60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3575 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_3575  hypothetical protein  100 
 
 
536 aa  1090    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.196145  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3150  hypothetical protein  57.2 
 
 
541 aa  595  1e-169  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0510  hypothetical protein  58.97 
 
 
536 aa  552  1e-156  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30460  hypothetical protein  54.77 
 
 
754 aa  511  1e-144  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0534112  normal  0.427386 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1386  hypothetical protein  26.71 
 
 
529 aa  135  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0257961  normal  0.650962 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3093  glycosyltransferase 36  26.76 
 
 
2731 aa  123  7e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4026  glycosyltransferase 36  28.63 
 
 
2748 aa  120  6e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.301518 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3296  glycosyltransferase 36  28.9 
 
 
2747 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5841  putative carbohydrate binding  28.95 
 
 
2730 aa  114  4.0000000000000004e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3379  putative carbohydrate binding  28.54 
 
 
2758 aa  111  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1675  glycosyltransferase 36  24.81 
 
 
2786 aa  110  7.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0791  putative carbohydrate binding  26.54 
 
 
2716 aa  109  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3184  glycosyltransferase 36  27.95 
 
 
2748 aa  109  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3667  cyclic beta 1-2 glucan synthetase  26.94 
 
 
2793 aa  103  5e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3613  glycosyltransferase  37.2 
 
 
2769 aa  82.4  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2737  glycosyltransferase 36  27.04 
 
 
2864 aa  77.8  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1870  glycosyltransferase 36  26.94 
 
 
2864 aa  77  0.0000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0980  putative carbohydrate binding  35.25 
 
 
2887 aa  74.3  0.000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3489  hypothetical protein  39.26 
 
 
2761 aa  73.9  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.731415 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1221  glycosyltransferase 36  27.74 
 
 
2922 aa  73.9  0.000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0124  glycosyltransferase 36  33.52 
 
 
2888 aa  73.6  0.000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0111  cyclic beta 1-2 glucan synthetase  27.18 
 
 
2732 aa  72  0.00000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.888748  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1306  cyclic beta 1-2 glucan synthase  34.06 
 
 
2884 aa  70.5  0.00000000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2577  putative carbohydrate binding  25.43 
 
 
2823 aa  70.5  0.00000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0108  cyclic beta 1-2 glucan synthetase  26.85 
 
 
2864 aa  70.5  0.00000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.602283  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4370  beta (1-->2) glucan biosynthesis protein  26.43 
 
 
2833 aa  68.6  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3155  glycosyltransferase 36  26.79 
 
 
2870 aa  68.2  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4755  putative carbohydrate binding  34.68 
 
 
2779 aa  68.6  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2188  glycosyltransferase 36  36.62 
 
 
2916 aa  67.8  0.0000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1304  cyclic beta 1-2 glucan synthetase  26.02 
 
 
2859 aa  67.8  0.0000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3285  glycosyltransferase 36  30.86 
 
 
2880 aa  68.2  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4340  glycosyltransferase 36  27.97 
 
 
3021 aa  67  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5592  glycosyltransferase 36  33.73 
 
 
2831 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1711  glycosyltransferase 36  35.12 
 
 
2874 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.122848  normal 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4245  glycosyltransferase 36  33.1 
 
 
2860 aa  66.6  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.342744 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5267  glycosyltransferase 36  33.73 
 
 
2868 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1517  putative cyclic beta 1-2 glucan synthetase  36.03 
 
 
2901 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.302513  normal  0.43916 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3706  glycosyltransferase 36  25.19 
 
 
2453 aa  64.7  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1072  hypothetical protein  24.17 
 
 
459 aa  64.3  0.000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1872  hypothetical protein  24.5 
 
 
461 aa  64.3  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3888  glycosyltransferase 36  34.94 
 
 
2875 aa  63.9  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1183  glycosyltransferase 36  34.27 
 
 
2905 aa  63.2  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0524  hypothetical protein  24.17 
 
 
459 aa  63.2  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00628478  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0585  hypothetical protein  24.17 
 
 
459 aa  63.2  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0392402  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3845  glycosyltransferase 36  34.35 
 
 
2839 aa  62  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0623  glycosyltransferase 36  28.35 
 
 
2929 aa  61.6  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4173  glycosyltransferase 36  34.35 
 
 
2839 aa  62  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3139  glycosyltransferase 36  31.93 
 
 
2842 aa  58.9  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0406  hypothetical protein  43.24 
 
 
420 aa  58.5  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1346  putative cyclic beta 1-2 glucan synthetase  31.62 
 
 
2868 aa  57  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3523  hypothetical protein  27.89 
 
 
457 aa  57  0.0000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.91954  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2531  glycosyltransferase 36  24.83 
 
 
2845 aa  57  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2046  putative carbohydrate binding:glycosyltransferase 36:glycosyltransferase 36 associated  25 
 
 
2932 aa  56.6  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2133  glycosyltransferase 36  26.54 
 
 
2881 aa  55.5  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.150749 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4453  hypothetical protein  24.04 
 
 
556 aa  52.4  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000395035  normal  0.300253 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3301  hypothetical protein  39.13 
 
 
424 aa  49.7  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0855983  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1126  hypothetical protein  37.68 
 
 
460 aa  48.9  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4068  hypothetical protein  31.29 
 
 
929 aa  48.1  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.83009  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5524  hypothetical protein  38.46 
 
 
432 aa  47.4  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.86603  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4452  hypothetical protein  32.93 
 
 
459 aa  45.1  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000124037  normal  0.847922 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>