44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2580 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2580  Kelch repeat-containing protein  100 
 
 		 557 aa  1135    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6725  Kelch repeat-containing protein  39.52 
 
 		 698 aa  191  2e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3052  YD repeat-containing protein  29.27 
 
 		 2942 aa  77.4  0.0000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2812  kelch repeat-containing protein  28.12 
 
 		 795 aa  72.8  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.743776  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0230  hypothetical protein  28.36 
 
 		 339 aa  71.2  0.00000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2670  glycosy hydrolase family protein  25.74 
 
 		 812 aa  64.7  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1666  kelch repeat-containing protein  28.14 
 
 		 344 aa  62.8  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0657  Kelch repeat-containing protein  24.81 
 
 		 312 aa  62  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.951134  normal  0.331381 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2777  Kelch repeat-containing protein  30.89 
 
 		 1762 aa  60.1  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1844  metallophosphoesterase  23.71 
 
 		 776 aa  58.2  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.213592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1133  kelch repeat-containing protein  33.61 
 
 		 341 aa  57.4  0.0000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0981995 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_23798  predicted protein  26.55 
 
 		 710 aa  57  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2779  kelch repeat-containing protein  27.21 
 
 		 334 aa  55.8  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0178297 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0108  Kelch repeat protein  24.68 
 
 		 445 aa  55.5  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000075462  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3414  Kelch repeat-containing protein  28.17 
 
 		 1407 aa  55.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4728  protein kinase  28.32 
 
 		 1017 aa  54.7  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.423258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4434  protein kinase  28.32 
 
 		 1009 aa  54.7  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0964194  normal  0.216448 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4348  serine/threonine protein kinase  28.32 
 
 		 1009 aa  54.7  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.875806  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2899  Kelch repeat-containing protein  26.09 
 
 		 321 aa  53.9  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3426  Kelch repeat-containing protein  25.86 
 
 		 373 aa  53.5  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.261709  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_7153  predicted protein  31.93 
 
 		 180 aa  53.5  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.788569  normal  0.191003 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1076  protein kinase  33.57 
 
 		 993 aa  53.5  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0822  kelch repeat-containing protein  25.17 
 
 		 497 aa  52  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.803957  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0145  LuxR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 454 aa  51.6  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0537  Kelch repeat-containing protein  34.31 
 
 		 1514 aa  51.6  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4451  Kelch repeat-containing protein  24.38 
 
 		 326 aa  50.8  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0538307  normal  0.756619 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1097  Kelch repeat-containing protein  22.98 
 
 		 1557 aa  50.4  0.00008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.612946  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0574  kelch repeat-containing protein  26.79 
 
 		 321 aa  50.1  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.904037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0474  response regulator receiver protein  24.29 
 
 		 471 aa  50.1  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.40168  normal  0.0487434 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1741  kelch repeat-containing protein  26.27 
 
 		 314 aa  49.7  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.571519  normal  0.867228 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2665  glycosy hydrolase family protein  24.6 
 
 		 693 aa  49.3  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.472135  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0935  kelch repeat-containing protein  23.79 
 
 		 990 aa  48.9  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.35348  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3255  Kelch repeat-containing protein  24.46 
 
 		 383 aa  48.5  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0619981  normal  0.0696551 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3022  SSS sodium solute transporter superfamily  29.86 
 
 		 883 aa  47.4  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.61129  normal  0.844759 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42834  predicted protein  23.32 
 
 		 639 aa  47.4  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2569  transcriptional regulator, LuxR family  24.65 
 
 		 508 aa  47.4  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0548  Kelch repeat-containing protein  25.38 
 
 		 317 aa  47  0.0009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2624  Kelch repeat-containing protein  29.8 
 
 		 372 aa  47  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0288564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1271  kelch repeat-containing protein  30.9 
 
 		 862 aa  47  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.866715 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0584  Kelch repeat-containing protein  24.62 
 
 		 321 aa  45.8  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3342  LuxR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 461 aa  45.8  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.7323  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0137  Kelch repeat protein  27.59 
 
 		 1656 aa  44.7  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.175208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0506  Kelch repeat-containing protein  26.9 
 
 		 430 aa  44.3  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1424  major facilitator superfamily MFS_1  33.06 
 
 		 850 aa  43.9  0.009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.314854 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>