15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0478 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_0478  hypothetical protein  100 
 
 
519 aa  1009    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.156904 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1327  hypothetical protein  24.9 
 
 
552 aa  72.8  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2635  hypothetical protein  28.16 
 
 
452 aa  68.6  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3744  hypothetical protein  49.45 
 
 
416 aa  68.9  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1258  hypothetical protein  25.84 
 
 
561 aa  55.8  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1770  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) domain  30.43 
 
 
735 aa  53.9  0.000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0271319 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3508  hypothetical protein  34.31 
 
 
394 aa  52.8  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4208  hypothetical protein  43.37 
 
 
486 aa  52  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3913  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  44.09 
 
 
1710 aa  50.8  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.806199  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0211  hypothetical protein  38.75 
 
 
741 aa  48.9  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.552995  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2004  PKD domain containing protein  43.75 
 
 
584 aa  49.3  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.361042  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1384  hypothetical protein  34.23 
 
 
510 aa  47.8  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.321745 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2016  hypothetical protein  29.79 
 
 
868 aa  45.8  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0853096  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1069  PKD domain-containing protein  32.63 
 
 
1783 aa  45.8  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.62393 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1213  Ig domain-containing protein  33.33 
 
 
1361 aa  44.7  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.406135  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>