53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6725 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_6725  Kelch repeat-containing protein  100 
 
 		 698 aa  1392    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2580  Kelch repeat-containing protein  39.46 
 
 		 557 aa  177  6e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1076  protein kinase  27.16 
 
 		 993 aa  80.5  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2779  kelch repeat-containing protein  28.28 
 
 		 334 aa  74.3  0.000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0178297 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0657  Kelch repeat-containing protein  30.29 
 
 		 312 aa  72  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.951134  normal  0.331381 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2812  kelch repeat-containing protein  22.08 
 
 		 795 aa  72  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.743776  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1844  metallophosphoesterase  27.98 
 
 		 776 aa  70.9  0.00000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.213592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2777  Kelch repeat-containing protein  27.19 
 
 		 1762 aa  70.1  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4434  protein kinase  33.05 
 
 		 1009 aa  69.3  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0964194  normal  0.216448 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4728  protein kinase  33.05 
 
 		 1017 aa  68.9  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.423258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4348  serine/threonine protein kinase  33.05 
 
 		 1009 aa  69.3  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.875806  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0935  kelch repeat-containing protein  28.7 
 
 		 990 aa  67  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.35348  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2670  glycosy hydrolase family protein  28.63 
 
 		 812 aa  65.1  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1133  kelch repeat-containing protein  28.09 
 
 		 341 aa  64.7  0.000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0981995 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1741  kelch repeat-containing protein  32.84 
 
 		 314 aa  63.9  0.000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.571519  normal  0.867228 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0474  response regulator receiver protein  26.46 
 
 		 471 aa  63.5  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.40168  normal  0.0487434 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0230  hypothetical protein  25.91 
 
 		 339 aa  61.6  0.00000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2899  Kelch repeat-containing protein  23.29 
 
 		 321 aa  60.8  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3052  YD repeat-containing protein  27.39 
 
 		 2942 aa  58.9  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3414  Kelch repeat-containing protein  31.45 
 
 		 1407 aa  58.5  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2665  glycosy hydrolase family protein  27.7 
 
 		 693 aa  57.8  0.0000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.472135  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3426  Kelch repeat-containing protein  27.76 
 
 		 373 aa  57  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.261709  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4892  Kelch repeat-containing protein  26.06 
 
 		 318 aa  56.2  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0109077  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4451  Kelch repeat-containing protein  25.93 
 
 		 326 aa  56.2  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0538307  normal  0.756619 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0368  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.93 
 
 		 1453 aa  55.5  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.120671 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3342  LuxR family transcriptional regulator  23.83 
 
 		 461 aa  54.3  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.7323  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1097  Kelch repeat-containing protein  20.59 
 
 		 1557 aa  53.1  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.612946  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0108  Kelch repeat protein  21.13 
 
 		 445 aa  53.9  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000075462  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1666  kelch repeat-containing protein  24.58 
 
 		 344 aa  53.9  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1425  Kelch repeat-containing protein  34.8 
 
 		 327 aa  52.8  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.3472 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0305  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.12 
 
 		 1451 aa  52.8  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0752  kelch repeat-containing protein  24.81 
 
 		 368 aa  52.4  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0548  Kelch repeat-containing protein  24.89 
 
 		 317 aa  52  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0506  Kelch repeat-containing protein  26.5 
 
 		 430 aa  51.6  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0822  kelch repeat-containing protein  26.47 
 
 		 497 aa  51.2  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.803957  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29677  predicted protein  31.36 
 
 		 536 aa  51.2  0.00007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.000968434 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27233  predicted protein  31.36 
 
 		 536 aa  51.2  0.00007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0574  kelch repeat-containing protein  29.49 
 
 		 321 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.904037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0137  Kelch repeat protein  25.53 
 
 		 1656 aa  49.3  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.175208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2642  kelch repeat-containing protein  30.97 
 
 		 366 aa  48.9  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.105005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2624  Kelch repeat-containing protein  28 
 
 		 372 aa  48.9  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0288564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0537  Kelch repeat-containing protein  24.35 
 
 		 1514 aa  47.8  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_7153  predicted protein  28.07 
 
 		 180 aa  48.1  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.788569  normal  0.191003 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2569  transcriptional regulator, LuxR family  24.65 
 
 		 508 aa  47.8  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1953  kelch repeat-containing protein  22.41 
 
 		 460 aa  47.4  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0145  LuxR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 454 aa  47.4  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_6820  predicted protein  24.63 
 
 		 236 aa  45.8  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.148371  hitchhiker  0.00500772 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1470  Kelch repeat-containing protein  34.38 
 
 		 586 aa  45.8  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00615821  normal  0.710404 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_23798  predicted protein  22.03 
 
 		 710 aa  45.8  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42834  predicted protein  26.62 
 
 		 639 aa  45.4  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2212  Kelch repeat-containing protein  26.67 
 
 		 353 aa  45.1  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.556252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1750  Kelch repeat-containing protein  27.71 
 
 		 450 aa  44.3  0.009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0242608  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48253  predicted protein  35.23 
 
 		 1461 aa  43.9  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0799297  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>