22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1258 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_1258  hypothetical protein  100 
 
 		 561 aa  1125    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2160  hypothetical protein  30.5 
 
 		 607 aa  70.1  0.00000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.750892  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2066  multicopper oxidase type 2  31 
 
 		 1736 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.697525  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5731  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  32.29 
 
 		 1073 aa  61.2  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0478  hypothetical protein  25.84 
 
 		 519 aa  60.5  0.00000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.156904 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3360  low-density lipoprotein receptor YWTD repeat protein  29.47 
 
 		 772 aa  53.1  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0508989 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0416  outer membrane protein  25.5 
 
 		 1313 aa  52.4  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.541208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3744  hypothetical protein  28.08 
 
 		 416 aa  51.2  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2635  hypothetical protein  22.11 
 
 		 452 aa  51.2  0.00005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2670  glycosy hydrolase family protein  27.01 
 
 		 812 aa  50.8  0.00006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1863  hypothetical protein  36.05 
 
 		 409 aa  49.7  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1816  Ig family protein  25.63 
 
 		 1626 aa  49.3  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1066  hypothetical protein  30.07 
 
 		 1193 aa  48.5  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0974046 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0492  hypothetical protein  29.9 
 
 		 884 aa  47  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2129  S-layer-like domain-containing protein  29.06 
 
 		 1304 aa  46.6  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00431402  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  40.54 
 
 		 910 aa  45.8  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1928  hypothetical protein  31.07 
 
 		 525 aa  45.8  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.361746  normal  0.675694 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2781  outer membrane autotransporter  27.2 
 
 		 2886 aa  45.1  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2108  hypothetical protein  35.21 
 
 		 373 aa  45.1  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4963  hypothetical protein  28.5 
 
 		 897 aa  45.1  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.771854 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1069  PKD domain-containing protein  30.23 
 
 		 1783 aa  44.7  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.62393 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1605  coagulation factor 5/8 type domain protein  26.04 
 
 		 1212 aa  43.9  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.232079 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>