101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1221 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR0111  cyclic beta 1-2 glucan synthetase  40.97 
 
 		 2732 aa  1239    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.888748  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2046  putative carbohydrate binding:glycosyltransferase 36:glycosyltransferase 36 associated  40.27 
 
 		 2932 aa  2211    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1304  cyclic beta 1-2 glucan synthetase  40 
 
 		 2859 aa  2152    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3613  glycosyltransferase  43.52 
 
 		 2769 aa  1381    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1183  glycosyltransferase 36  40.35 
 
 		 2905 aa  2226    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3184  glycosyltransferase 36  44.05 
 
 		 2748 aa  1367    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3667  cyclic beta 1-2 glucan synthetase  36.84 
 
 		 2793 aa  1066    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1517  putative cyclic beta 1-2 glucan synthetase  38.63 
 
 		 2901 aa  2079    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.302513  normal  0.43916 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1346  putative cyclic beta 1-2 glucan synthetase  42.76 
 
 		 2868 aa  1409    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2531  glycosyltransferase 36  38.73 
 
 		 2845 aa  2084    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5267  glycosyltransferase 36  39.18 
 
 		 2868 aa  2024    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5592  glycosyltransferase 36  39.32 
 
 		 2831 aa  2028    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4755  putative carbohydrate binding  34.11 
 
 		 2779 aa  1605    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3093  glycosyltransferase 36  37.66 
 
 		 2731 aa  1091    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1306  cyclic beta 1-2 glucan synthase  36.77 
 
 		 2884 aa  1803    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1221  glycosyltransferase 36  100 
 
 		 2922 aa  6051    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4245  glycosyltransferase 36  38.36 
 
 		 2860 aa  2080    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.342744 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3489  hypothetical protein  43.75 
 
 		 2761 aa  1391    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.731415 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3139  glycosyltransferase 36  44.77 
 
 		 2842 aa  1401    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4340  glycosyltransferase 36  38.32 
 
 		 3021 aa  2042    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0108  cyclic beta 1-2 glucan synthetase  40.78 
 
 		 2864 aa  1231    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.602283  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2737  glycosyltransferase 36  44.3 
 
 		 2864 aa  1409    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2993  glycosyltransferase 36  41.49 
 
 		 1303 aa  1102    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3155  glycosyltransferase 36  36.51 
 
 		 2870 aa  1845    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0124  glycosyltransferase 36  40.08 
 
 		 2888 aa  1221    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4026  glycosyltransferase 36  44.59 
 
 		 2748 aa  1419    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.301518 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1870  glycosyltransferase 36  44.9 
 
 		 2864 aa  1415    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3285  glycosyltransferase 36  39.59 
 
 		 2880 aa  2133    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0980  putative carbohydrate binding  50.32 
 
 		 2887 aa  3000    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2133  glycosyltransferase 36  38.59 
 
 		 2881 aa  2102    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.150749 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1711  glycosyltransferase 36  43.87 
 
 		 2874 aa  1378    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.122848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3888  glycosyltransferase 36  44.06 
 
 		 2875 aa  1422    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3296  glycosyltransferase 36  43.57 
 
 		 2747 aa  1403    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3845  glycosyltransferase 36  39.39 
 
 		 2839 aa  1176    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0623  glycosyltransferase 36  41.64 
 
 		 2929 aa  2298    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3379  putative carbohydrate binding  44.22 
 
 		 2758 aa  1388    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2577  putative carbohydrate binding  45.17 
 
 		 2823 aa  2592    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4370  beta (1-->2) glucan biosynthesis protein  37 
 
 		 2833 aa  1863    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5841  putative carbohydrate binding  35.83 
 
 		 2730 aa  1037    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4173  glycosyltransferase 36  39.34 
 
 		 2839 aa  1172    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3706  glycosyltransferase 36  36.19 
 
 		 2453 aa  1440    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2188  glycosyltransferase 36  40.17 
 
 		 2916 aa  2221    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0791  putative carbohydrate binding  39.07 
 
 		 2716 aa  1179    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1675  glycosyltransferase 36  43.35 
 
 		 2786 aa  1430    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3648  glycosyltransferase 36 associated  48.61 
 
 		 624 aa  637  1e-180  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0953  glycosyltransferase 36  40.48 
 
 		 786 aa  557  1e-156  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.862285  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0091  glycosyltransferase 36  38.48 
 
 		 849 aa  535  1e-150  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00140222  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0459  glycosyltransferase 36  30.91 
 
 		 790 aa  376  1e-102  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0275  cellobiose phosphorylase  31.35 
 
 		 811 aa  361  9.999999999999999e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0460  glycosyltransferase 36  31.35 
 
 		 811 aa  356  2.9999999999999997e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1364  glycosyltransferase 36  30.73 
 
 		 785 aa  356  2.9999999999999997e-96  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3274  glycosyltransferase 36  30.67 
 
 		 822 aa  353  4e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0141  cellulose degradation product phosphorylase  29.02 
 
 		 801 aa  352  7e-95  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1439  glycosyltransferase 36  29.14 
 
 		 784 aa  348  7e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0951  glycosyltransferase 36  30.36 
 
 		 813 aa  347  1e-93  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0220582  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0968  glycosyltransferase 36  30.36 
 
 		 813 aa  347  1e-93  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.547767  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19750  glycosyltransferase 36  29.8 
 
 		 819 aa  340  1.9999999999999998e-91  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19760  glycosyltransferase 36  30.45 
 
 		 784 aa  339  5e-91  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002578  chitobiose phosphorylase  28.11 
 
 		 802 aa  337  2e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03431  hypothetical protein  27.99 
 
 		 802 aa  335  8e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1363  glycosyltransferase 36  29.8 
 
 		 815 aa  332  5.0000000000000004e-89  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1745  glycosyltransferase 36  29.56 
 
 		 815 aa  323  3.9999999999999996e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.414629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0430  glycosyltransferase 36  29.22 
 
 		 831 aa  320  2e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.948087  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0649  glycosyl transferase 36  29.87 
 
 		 811 aa  319  5e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0225062  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1053  glycosyltransferase 36  27.2 
 
 		 829 aa  317  1.9999999999999998e-84  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.753195  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1318  cellobiose phosphorylase  28.94 
 
 		 811 aa  316  4.999999999999999e-84  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0462617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3854  glycosyltransferase 36  27.65 
 
 		 797 aa  316  4.999999999999999e-84  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0648  glycosyl transferase 36  28.61 
 
 		 809 aa  307  2.0000000000000002e-81  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000072507  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2584  chitobiose phosphorylase (glycosyl transferase)  27.71 
 
 		 762 aa  303  5e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2109  glycosyltransferase 36  29.2 
 
 		 811 aa  300  4e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3412  glycosyltransferase 36  27.54 
 
 		 824 aa  289  5.999999999999999e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0148  glycosyltransferase 36  27.04 
 
 		 822 aa  285  7.000000000000001e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0233043 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2312  glycosyltransferase 36  27.84 
 
 		 797 aa  283  3e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26995 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2310  glycosyltransferase 36  26.58 
 
 		 794 aa  277  3e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.587423  normal  0.417099 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1744  glycosyltransferase 36  27.19 
 
 		 823 aa  271  2e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0737514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2354  glycosyltransferase 36  27.26 
 
 		 796 aa  270  2e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2616  glycosyltransferase 36  25.84 
 
 		 827 aa  253  3e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.294292  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1929  glycosyltransferase 36  25.28 
 
 		 797 aa  240  2e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0906  NdvB protein  27.25 
 
 		 788 aa  230  3e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000016442 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02749  NdvB protein  25.99 
 
 		 801 aa  199  8.000000000000001e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3696  cyclic beta 1-2 glucan synthetase domain-containing protein  24.6 
 
 		 802 aa  185  1e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2989  glycosyltransferase 36  21.69 
 
 		 984 aa  101  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.684465  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0510  hypothetical protein  24.72 
 
 		 536 aa  77.4  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04170  Cellobiose phosphorylase  20.84 
 
 		 904 aa  75.9  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3575  hypothetical protein  27.74 
 
 		 536 aa  73.2  0.00000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.196145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5665  hypothetical protein  23 
 
 		 1100 aa  72  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.24035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3150  hypothetical protein  25.55 
 
 		 541 aa  68.9  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6606  hypothetical protein  22.88 
 
 		 1094 aa  64.7  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00814353 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30460  hypothetical protein  36.89 
 
 		 754 aa  62.8  0.00000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0534112  normal  0.427386 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0857  cellobiose phosphorylase-like protein  24.84 
 
 		 900 aa  56.6  0.000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1586  hypothetical protein  22.86 
 
 		 1136 aa  55.1  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.707632  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2456  hypothetical protein  25.99 
 
 		 1076 aa  55.1  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0526  hypothetical protein  22.04 
 
 		 1117 aa  53.5  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1070  hypothetical protein  22.04 
 
 		 1095 aa  52.4  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.243584 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1072  hypothetical protein  24.68 
 
 		 459 aa  52.4  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0587  hypothetical protein  22.04 
 
 		 1117 aa  52.8  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.720861  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0524  hypothetical protein  24.24 
 
 		 459 aa  51.2  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00628478  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0585  hypothetical protein  24.24 
 
 		 459 aa  51.2  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0392402  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06430  cellobiose phosphorylase  23.47 
 
 		 1145 aa  51.2  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0694  hypothetical protein  23.28 
 
 		 1113 aa  49.7  0.0008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.514428  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>