27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1864 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1864  hypothetical protein  100 
 
 
656 aa  1214    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.935351  normal  0.282908 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1743  hypothetical protein  49.12 
 
 
926 aa  236  7e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.274233  normal  0.78184 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2198  hypothetical protein  52.32 
 
 
747 aa  159  1e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0450097  normal  0.656514 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2931  cell surface protein  46.36 
 
 
940 aa  156  1e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750354  hitchhiker  0.00446431 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0698  cell surface protein  51.57 
 
 
586 aa  150  5e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.497702 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3706  hypothetical protein  48.68 
 
 
771 aa  143  9.999999999999999e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  46.75 
 
 
861 aa  139  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2670  hypothetical protein  44.74 
 
 
635 aa  137  6.0000000000000005e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.734137  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1797  hypothetical protein  43.64 
 
 
405 aa  134  6e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.000000000782574  normal 
 
 
 
NC_007355  Mbar_A2108  hypothetical protein  47.06 
 
 
373 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3145  hypothetical protein  44.74 
 
 
1096 aa  130  9.000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.404826  normal  0.106206 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1928  hypothetical protein  41.5 
 
 
525 aa  108  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.361746  normal  0.675694 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1644  hypothetical protein  37.5 
 
 
416 aa  95.5  3e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2006  hypothetical protein  33.55 
 
 
435 aa  89.4  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  35.1 
 
 
2552 aa  88.6  3e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1549  Pyrrolo-quinoline quinone  38.93 
 
 
656 aa  87.8  5e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.259742  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0125  hypothetical protein  34.87 
 
 
418 aa  79.7  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0314  cadherin  29.22 
 
 
1021 aa  76.3  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0937  KP-43 peptidase  38.3 
 
 
1351 aa  66.2  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.215277  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1212  Ig domain-containing protein  36.67 
 
 
1279 aa  59.3  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1213  Ig domain-containing protein  35.56 
 
 
1361 aa  59.3  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.406135  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1069  PKD domain-containing protein  25.33 
 
 
1783 aa  52.4  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.62393 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3064  hypothetical protein  32.11 
 
 
168 aa  51.6  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.187552  normal  0.503908 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0284  LVIVD repeat-containing protein  31.34 
 
 
882 aa  50.1  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.635237  normal 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48676  predicted protein  24.82 
 
 
4825 aa  50.1  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2795  hypothetical protein  44.9 
 
 
961 aa  49.7  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.827572  hitchhiker  0.0000678695 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4259  helicase domain-containing protein  20.89 
 
 
2570 aa  45.8  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>