99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1304 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012792  Vapar_5841  putative carbohydrate binding  40.23 
 
 
2730 aa  1018    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4245  glycosyltransferase 36  47.66 
 
 
2860 aa  2544    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.342744 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3489  hypothetical protein  44.05 
 
 
2761 aa  1985    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.731415 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3139  glycosyltransferase 36  43.98 
 
 
2842 aa  2121    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4340  glycosyltransferase 36  45.91 
 
 
3021 aa  1355    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0108  cyclic beta 1-2 glucan synthetase  38.94 
 
 
2864 aa  1867    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.602283  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2737  glycosyltransferase 36  46.17 
 
 
2864 aa  2369    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2993  glycosyltransferase 36  43.54 
 
 
1303 aa  1085    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3155  glycosyltransferase 36  38.97 
 
 
2870 aa  1813    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0124  glycosyltransferase 36  38.97 
 
 
2888 aa  1869    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4026  glycosyltransferase 36  50.25 
 
 
2748 aa  1477    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.301518 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4173  glycosyltransferase 36  36.9 
 
 
2839 aa  1736    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1870  glycosyltransferase 36  45.39 
 
 
2864 aa  2340    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1675  glycosyltransferase 36  43.65 
 
 
2786 aa  1331    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3285  glycosyltransferase 36  49.5 
 
 
2880 aa  2672    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4370  beta (1-->2) glucan biosynthesis protein  38.72 
 
 
2833 aa  1815    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2577  putative carbohydrate binding  38.92 
 
 
2823 aa  2078    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0980  putative carbohydrate binding  40.81 
 
 
2887 aa  2264    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3379  putative carbohydrate binding  49.35 
 
 
2758 aa  1409    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2133  glycosyltransferase 36  52.14 
 
 
2881 aa  2709    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.150749 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1711  glycosyltransferase 36  43.38 
 
 
2874 aa  2020    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.122848  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3888  glycosyltransferase 36  43.46 
 
 
2875 aa  2073    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0623  glycosyltransferase 36  52.23 
 
 
2929 aa  2952    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3845  glycosyltransferase 36  36.67 
 
 
2839 aa  1735    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3296  glycosyltransferase 36  48.48 
 
 
2747 aa  1422    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5267  glycosyltransferase 36  43.65 
 
 
2868 aa  2053    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0791  putative carbohydrate binding  40.04 
 
 
2716 aa  1063    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3184  glycosyltransferase 36  49.23 
 
 
2748 aa  1397    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2188  glycosyltransferase 36  54.6 
 
 
2916 aa  3039    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1183  glycosyltransferase 36  52.36 
 
 
2905 aa  2900    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3667  cyclic beta 1-2 glucan synthetase  37.26 
 
 
2793 aa  1545    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3706  glycosyltransferase 36  41.32 
 
 
2453 aa  1533    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1517  putative cyclic beta 1-2 glucan synthetase  44.64 
 
 
2901 aa  2152    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.302513  normal  0.43916 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3613  glycosyltransferase  48.72 
 
 
2769 aa  1356    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1346  putative cyclic beta 1-2 glucan synthetase  43.53 
 
 
2868 aa  2125    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2531  glycosyltransferase 36  44 
 
 
2845 aa  2160    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1304  cyclic beta 1-2 glucan synthetase  100 
 
 
2859 aa  5791    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5592  glycosyltransferase 36  43.8 
 
 
2831 aa  2046    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4755  putative carbohydrate binding  38.68 
 
 
2779 aa  1662    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2046  putative carbohydrate binding:glycosyltransferase 36:glycosyltransferase 36 associated  55.49 
 
 
2932 aa  3053    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3093  glycosyltransferase 36  41.12 
 
 
2731 aa  1067    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1306  cyclic beta 1-2 glucan synthase  36.83 
 
 
2884 aa  1817    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0111  cyclic beta 1-2 glucan synthetase  38.99 
 
 
2732 aa  1821    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.888748  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1221  glycosyltransferase 36  40.22 
 
 
2922 aa  2220    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3648  glycosyltransferase 36 associated  49.24 
 
 
624 aa  568  1e-160  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0091  glycosyltransferase 36  39.64 
 
 
849 aa  555  1e-156  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00140222  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0953  glycosyltransferase 36  36.5 
 
 
786 aa  533  1e-149  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.862285  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1364  glycosyltransferase 36  31.24 
 
 
785 aa  348  8e-94  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19760  glycosyltransferase 36  29.2 
 
 
784 aa  343  2e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0459  glycosyltransferase 36  29.33 
 
 
790 aa  339  3.9999999999999995e-91  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1439  glycosyltransferase 36  28.08 
 
 
784 aa  337  2e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19750  glycosyltransferase 36  28.49 
 
 
819 aa  334  2e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1363  glycosyltransferase 36  29.31 
 
 
815 aa  330  2.0000000000000001e-88  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3274  glycosyltransferase 36  29.46 
 
 
822 aa  324  9.999999999999999e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0275  cellobiose phosphorylase  27.7 
 
 
811 aa  319  5e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1745  glycosyltransferase 36  29.1 
 
 
815 aa  318  9.999999999999999e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.414629  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0968  glycosyltransferase 36  28.01 
 
 
813 aa  317  1.9999999999999998e-84  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.547767  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0951  glycosyltransferase 36  28.01 
 
 
813 aa  317  1.9999999999999998e-84  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0220582  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0460  glycosyltransferase 36  28.81 
 
 
811 aa  311  8e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0148  glycosyltransferase 36  28.72 
 
 
822 aa  302  6e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0233043 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0430  glycosyltransferase 36  26.87 
 
 
831 aa  293  2e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.948087  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002578  chitobiose phosphorylase  26.1 
 
 
802 aa  294  2e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03431  hypothetical protein  26.55 
 
 
802 aa  293  3e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0649  glycosyl transferase 36  27.39 
 
 
811 aa  293  5.0000000000000004e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0225062  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1053  glycosyltransferase 36  27.84 
 
 
829 aa  289  5e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.753195  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0141  cellulose degradation product phosphorylase  26.34 
 
 
801 aa  288  8e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1318  cellobiose phosphorylase  27.62 
 
 
811 aa  288  1.0000000000000001e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0462617  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2310  glycosyltransferase 36  27.98 
 
 
794 aa  285  1e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.587423  normal  0.417099 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2584  chitobiose phosphorylase (glycosyl transferase)  26.81 
 
 
762 aa  283  2e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0648  glycosyl transferase 36  26.77 
 
 
809 aa  284  2e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000072507  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3412  glycosyltransferase 36  26.42 
 
 
824 aa  279  7e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1929  glycosyltransferase 36  26.08 
 
 
797 aa  278  2.0000000000000002e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2354  glycosyltransferase 36  26.35 
 
 
796 aa  272  8.999999999999999e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2109  glycosyltransferase 36  26.69 
 
 
811 aa  271  2e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3854  glycosyltransferase 36  25.06 
 
 
797 aa  269  8e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2616  glycosyltransferase 36  27.98 
 
 
827 aa  268  1e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.294292  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2312  glycosyltransferase 36  26.43 
 
 
797 aa  257  2.0000000000000002e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.26995 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1744  glycosyltransferase 36  27.98 
 
 
823 aa  256  6e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0737514  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02749  NdvB protein  27.65 
 
 
801 aa  211  2e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0906  NdvB protein  24.06 
 
 
788 aa  199  8.000000000000001e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000016442 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3696  cyclic beta 1-2 glucan synthetase domain-containing protein  23.68 
 
 
802 aa  144  3.9999999999999997e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2989  glycosyltransferase 36  20.27 
 
 
984 aa  82.4  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.684465  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5665  hypothetical protein  22.76 
 
 
1100 aa  73.9  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.24035  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4220  hypothetical protein  25.69 
 
 
1169 aa  72.4  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.117681  normal  0.559819 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3150  hypothetical protein  26.19 
 
 
541 aa  72.4  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0857  cellobiose phosphorylase-like protein  19.6 
 
 
900 aa  68.9  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3575  hypothetical protein  26.02 
 
 
536 aa  67.8  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.196145  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6606  hypothetical protein  23.09 
 
 
1094 aa  64.7  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00814353 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2456  hypothetical protein  28.47 
 
 
1076 aa  63.2  0.00000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0510  hypothetical protein  23.67 
 
 
536 aa  61.2  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30460  hypothetical protein  35.77 
 
 
754 aa  60.8  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0534112  normal  0.427386 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06430  cellobiose phosphorylase  24.66 
 
 
1145 aa  58.9  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0694  hypothetical protein  23.55 
 
 
1113 aa  55.8  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.514428  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1072  hypothetical protein  26.13 
 
 
459 aa  50.8  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0524  hypothetical protein  25.44 
 
 
459 aa  47.8  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00628478  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0585  hypothetical protein  25.44 
 
 
459 aa  47.8  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0392402  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1586  hypothetical protein  25.05 
 
 
1136 aa  47.8  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.707632  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1872  hypothetical protein  25.77 
 
 
461 aa  46.6  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1730  glycosyl transferase family protein  26.51 
 
 
420 aa  46.2  0.01  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.461107  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>