31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1872 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1872  hypothetical protein  100 
 
 		 461 aa  946    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2537  hypothetical protein  71.74 
 
 		 51 aa  78.2  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.036965  hitchhiker  0.00399105 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0791  putative carbohydrate binding  26.4 
 
 		 2716 aa  70.5  0.00000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3150  hypothetical protein  26.17 
 
 		 541 aa  68.2  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30460  hypothetical protein  25.69 
 
 		 754 aa  65.5  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0534112  normal  0.427386 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3575  hypothetical protein  24.5 
 
 		 536 aa  64.3  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.196145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4026  glycosyltransferase 36  25.63 
 
 		 2748 aa  61.6  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.301518 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1386  hypothetical protein  25.09 
 
 		 529 aa  60.8  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0257961  normal  0.650962 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3296  glycosyltransferase 36  25 
 
 		 2747 aa  59.3  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5841  putative carbohydrate binding  25.24 
 
 		 2730 aa  57.8  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0980  putative carbohydrate binding  23.87 
 
 		 2887 aa  55.1  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2046  putative carbohydrate binding:glycosyltransferase 36:glycosyltransferase 36 associated  25.69 
 
 		 2932 aa  54.3  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0510  hypothetical protein  25.1 
 
 		 536 aa  53.1  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3093  glycosyltransferase 36  25.07 
 
 		 2731 aa  53.5  0.000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2188  glycosyltransferase 36  23.72 
 
 		 2916 aa  50.4  0.00007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1183  glycosyltransferase 36  27.2 
 
 		 2905 aa  49.7  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1346  putative cyclic beta 1-2 glucan synthetase  26.12 
 
 		 2868 aa  48.5  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3667  cyclic beta 1-2 glucan synthetase  24.49 
 
 		 2793 aa  48.9  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3184  glycosyltransferase 36  24.6 
 
 		 2748 aa  48.1  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3155  glycosyltransferase 36  25.35 
 
 		 2870 aa  46.6  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1304  cyclic beta 1-2 glucan synthetase  27.23 
 
 		 2859 aa  46.6  0.0009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3379  putative carbohydrate binding  25.24 
 
 		 2758 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3285  glycosyltransferase 36  28.51 
 
 		 2880 aa  45.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1306  cyclic beta 1-2 glucan synthase  23.45 
 
 		 2884 aa  45.8  0.002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1675  glycosyltransferase 36  22.9 
 
 		 2786 aa  45.1  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3139  glycosyltransferase 36  25.45 
 
 		 2842 aa  45.1  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1711  glycosyltransferase 36  30.07 
 
 		 2874 aa  44.3  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.122848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5267  glycosyltransferase 36  30.07 
 
 		 2868 aa  44.3  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5592  glycosyltransferase 36  30.07 
 
 		 2831 aa  44.3  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3706  glycosyltransferase 36  27.61 
 
 		 2453 aa  43.9  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1870  glycosyltransferase 36  26.59 
 
 		 2864 aa  43.5  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>