29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1797 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1797  hypothetical protein  100 
 
 
405 aa  813    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.000000000782574  normal 
 
 
 
NC_007355  Mbar_A2931  cell surface protein  44 
 
 
940 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750354  hitchhiker  0.00446431 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0698  cell surface protein  42.04 
 
 
586 aa  178  2e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.497702 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2670  hypothetical protein  43.75 
 
 
635 aa  171  2e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.734137  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3145  hypothetical protein  42.47 
 
 
1096 aa  170  3e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.404826  normal  0.106206 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2198  hypothetical protein  52.63 
 
 
747 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0450097  normal  0.656514 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2108  hypothetical protein  42.59 
 
 
373 aa  164  3e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3706  hypothetical protein  41.78 
 
 
771 aa  162  8.000000000000001e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1928  hypothetical protein  38.86 
 
 
525 aa  155  1e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.361746  normal  0.675694 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1743  hypothetical protein  46.5 
 
 
926 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.274233  normal  0.78184 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1864  hypothetical protein  42.69 
 
 
656 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.935351  normal  0.282908 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1197  hypothetical protein  46.5 
 
 
631 aa  145  1e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  46.63 
 
 
861 aa  144  2e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2791  hypothetical protein  49.23 
 
 
284 aa  136  7.000000000000001e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000798761  hitchhiker  0.000821191 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1644  hypothetical protein  38.1 
 
 
416 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0125  hypothetical protein  41.03 
 
 
418 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1549  Pyrrolo-quinoline quinone  35.71 
 
 
656 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.259742  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0314  cadherin  32.41 
 
 
1021 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2006  hypothetical protein  31.48 
 
 
435 aa  110  3e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0937  KP-43 peptidase  35.53 
 
 
1351 aa  101  3e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.215277  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  32.66 
 
 
2552 aa  100  4e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1212  Ig domain-containing protein  32 
 
 
1279 aa  59.3  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1213  Ig domain-containing protein  29.89 
 
 
1361 aa  52  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.406135  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3064  hypothetical protein  28.87 
 
 
168 aa  47.8  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.187552  normal  0.503908 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1069  PKD domain-containing protein  28.36 
 
 
1783 aa  47.8  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.62393 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0610  hypothetical protein  29.41 
 
 
463 aa  46.2  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.35992  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0284  LVIVD repeat-containing protein  30.3 
 
 
882 aa  45.1  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.635237  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  29.57 
 
 
910 aa  44.7  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2625  hypothetical protein  24.84 
 
 
319 aa  43.1  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>