52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_30460 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_30460  hypothetical protein  100 
 
 		 754 aa  1484    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0534112  normal  0.427386 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0510  hypothetical protein  58.33 
 
 		 536 aa  559  1e-158  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3150  hypothetical protein  55.7 
 
 		 541 aa  551  1e-155  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3575  hypothetical protein  54.77 
 
 		 536 aa  511  1e-143  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.196145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1386  hypothetical protein  28.5 
 
 		 529 aa  164  8.000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0257961  normal  0.650962 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3093  glycosyltransferase 36  26.03 
 
 		 2731 aa  116  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4026  glycosyltransferase 36  30.67 
 
 		 2748 aa  111  5e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.301518 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0791  putative carbohydrate binding  27 
 
 		 2716 aa  104  5e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3296  glycosyltransferase 36  27.27 
 
 		 2747 aa  102  3e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3379  putative carbohydrate binding  27.2 
 
 		 2758 aa  100  7e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3667  cyclic beta 1-2 glucan synthetase  24.61 
 
 		 2793 aa  100  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5841  putative carbohydrate binding  26.15 
 
 		 2730 aa  100  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3184  glycosyltransferase 36  26.6 
 
 		 2748 aa  99  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3489  hypothetical protein  27.34 
 
 		 2761 aa  99  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.731415 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1675  glycosyltransferase 36  24 
 
 		 2786 aa  84.7  0.000000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3155  glycosyltransferase 36  28.14 
 
 		 2870 aa  77.8  0.0000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4370  beta (1-->2) glucan biosynthesis protein  26.44 
 
 		 2833 aa  73.6  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0980  putative carbohydrate binding  37.82 
 
 		 2887 aa  70.5  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0111  cyclic beta 1-2 glucan synthetase  24.82 
 
 		 2732 aa  69.3  0.0000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.888748  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0108  cyclic beta 1-2 glucan synthetase  34.93 
 
 		 2864 aa  68.9  0.0000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.602283  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0124  glycosyltransferase 36  25.57 
 
 		 2888 aa  68.2  0.0000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3845  glycosyltransferase 36  26.72 
 
 		 2839 aa  67.4  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3613  glycosyltransferase  34.81 
 
 		 2769 aa  67.4  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4173  glycosyltransferase 36  26.34 
 
 		 2839 aa  65.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4755  putative carbohydrate binding  48.05 
 
 		 2779 aa  65.9  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2737  glycosyltransferase 36  26.46 
 
 		 2864 aa  64.7  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2188  glycosyltransferase 36  25.36 
 
 		 2916 aa  64.3  0.000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1870  glycosyltransferase 36  26.9 
 
 		 2864 aa  64.3  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1872  hypothetical protein  25.73 
 
 		 461 aa  63.9  0.000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1221  glycosyltransferase 36  36.89 
 
 		 2922 aa  63.2  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2577  putative carbohydrate binding  31.93 
 
 		 2823 aa  63.2  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1183  glycosyltransferase 36  24.55 
 
 		 2905 aa  62  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1711  glycosyltransferase 36  38.94 
 
 		 2874 aa  62.4  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.122848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0623  glycosyltransferase 36  26.51 
 
 		 2929 aa  62  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3285  glycosyltransferase 36  24 
 
 		 2880 aa  61.6  0.00000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1517  putative cyclic beta 1-2 glucan synthetase  41.07 
 
 		 2901 aa  61.6  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.302513  normal  0.43916 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2531  glycosyltransferase 36  39.17 
 
 		 2845 aa  60.8  0.00000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1304  cyclic beta 1-2 glucan synthetase  35.25 
 
 		 2859 aa  60.8  0.00000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1306  cyclic beta 1-2 glucan synthase  35.71 
 
 		 2884 aa  60.5  0.0000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5592  glycosyltransferase 36  38.05 
 
 		 2831 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5267  glycosyltransferase 36  38.05 
 
 		 2868 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3888  glycosyltransferase 36  40.71 
 
 		 2875 aa  59.3  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1346  putative cyclic beta 1-2 glucan synthetase  37.5 
 
 		 2868 aa  58.2  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2046  putative carbohydrate binding:glycosyltransferase 36:glycosyltransferase 36 associated  24.56 
 
 		 2932 aa  56.6  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3139  glycosyltransferase 36  24.19 
 
 		 2842 aa  55.8  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4245  glycosyltransferase 36  24.28 
 
 		 2860 aa  55.8  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.342744 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3706  glycosyltransferase 36  23.14 
 
 		 2453 aa  55.1  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4340  glycosyltransferase 36  23.24 
 
 		 3021 aa  55.1  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1072  hypothetical protein  22.64 
 
 		 459 aa  52.8  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2133  glycosyltransferase 36  34.91 
 
 		 2881 aa  51.6  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.150749 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0585  hypothetical protein  22.64 
 
 		 459 aa  51.6  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0392402  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0524  hypothetical protein  22.64 
 
 		 459 aa  51.6  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00628478  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>