42 
 
 
762 aa  242  8e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3854  glycosyltransferase 36  25 
 
 
797 aa  239  5.0000000000000005e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2616  glycosyltransferase 36  26.13 
 
 
827 aa  234  1e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.294292  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2354  glycosyltransferase 36  25.41 
 
 
796 aa  228  1e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0906  NdvB protein  26.17 
 
 
788 aa  225  9.999999999999999e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000016442 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2310  glycosyltransferase 36  26.59 
 
 
794 aa  225  9.999999999999999e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.587423  normal  0.417099 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0648  glycosyl transferase 36  25.12 
 
 
809 aa  223  6e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000072507  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1744  glycosyltransferase 36  26.16 
 
 
823 aa  209  7e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0737514  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02749  NdvB protein  26.95 
 
 
801 aa  205  8e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3696  cyclic beta 1-2 glucan synthetase domain-containing protein  25.82 
 
 
802 aa  197  2e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2989  glycosyltransferase 36  20.77 
 
 
984 aa  72.4  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.684465  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30460  hypothetical protein  26.34 
 
 
754 aa  67  0.000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0534112  normal  0.427386 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3150  hypothetical protein  26.47 
 
 
541 aa  65.1  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0510  hypothetical protein  25.26 
 
 
536 aa  65.5  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5665  hypothetical protein  23.83 
 
 
1100 aa  63.9  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.24035  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1586  hypothetical protein  22.72 
 
 
1136 aa  62.4  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.707632  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3575  hypothetical protein  27.46 
 
 
536 aa  61.6  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.196145  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0857  cellobiose phosphorylase-like protein  22.51 
 
 
900 aa  61.2  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06430  cellobiose phosphorylase  23.51 
 
 
1145 aa  56.6  0.000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6606  hypothetical protein  23.43 
 
 
1094 aa  55.1  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00814353 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3155  glucosyltransferase MdoH  24.06 
 
 
852 aa  53.9  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0101464 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04170  Cellobiose phosphorylase  21.79 
 
 
904 aa  53.1  0.00007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2909  glucosyltransferase MdoH  23.83 
 
 
862 aa  52.8  0.00009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.136414  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0694  hypothetical protein  20.81 
 
 
1113 aa  52.4  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.514428  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1386  hypothetical protein  24.68 
 
 
529 aa  52  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0257961  normal  0.650962 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2806  glucosyltransferase MdoH  23.89 
 
 
860 aa  51.6  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0431  glycoside hydrolase 15-related protein  24.27 
 
 
650 aa  51.6  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0395513  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0524  hypothetical protein  24.1 
 
 
459 aa  51.2  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00628478  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0585  hypothetical protein  24.1 
 
 
459 aa  51.2  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0392402  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>