100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3285 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_4173  glycosyltransferase 36  36.44 
 
 
2839 aa  1779    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3139  glycosyltransferase 36  42.91 
 
 
2842 aa  2094    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4340  glycosyltransferase 36  45.14 
 
 
3021 aa  1369    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0108  cyclic beta 1-2 glucan synthetase  38.21 
 
 
2864 aa  1866    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.602283  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2737  glycosyltransferase 36  42.93 
 
 
2864 aa  2180    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2993  glycosyltransferase 36  41.7 
 
 
1303 aa  1036    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3155  glycosyltransferase 36  37.05 
 
 
2870 aa  1802    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0124  glycosyltransferase 36  37.86 
 
 
2888 aa  1846    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4026  glycosyltransferase 36  46.11 
 
 
2748 aa  1394    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.301518 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1870  glycosyltransferase 36  42.53 
 
 
2864 aa  2164    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3706  glycosyltransferase 36  39.02 
 
 
2453 aa  1501    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3285  glycosyltransferase 36  100 
 
 
2880 aa  5952    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0111  cyclic beta 1-2 glucan synthetase  38.46 
 
 
2732 aa  1830    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.888748  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5841  putative carbohydrate binding  38.87 
 
 
2730 aa  1013    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4370  beta (1-->2) glucan biosynthesis protein  37.32 
 
 
2833 aa  1785    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0980  putative carbohydrate binding  39.16 
 
 
2887 aa  2174    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2133  glycosyltransferase 36  50.17 
 
 
2881 aa  2665    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.150749 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1711  glycosyltransferase 36  41.54 
 
 
2874 aa  1980    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.122848  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3888  glycosyltransferase 36  41.53 
 
 
2875 aa  2026    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2577  putative carbohydrate binding  37.57 
 
 
2823 aa  1976    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3379  putative carbohydrate binding  45.97 
 
 
2758 aa  1342    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0623  glycosyltransferase 36  48.57 
 
 
2929 aa  2711    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3845  glycosyltransferase 36  36.62 
 
 
2839 aa  1788    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3296  glycosyltransferase 36  45.36 
 
 
2747 aa  1357    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2046  putative carbohydrate binding:glycosyltransferase 36:glycosyltransferase 36 associated  51.44 
 
 
2932 aa  2850    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3184  glycosyltransferase 36  45.92 
 
 
2748 aa  1331    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1675  glycosyltransferase 36  41.85 
 
 
2786 aa  1291    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1183  glycosyltransferase 36  51.24 
 
 
2905 aa  2832    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3613  glycosyltransferase  45.82 
 
 
2769 aa  1353    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3667  cyclic beta 1-2 glucan synthetase  37.31 
 
 
2793 aa  1011    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1517  putative cyclic beta 1-2 glucan synthetase  42.3 
 
 
2901 aa  2087    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.302513  normal  0.43916 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1304  cyclic beta 1-2 glucan synthetase  49.47 
 
 
2859 aa  2635    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1346  putative cyclic beta 1-2 glucan synthetase  42.39 
 
 
2868 aa  2086    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2531  glycosyltransferase 36  42.65 
 
 
2845 aa  2125    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5267  glycosyltransferase 36  41.6 
 
 
2868 aa  2020    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0791  putative carbohydrate binding  39.12 
 
 
2716 aa  1068    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1306  cyclic beta 1-2 glucan synthase  36.4 
 
 
2884 aa  1766    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3489  hypothetical protein  46.9 
 
 
2761 aa  1357    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.731415 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4245  glycosyltransferase 36  61.81 
 
 
2860 aa  3661    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.342744 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2188  glycosyltransferase 36  51.21 
 
 
2916 aa  2848    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1221  glycosyltransferase 36  39.59 
 
 
2922 aa  2162    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3093  glycosyltransferase 36  38.95 
 
 
2731 aa  1023    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4755  putative carbohydrate binding  36.63 
 
 
2779 aa  1610    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5592  glycosyltransferase 36  41.93 
 
 
2831 aa  2014    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3648  glycosyltransferase 36 associated  49.34 
 
 
624 aa  591  1e-167  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0091  glycosyltransferase 36  39.26 
 
 
849 aa  549  1e-154  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00140222  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0953  glycosyltransferase 36  36 
 
 
786 aa  521  1.0000000000000001e-145  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.862285  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3274  glycosyltransferase 36  30 
 
 
822 aa  340  1.9999999999999998e-91  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1364  glycosyltransferase 36  29.78 
 
 
785 aa  330  2.0000000000000001e-88  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0951  glycosyltransferase 36  28.08 
 
 
813 aa  324  1.9999999999999998e-86  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0220582  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0968  glycosyltransferase 36  28.08 
 
 
813 aa  324  1.9999999999999998e-86  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.547767  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0275  cellobiose phosphorylase  28.93 
 
 
811 aa  323  3.9999999999999996e-86  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1363  glycosyltransferase 36  29.61 
 
 
815 aa  322  7e-86  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0459  glycosyltransferase 36  29.7 
 
 
790 aa  321  1e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0141  cellulose degradation product phosphorylase  27.54 
 
 
801 aa  317  1.9999999999999998e-84  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002578  chitobiose phosphorylase  26.92 
 
 
802 aa  317  1.9999999999999998e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0460  glycosyltransferase 36  28.23 
 
 
811 aa  317  1.9999999999999998e-84  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19760  glycosyltransferase 36  28.27 
 
 
784 aa  315  6.999999999999999e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03431  hypothetical protein  27.04 
 
 
802 aa  314  2e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19750  glycosyltransferase 36  27.97 
 
 
819 aa  311  2.0000000000000002e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0430  glycosyltransferase 36  27.82 
 
 
831 aa  310  4.0000000000000004e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.948087  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1439  glycosyltransferase 36  26.94 
 
 
784 aa  302  5e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2584  chitobiose phosphorylase (glycosyl transferase)  27.31 
 
 
762 aa  301  1e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0148  glycosyltransferase 36  28 
 
 
822 aa  300  2e-79  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0233043 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0649  glycosyl transferase 36  28.67 
 
 
811 aa  298  1e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0225062  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1053  glycosyltransferase 36  27.16 
 
 
829 aa  291  9e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.753195  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2616  glycosyltransferase 36  28.45 
 
 
827 aa  277  2.0000000000000002e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.294292  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1745  glycosyltransferase 36  26.42 
 
 
815 aa  274  2e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.414629  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1318  cellobiose phosphorylase  27.07 
 
 
811 aa  271  1e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0462617  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0648  glycosyl transferase 36  25.91 
 
 
809 aa  262  6e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000072507  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2109  glycosyltransferase 36  25.68 
 
 
811 aa  262  6e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3854  glycosyltransferase 36  25.78 
 
 
797 aa  262  9e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1929  glycosyltransferase 36  25.22 
 
 
797 aa  258  2.0000000000000002e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2310  glycosyltransferase 36  26.75 
 
 
794 aa  251  1e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.587423  normal  0.417099 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2312  glycosyltransferase 36  26.68 
 
 
797 aa  251  2e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.26995 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3412  glycosyltransferase 36  24.65 
 
 
824 aa  244  1e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2354  glycosyltransferase 36  25.6 
 
 
796 aa  238  1.0000000000000001e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1744  glycosyltransferase 36  26.66 
 
 
823 aa  234  3e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0737514  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0906  NdvB protein  25.7 
 
 
788 aa  220  2.9999999999999998e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000016442 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02749  NdvB protein  25.44 
 
 
801 aa  195  1e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3696  cyclic beta 1-2 glucan synthetase domain-containing protein  23.36 
 
 
802 aa  194  2e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0857  cellobiose phosphorylase-like protein  23.21 
 
 
900 aa  102  9e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2989  glycosyltransferase 36  22.06 
 
 
984 aa  101  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.684465  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04170  Cellobiose phosphorylase  21.75 
 
 
904 aa  92.4  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5665  hypothetical protein  25.72 
 
 
1100 aa  90.1  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.24035  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6606  hypothetical protein  24.95 
 
 
1094 aa  81.3  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00814353 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4220  hypothetical protein  21.93 
 
 
1169 aa  67.4  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.117681  normal  0.559819 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0694  hypothetical protein  22.44 
 
 
1113 aa  64.7  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.514428  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0510  hypothetical protein  25.78 
 
 
536 aa  63.5  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2456  hypothetical protein  22.8 
 
 
1076 aa  63.5  0.00000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1072  hypothetical protein  28.19 
 
 
459 aa  63.2  0.00000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30460  hypothetical protein  24 
 
 
754 aa  62.4  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0534112  normal  0.427386 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0524  hypothetical protein  27.75 
 
 
459 aa  61.6  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00628478  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3575  hypothetical protein  33.83 
 
 
536 aa  61.6  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.196145  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0585  hypothetical protein  27.75 
 
 
459 aa  61.6  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0392402  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3150  hypothetical protein  30.56 
 
 
541 aa  60.1  0.0000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0587  hypothetical protein  22.63 
 
 
1117 aa  55.1  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.720861  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1070  hypothetical protein  22.04 
 
 
1095 aa  54.7  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.243584 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0526  hypothetical protein  22.63 
 
 
1117 aa  53.9  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1872  hypothetical protein  28.51 
 
 
461 aa  46.2  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>