96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0111 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_3285  glycosyltransferase 36  38.44 
 
 
2880 aa  1814    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4245  glycosyltransferase 36  37.29 
 
 
2860 aa  1727    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.342744 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3489  hypothetical protein  43.22 
 
 
2761 aa  1375    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.731415 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0623  glycosyltransferase 36  41.41 
 
 
2929 aa  1269    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3139  glycosyltransferase 36  46.24 
 
 
2842 aa  2310    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4340  glycosyltransferase 36  40.66 
 
 
3021 aa  1157    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2737  glycosyltransferase 36  40.86 
 
 
2864 aa  1934    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2993  glycosyltransferase 36  39.24 
 
 
1303 aa  918    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3155  glycosyltransferase 36  54.58 
 
 
2870 aa  3031    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0124  glycosyltransferase 36  92.44 
 
 
2888 aa  5218    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4026  glycosyltransferase 36  43.02 
 
 
2748 aa  1229    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.301518 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1870  glycosyltransferase 36  40.6 
 
 
2864 aa  1917    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0108  cyclic beta 1-2 glucan synthetase  99.52 
 
 
2864 aa  5565    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.602283  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3706  glycosyltransferase 36  34.78 
 
 
2453 aa  1126    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0980  putative carbohydrate binding  37.33 
 
 
2887 aa  1909    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2133  glycosyltransferase 36  38.86 
 
 
2881 aa  1807    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.150749 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1711  glycosyltransferase 36  44.82 
 
 
2874 aa  2182    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.122848  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3888  glycosyltransferase 36  45.01 
 
 
2875 aa  2236    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4173  glycosyltransferase 36  54.59 
 
 
2839 aa  2979    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5841  putative carbohydrate binding  39.99 
 
 
2730 aa  1080    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4370  beta (1-->2) glucan biosynthesis protein  54.3 
 
 
2833 aa  2996    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3296  glycosyltransferase 36  44.32 
 
 
2747 aa  1259    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3845  glycosyltransferase 36  53.92 
 
 
2839 aa  2944    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2577  putative carbohydrate binding  37.54 
 
 
2823 aa  1784    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2531  glycosyltransferase 36  45.43 
 
 
2845 aa  2301    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3379  putative carbohydrate binding  43.81 
 
 
2758 aa  1217    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3184  glycosyltransferase 36  43.66 
 
 
2748 aa  1210    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3667  cyclic beta 1-2 glucan synthetase  39.13 
 
 
2793 aa  1094    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1517  putative cyclic beta 1-2 glucan synthetase  45.25 
 
 
2901 aa  2246    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.302513  normal  0.43916 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1183  glycosyltransferase 36  39.24 
 
 
2905 aa  1818    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3613  glycosyltransferase  47.81 
 
 
2769 aa  1474    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1304  cyclic beta 1-2 glucan synthetase  38.69 
 
 
2859 aa  1769    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1346  putative cyclic beta 1-2 glucan synthetase  46.1 
 
 
2868 aa  2298    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1675  glycosyltransferase 36  38.53 
 
 
2786 aa  1167    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5267  glycosyltransferase 36  45 
 
 
2868 aa  2198    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2046  putative carbohydrate binding:glycosyltransferase 36:glycosyltransferase 36 associated  39.24 
 
 
2932 aa  1811    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0791  putative carbohydrate binding  38.57 
 
 
2716 aa  1023    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5592  glycosyltransferase 36  45.04 
 
 
2831 aa  2200    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0111  cyclic beta 1-2 glucan synthetase  100 
 
 
2732 aa  5595    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.888748  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4755  putative carbohydrate binding  44.66 
 
 
2779 aa  2246    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3093  glycosyltransferase 36  39.21 
 
 
2731 aa  1066    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1306  cyclic beta 1-2 glucan synthase  58.18 
 
 
2884 aa  3385    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2188  glycosyltransferase 36  39 
 
 
2916 aa  1848    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1221  glycosyltransferase 36  40.97 
 
 
2922 aa  1239    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3648  glycosyltransferase 36 associated  46.93 
 
 
624 aa  558  1e-157  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0953  glycosyltransferase 36  37.17 
 
 
786 aa  508  9.999999999999999e-143  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.862285  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0091  glycosyltransferase 36  37.2 
 
 
849 aa  485  1e-135  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00140222  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0951  glycosyltransferase 36  29.5 
 
 
813 aa  343  2.9999999999999998e-92  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0220582  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0968  glycosyltransferase 36  29.5 
 
 
813 aa  343  2.9999999999999998e-92  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.547767  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1439  glycosyltransferase 36  29.67 
 
 
784 aa  337  2e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1363  glycosyltransferase 36  30.24 
 
 
815 aa  335  7.000000000000001e-90  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19760  glycosyltransferase 36  28.43 
 
 
784 aa  334  2e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1364  glycosyltransferase 36  30.61 
 
 
785 aa  329  4.0000000000000003e-88  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0459  glycosyltransferase 36  29.5 
 
 
790 aa  325  6e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0275  cellobiose phosphorylase  28.43 
 
 
811 aa  321  1e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19750  glycosyltransferase 36  27.58 
 
 
819 aa  317  1.9999999999999998e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0649  glycosyl transferase 36  28.19 
 
 
811 aa  313  2e-83  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0225062  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3274  glycosyltransferase 36  28.4 
 
 
822 aa  300  2e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0460  glycosyltransferase 36  27.98 
 
 
811 aa  298  9e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0430  glycosyltransferase 36  26.83 
 
 
831 aa  297  2e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.948087  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1318  cellobiose phosphorylase  27.05 
 
 
811 aa  289  5.999999999999999e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0462617  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2616  glycosyltransferase 36  27.63 
 
 
827 aa  285  7.000000000000001e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.294292  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2109  glycosyltransferase 36  26.55 
 
 
811 aa  285  8.000000000000001e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0141  cellulose degradation product phosphorylase  26.19 
 
 
801 aa  284  1e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002578  chitobiose phosphorylase  26.28 
 
 
802 aa  281  9e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1929  glycosyltransferase 36  27.18 
 
 
797 aa  281  1e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03431  hypothetical protein  26.39 
 
 
802 aa  279  4e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0148  glycosyltransferase 36  27.36 
 
 
822 aa  279  7e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0233043 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2312  glycosyltransferase 36  28.06 
 
 
797 aa  267  2e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.26995 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1745  glycosyltransferase 36  26.51 
 
 
815 aa  263  2e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.414629  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1053  glycosyltransferase 36  27.44 
 
 
829 aa  261  1e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.753195  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3854  glycosyltransferase 36  24.62 
 
 
797 aa  258  1.0000000000000001e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2354  glycosyltransferase 36  25.93 
 
 
796 aa  257  3e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2310  glycosyltransferase 36  27.54 
 
 
794 aa  256  3e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.587423  normal  0.417099 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3412  glycosyltransferase 36  25.86 
 
 
824 aa  255  9.000000000000001e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2584  chitobiose phosphorylase (glycosyl transferase)  25.58 
 
 
762 aa  253  3e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0648  glycosyl transferase 36  26.58 
 
 
809 aa  251  2e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000072507  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1744  glycosyltransferase 36  26.56 
 
 
823 aa  245  7.999999999999999e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0737514  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0906  NdvB protein  26.5 
 
 
788 aa  225  9e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000016442 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02749  NdvB protein  25.57 
 
 
801 aa  192  5e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3696  cyclic beta 1-2 glucan synthetase domain-containing protein  22.8 
 
 
802 aa  190  3e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2989  glycosyltransferase 36  22.47 
 
 
984 aa  104  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.684465  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0857  cellobiose phosphorylase-like protein  22.69 
 
 
900 aa  102  9e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04170  Cellobiose phosphorylase  23.76 
 
 
904 aa  80.5  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0510  hypothetical protein  25.98 
 
 
536 aa  72.8  0.00000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3575  hypothetical protein  27.18 
 
 
536 aa  71.6  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.196145  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3150  hypothetical protein  25.44 
 
 
541 aa  70.9  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30460  hypothetical protein  24.82 
 
 
754 aa  70.1  0.0000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0534112  normal  0.427386 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5665  hypothetical protein  23.56 
 
 
1100 aa  65.9  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.24035  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1586  hypothetical protein  24.85 
 
 
1136 aa  63.9  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.707632  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06430  cellobiose phosphorylase  25.1 
 
 
1145 aa  62.8  0.00000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6606  hypothetical protein  23.42 
 
 
1094 aa  60.5  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00814353 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3576  hypothetical protein  32.1 
 
 
1195 aa  56.2  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.61557  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0694  hypothetical protein  22.09 
 
 
1113 aa  53.5  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.514428  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4220  hypothetical protein  27.16 
 
 
1169 aa  53.9  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.117681  normal  0.559819 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1386  hypothetical protein  24.49 
 
 
529 aa  52.4  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0257961  normal  0.650962 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>