159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1928 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1928  hypothetical protein  100 
 
 		 525 aa  1054    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.361746  normal  0.675694 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3706  hypothetical protein  36.32 
 
 		 771 aa  180  5.999999999999999e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2931  cell surface protein  37.95 
 
 		 940 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750354  hitchhiker  0.00446431 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3145  hypothetical protein  36.81 
 
 		 1096 aa  156  7e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.404826  normal  0.106206 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1797  hypothetical protein  38.86 
 
 		 405 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.000000000782574  normal  1 
 
 
 
NC_007355  Mbar_A0698  cell surface protein  37.66 
 
 		 586 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.497702 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1644  hypothetical protein  41.72 
 
 		 416 aa  140  6e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2198  hypothetical protein  44.74 
 
 		 747 aa  139  8.999999999999999e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0450097  normal  0.656514 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2670  hypothetical protein  43.79 
 
 		 635 aa  134  3e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.734137  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  32.66 
 
 		 2552 aa  133  7.999999999999999e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  31.51 
 
 		 861 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1549  Pyrrolo-quinoline quinone  36.23 
 
 		 656 aa  125  2e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.259742  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0125  hypothetical protein  40.52 
 
 		 418 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1197  hypothetical protein  34.76 
 
 		 631 aa  117  6e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1864  hypothetical protein  40.91 
 
 		 656 aa  116  7.999999999999999e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.935351  normal  0.282908 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  32.52 
 
 		 575 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2108  hypothetical protein  39.88 
 
 		 373 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1743  hypothetical protein  40.76 
 
 		 926 aa  110  5e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.274233  normal  0.78184 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0314  cadherin  32.9 
 
 		 1021 aa  104  3e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2006  hypothetical protein  29.44 
 
 		 435 aa  97.4  6e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0937  KP-43 peptidase  33.99 
 
 		 1351 aa  95.5  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.215277  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  37.18 
 
 		 978 aa  86.7  9e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  54.26 
 
 		 2036 aa  86.7  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  45.63 
 
 		 1882 aa  84.7  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  46.23 
 
 		 2000 aa  85.1  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  51.65 
 
 		 2122 aa  84.7  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  48.04 
 
 		 2272 aa  84.3  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  44.25 
 
 		 1682 aa  84.3  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  38.96 
 
 		 963 aa  84.3  0.000000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  44.17 
 
 		 1300 aa  83.6  0.000000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  43.51 
 
 		 1969 aa  83.2  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1069  PKD domain-containing protein  31.65 
 
 		 1783 aa  82  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.62393 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1794  cell surface protein  47.42 
 
 		 1328 aa  82  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.193749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  47.42 
 
 		 1842 aa  81.6  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  42.86 
 
 		 1120 aa  81.6  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1991  cell surface protein  46.88 
 
 		 1311 aa  78.6  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.995987 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2113  cell surface protein  45.87 
 
 		 725 aa  77.8  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.103352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  53.62 
 
 		 1241 aa  77.4  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2441  PKD  49.51 
 
 		 996 aa  77.4  0.0000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000010419  normal  0.547756 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2204  periplasmic copper-binding  37.14 
 
 		 838 aa  77.4  0.0000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.434712 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  36.99 
 
 		 1667 aa  76.6  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  50 
 
 		 930 aa  75.9  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1242  hypothetical protein  48.75 
 
 		 810 aa  75.9  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  49.51 
 
 		 3295 aa  75.9  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  43.43 
 
 		 930 aa  75.5  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2442  PKD  34.73 
 
 		 941 aa  75.9  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000335997  normal  0.167692 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  48.51 
 
 		 1094 aa  75.1  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  50.52 
 
 		 1356 aa  74.7  0.000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2762  PKD  40.3 
 
 		 500 aa  73.9  0.000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  45.54 
 
 		 859 aa  73.2  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  52.94 
 
 		 1732 aa  73.2  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  48.42 
 
 		 713 aa  72.8  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  48.42 
 
 		 581 aa  72.4  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  40 
 
 		 1862 aa  72.4  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  46.53 
 
 		 735 aa  72  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  37.42 
 
 		 679 aa  70.9  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2844  hypothetical protein  49.35 
 
 		 1001 aa  71.2  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0777438  normal  0.0344466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2569  surface layer protein B  46.67 
 
 		 505 aa  70.9  0.00000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.390258  normal  0.0285129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2929  surface layer protein B  49.43 
 
 		 471 aa  70.9  0.00000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0075773  hitchhiker  0.00586153 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  46 
 
 		 658 aa  70.5  0.00000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  36.02 
 
 		 675 aa  70.5  0.00000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  47.25 
 
 		 910 aa  70.1  0.00000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0945  PKD  40.98 
 
 		 400 aa  70.5  0.00000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0321652  normal  0.217616 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  37.65 
 
 		 669 aa  70.1  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  50.56 
 
 		 2554 aa  69.7  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0426  PKD  44.44 
 
 		 816 aa  69.7  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2918  hypothetical protein  48.86 
 
 		 791 aa  69.3  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2419  PKD domain-containing protein  40.37 
 
 		 684 aa  69.3  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1955  hypothetical protein  44.33 
 
 		 1282 aa  68.6  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2845  cell surface protein  53.12 
 
 		 960 aa  68.6  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.726454  normal  0.0327621 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2427  PKD  47.56 
 
 		 2176 aa  68.6  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2794  hypothetical protein  44.33 
 
 		 551 aa  67.8  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000111545 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1626  hypothetical protein  46.32 
 
 		 644 aa  67.8  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2670  PKD domain containing protein  39.04 
 
 		 1387 aa  67.4  0.0000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  38.71 
 
 		 685 aa  67.4  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0818  PKD domain-containing protein  47.83 
 
 		 530 aa  67.4  0.0000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1485  putative surface layer protein  43.3 
 
 		 184 aa  66.2  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.461481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  44.44 
 
 		 719 aa  66.2  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1164  PKD  45.33 
 
 		 1011 aa  66.2  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1683  PKD  44.3 
 
 		 211 aa  66.2  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.657327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  42.42 
 
 		 845 aa  65.5  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  38.76 
 
 		 971 aa  65.9  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0787  PKD domain-containing protein  49.3 
 
 		 561 aa  65.1  0.000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.605081  normal  0.12809 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  46.6 
 
 		 1667 aa  65.1  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  42.2 
 
 		 1236 aa  65.1  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1970  periplasmic copper-binding  42.53 
 
 		 1931 aa  65.1  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.21259 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3064  hypothetical protein  46.58 
 
 		 168 aa  64.7  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.187552  normal  0.503908 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  41.41 
 
 		 870 aa  64.7  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0638  PKD domain-containing protein  52.38 
 
 		 519 aa  64.3  0.000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  40.59 
 
 		 752 aa  64.3  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  36.02 
 
 		 547 aa  63.5  0.000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2499  PKD  47.14 
 
 		 374 aa  63.5  0.000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00083014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0753  PKD domain-containing protein  37.31 
 
 		 528 aa  63.5  0.000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.095216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0726  hypothetical protein  45.26 
 
 		 560 aa  63.5  0.000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  35.76 
 
 		 615 aa  63.5  0.000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1423  PKD domain-containing protein  34.93 
 
 		 1361 aa  63.2  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.446395  hitchhiker  0.00318568 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  44.44 
 
 		 840 aa  63.2  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2071  Carbohydrate binding family 6  49.43 
 
 		 1380 aa  63.5  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.306385  normal  0.362656 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1440  PKD domain-containing protein  33.33 
 
 		 460 aa  62.4  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.094364  hitchhiker  0.00229761 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3325  cell surface protein  35.51 
 
 		 938 aa  62  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00941994 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>