48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1197 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1197  hypothetical protein  100 
 
 		 631 aa  1254    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1743  hypothetical protein  87.73 
 
 		 926 aa  945    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.274233  normal  0.78184 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2931  cell surface protein  40 
 
 		 940 aa  155  2.9999999999999998e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750354  hitchhiker  0.00446431 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2108  hypothetical protein  47.68 
 
 		 373 aa  153  8.999999999999999e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2198  hypothetical protein  48.34 
 
 		 747 aa  151  4e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0450097  normal  0.656514 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1797  hypothetical protein  46.5 
 
 		 405 aa  144  7e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.000000000782574  normal  1 
 
 
 
NC_007355  Mbar_A3706  hypothetical protein  39.27 
 
 		 771 aa  140  7e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0698  cell surface protein  45.1 
 
 		 586 aa  131  3e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.497702 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  39.88 
 
 		 861 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2670  hypothetical protein  43.04 
 
 		 635 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.734137  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3145  hypothetical protein  41.41 
 
 		 1096 aa  124  4e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.404826  normal  0.106206 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1928  hypothetical protein  34.76 
 
 		 525 aa  117  8.999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.361746  normal  0.675694 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1644  hypothetical protein  38.41 
 
 		 416 aa  112  3e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0125  hypothetical protein  39.1 
 
 		 418 aa  105  3e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1549  Pyrrolo-quinoline quinone  32.54 
 
 		 656 aa  97.8  5e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.259742  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0314  cadherin  27.68 
 
 		 1021 aa  88.6  3e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2006  hypothetical protein  34.23 
 
 		 435 aa  87.8  6e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  31.37 
 
 		 2552 aa  75.5  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3140  hypothetical protein  30.57 
 
 		 1213 aa  74.7  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.242437  normal  0.09538 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3989  hypothetical protein  30.52 
 
 		 2528 aa  72.4  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1873  carbohydrate-binding family 6 protein  30.42 
 
 		 1091 aa  70.9  0.00000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00027012  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0937  KP-43 peptidase  29.37 
 
 		 1351 aa  65.1  0.000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.215277  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1212  Ig domain-containing protein  31.62 
 
 		 1279 aa  62.8  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4226  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.49 
 
 		 1454 aa  62  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.542738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4515  APHP domain-containing protein  25.07 
 
 		 5743 aa  62  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2544  APHP domain protein  33.33 
 
 		 405 aa  58.2  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1308  APHP domain-containing protein  26.14 
 
 		 1085 aa  55.8  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0025589  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0070  APHP domain-containing protein  27.36 
 
 		 1951 aa  55.1  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1069  PKD domain-containing protein  38.24 
 
 		 1783 aa  54.7  0.000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.62393 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2756  galactose oxidase  30.47 
 
 		 797 aa  53.5  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.760329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1991  cell surface protein  25 
 
 		 1311 aa  52.8  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.995987 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1936  APHP domain protein  27.32 
 
 		 1074 aa  52  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.620471  normal  0.229187 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2171  hypothetical protein  26.01 
 
 		 1879 aa  51.2  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3733  hypothetical protein  24.62 
 
 		 1067 aa  50.8  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.422005  normal  0.383912 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0119  APHP domain-containing protein  30.36 
 
 		 976 aa  50.4  0.00009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2339  APHP domain protein  21.27 
 
 		 2002 aa  49.3  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3064  hypothetical protein  43.33 
 
 		 168 aa  49.3  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.187552  normal  0.503908 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0812  hypothetical protein  31.62 
 
 		 1200 aa  48.9  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1462  APHP domain protein  30.36 
 
 		 1378 aa  48.5  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0673  APHP domain-containing protein  28.25 
 
 		 857 aa  48.5  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  30.58 
 
 		 6885 aa  48.9  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1345  hypothetical protein  25.27 
 
 		 3121 aa  48.9  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1213  Ig domain-containing protein  30.43 
 
 		 1361 aa  48.1  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.406135  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3219  fibronectin type III domain-containing protein  28.85 
 
 		 2030 aa  47  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.341316  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0153  APHP domain protein  27.54 
 
 		 1224 aa  46.2  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1794  cell surface protein  29.29 
 
 		 1328 aa  46.2  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.193749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4244  hypothetical protein  27.5 
 
 		 1332 aa  45.4  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.472735  normal  0.133034 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0284  LVIVD repeat-containing protein  32.88 
 
 		 882 aa  45.1  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.635237  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>