100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3667 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1870  glycosyltransferase 36  37.56 
 
 		 2864 aa  1615    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1221  glycosyltransferase 36  36.84 
 
 		 2922 aa  1080    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4173  glycosyltransferase 36  36.43 
 
 		 2839 aa  1610    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3489  hypothetical protein  41.1 
 
 		 2761 aa  1721    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.731415 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5841  putative carbohydrate binding  63.75 
 
 		 2730 aa  3342    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3139  glycosyltransferase 36  39.88 
 
 		 2842 aa  1728    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4340  glycosyltransferase 36  38.56 
 
 		 3021 aa  985    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0108  cyclic beta 1-2 glucan synthetase  38.83 
 
 		 2864 aa  1094    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.602283  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2737  glycosyltransferase 36  37.61 
 
 		 2864 aa  1625    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2993  glycosyltransferase 36  36.15 
 
 		 1303 aa  752    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3155  glycosyltransferase 36  36.12 
 
 		 2870 aa  1645    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0124  glycosyltransferase 36  39.35 
 
 		 2888 aa  1109    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4026  glycosyltransferase 36  41.03 
 
 		 2748 aa  1056    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.301518 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4245  glycosyltransferase 36  36.74 
 
 		 2860 aa  989    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.342744 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4370  beta (1-->2) glucan biosynthesis protein  36.94 
 
 		 2833 aa  1659    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3285  glycosyltransferase 36  37.31 
 
 		 2880 aa  1016    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2577  putative carbohydrate binding  32.45 
 
 		 2823 aa  1504    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3379  putative carbohydrate binding  41.03 
 
 		 2758 aa  1030    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0623  glycosyltransferase 36  38.25 
 
 		 2929 aa  1031    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0980  putative carbohydrate binding  37.27 
 
 		 2887 aa  1070    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2133  glycosyltransferase 36  39.4 
 
 		 2881 aa  1018    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.150749 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1711  glycosyltransferase 36  40.25 
 
 		 2874 aa  1712    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.122848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3888  glycosyltransferase 36  40.95 
 
 		 2875 aa  1073    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3845  glycosyltransferase 36  35.72 
 
 		 2839 aa  1606    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3296  glycosyltransferase 36  37.9 
 
 		 2747 aa  1470    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3667  cyclic beta 1-2 glucan synthetase  100 
 
 		 2793 aa  5657    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1304  cyclic beta 1-2 glucan synthetase  39.67 
 
 		 2859 aa  1040    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3613  glycosyltransferase  40.22 
 
 		 2769 aa  1743    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1183  glycosyltransferase 36  36.94 
 
 		 2905 aa  1585    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3184  glycosyltransferase 36  40.97 
 
 		 2748 aa  1020    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1675  glycosyltransferase 36  34.84 
 
 		 2786 aa  1454    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0791  putative carbohydrate binding  35.26 
 
 		 2716 aa  1400    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2188  glycosyltransferase 36  38.88 
 
 		 2916 aa  1042    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1306  cyclic beta 1-2 glucan synthase  36.63 
 
 		 2884 aa  1019    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2046  putative carbohydrate binding:glycosyltransferase 36:glycosyltransferase 36 associated  36.82 
 
 		 2932 aa  1565    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1517  putative cyclic beta 1-2 glucan synthetase  39.58 
 
 		 2901 aa  1779    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.302513  normal  0.43916 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2531  glycosyltransferase 36  39.48 
 
 		 2845 aa  1741    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3093  glycosyltransferase 36  63.13 
 
 		 2731 aa  3414    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4755  putative carbohydrate binding  37.3 
 
 		 2779 aa  1502    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5267  glycosyltransferase 36  40.16 
 
 		 2868 aa  1745    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0111  cyclic beta 1-2 glucan synthetase  39.13 
 
 		 2732 aa  1101    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.888748  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1346  putative cyclic beta 1-2 glucan synthetase  39.74 
 
 		 2868 aa  1783    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5592  glycosyltransferase 36  40.04 
 
 		 2831 aa  1722    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3706  glycosyltransferase 36  34.33 
 
 		 2453 aa  520  1.0000000000000001e-145  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3648  glycosyltransferase 36 associated  46.34 
 
 		 624 aa  510  9.999999999999999e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0953  glycosyltransferase 36  32.94 
 
 		 786 aa  471  9.999999999999999e-131  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.862285  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0091  glycosyltransferase 36  36.93 
 
 		 849 aa  450  1.0000000000000001e-124  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00140222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19760  glycosyltransferase 36  25.97 
 
 		 784 aa  274  1e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1364  glycosyltransferase 36  28.41 
 
 		 785 aa  265  1e-68  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3274  glycosyltransferase 36  27.19 
 
 		 822 aa  264  2e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19750  glycosyltransferase 36  26.47 
 
 		 819 aa  259  6e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0968  glycosyltransferase 36  26.75 
 
 		 813 aa  256  5.000000000000001e-66  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.547767  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0951  glycosyltransferase 36  26.75 
 
 		 813 aa  256  5.000000000000001e-66  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0220582  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2616  glycosyltransferase 36  27.01 
 
 		 827 aa  251  1e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.294292  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0459  glycosyltransferase 36  26.84 
 
 		 790 aa  250  3e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1318  cellobiose phosphorylase  25.88 
 
 		 811 aa  249  4e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0462617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1363  glycosyltransferase 36  26.54 
 
 		 815 aa  249  6.999999999999999e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0275  cellobiose phosphorylase  26.12 
 
 		 811 aa  248  9.999999999999999e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0148  glycosyltransferase 36  27.42 
 
 		 822 aa  247  1.9999999999999999e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0233043 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002578  chitobiose phosphorylase  25.28 
 
 		 802 aa  240  3e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03431  hypothetical protein  25.41 
 
 		 802 aa  239  6e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0460  glycosyltransferase 36  25.81 
 
 		 811 aa  239  7e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2109  glycosyltransferase 36  25.97 
 
 		 811 aa  237  3e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1745  glycosyltransferase 36  26.88 
 
 		 815 aa  234  2e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.414629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2312  glycosyltransferase 36  25.96 
 
 		 797 aa  230  2e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26995 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0141  cellulose degradation product phosphorylase  24.8 
 
 		 801 aa  228  1e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1439  glycosyltransferase 36  24.01 
 
 		 784 aa  224  1.9999999999999999e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0430  glycosyltransferase 36  24.85 
 
 		 831 aa  223  3e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.948087  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0649  glycosyl transferase 36  25.19 
 
 		 811 aa  222  7.999999999999999e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0225062  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3854  glycosyltransferase 36  24.07 
 
 		 797 aa  218  9e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2310  glycosyltransferase 36  24.9 
 
 		 794 aa  213  4e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.587423  normal  0.417099 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2584  chitobiose phosphorylase (glycosyl transferase)  24.25 
 
 		 762 aa  213  5e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1744  glycosyltransferase 36  25.49 
 
 		 823 aa  209  4e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0737514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1053  glycosyltransferase 36  25.74 
 
 		 829 aa  208  1e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.753195  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1929  glycosyltransferase 36  22.77 
 
 		 797 aa  206  4e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2354  glycosyltransferase 36  23.25 
 
 		 796 aa  200  3e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0648  glycosyl transferase 36  22.78 
 
 		 809 aa  191  2e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000072507  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02749  NdvB protein  26.41 
 
 		 801 aa  180  3e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3412  glycosyltransferase 36  22.56 
 
 		 824 aa  178  9.999999999999999e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0906  NdvB protein  22.96 
 
 		 788 aa  172  6e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000016442 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3696  cyclic beta 1-2 glucan synthetase domain-containing protein  24.39 
 
 		 802 aa  153  5e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3150  hypothetical protein  26.3 
 
 		 541 aa  115  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0510  hypothetical protein  27.12 
 
 		 536 aa  109  9e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3575  hypothetical protein  27.76 
 
 		 536 aa  107  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.196145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30460  hypothetical protein  24.61 
 
 		 754 aa  103  5e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0534112  normal  0.427386 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2989  glycosyltransferase 36  22.96 
 
 		 984 aa  90.1  5e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.684465  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5665  hypothetical protein  24.12 
 
 		 1100 aa  66.2  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.24035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0216  exodeoxyribonuclease III (xth)  56.06 
 
 		 349 aa  65.9  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1586  hypothetical protein  25.21 
 
 		 1136 aa  63.5  0.00000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.707632  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6606  hypothetical protein  24.39 
 
 		 1094 aa  61.2  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00814353 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4656  glutamate-ammonia-ligase adenylyltransferase  65.91 
 
 		 1010 aa  53.9  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1465  amidase  71.43 
 
 		 535 aa  51.6  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.741427 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4242  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  83.33 
 
 		 331 aa  49.7  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1872  hypothetical protein  24.49 
 
 		 461 aa  48.9  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2196  molybdopterin synthase subunit MoaE  77.42 
 
 		 188 aa  48.5  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00121089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0694  hypothetical protein  20.89 
 
 		 1113 aa  48.5  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.514428  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2505  DNA ligase, NAD-dependent  71.43 
 
 		 768 aa  47.8  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000421321 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0857  cellobiose phosphorylase-like protein  20.92 
 
 		 900 aa  47  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3576  hypothetical protein  31.21 
 
 		 1195 aa  46.2  0.009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.61557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04170  Cellobiose phosphorylase  21.38 
 
 		 904 aa  46.2  0.01  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>