178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2113 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2113  cell surface protein  100 
 
 		 725 aa  1479    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.103352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  37.9 
 
 		 1236 aa  371  1e-101  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1038  hypothetical protein  42.37 
 
 		 475 aa  356  6.999999999999999e-97  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0644  periplasmic copper-binding  41.37 
 
 		 1092 aa  344  4e-93  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.167347  normal  0.0259302 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0222  peptidase C1A, papain  40.34 
 
 		 497 aa  313  9e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.107237  normal  0.0912112 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0903  peptidase C1A, papain  39.96 
 
 		 496 aa  293  8e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0559  peptidase C1A papain  38.69 
 
 		 2353 aa  278  3e-73  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.735343  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0305  preprotein translocase subunit SecD-like protein  26.73 
 
 		 571 aa  146  1e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.303617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  51.4 
 
 		 1120 aa  102  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1794  cell surface protein  47.5 
 
 		 1328 aa  99.4  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.193749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  52.04 
 
 		 2272 aa  99  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  52.04 
 
 		 2000 aa  98.6  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  50 
 
 		 2122 aa  97.8  6e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  47.66 
 
 		 1842 aa  97.1  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  49.52 
 
 		 1969 aa  96.3  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1273  PKD repeat-containing protein  38.18 
 
 		 275 aa  95.1  4e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  52.58 
 
 		 1241 aa  94.4  6e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  52.81 
 
 		 978 aa  94  9e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  54.32 
 
 		 1882 aa  92.8  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  51.06 
 
 		 1682 aa  92.4  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  26.74 
 
 		 3295 aa  91.3  6e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  47.66 
 
 		 2036 aa  90.5  9e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2844  hypothetical protein  52.56 
 
 		 1001 aa  90.5  9e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0777438  normal  0.0344466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  44.44 
 
 		 575 aa  90.1  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1991  cell surface protein  40.65 
 
 		 1311 aa  89  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.995987 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2451  peptidase C1A, papain  31.79 
 
 		 1202 aa  88.6  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.692064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1242  hypothetical protein  50 
 
 		 810 aa  87.8  7e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  51.09 
 
 		 1732 aa  87.4  9e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2326  peptidase C1A papain  29.54 
 
 		 812 aa  87.4  9e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.706763  normal  0.190341 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2845  cell surface protein  51.95 
 
 		 960 aa  85.9  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.726454  normal  0.0327621 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  38.15 
 
 		 1862 aa  85.1  0.000000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  50 
 
 		 2554 aa  82.8  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  45.56 
 
 		 1300 aa  82  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0046  putative serine protease  27.73 
 
 		 1066 aa  82.4  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000707412  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  48.96 
 
 		 1356 aa  82  0.00000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1423  PKD domain-containing protein  40.94 
 
 		 1361 aa  80.9  0.00000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.446395  hitchhiker  0.00318568 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  48.51 
 
 		 2552 aa  80.9  0.00000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3754  hypothetical protein  40.3 
 
 		 1830 aa  79.3  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.301903 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0818  PKD domain-containing protein  47.17 
 
 		 530 aa  79.3  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  35.09 
 
 		 910 aa  79.3  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  51.22 
 
 		 547 aa  79  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1928  hypothetical protein  47.31 
 
 		 525 aa  77.4  0.0000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.361746  normal  0.675694 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2794  hypothetical protein  49.47 
 
 		 551 aa  77.4  0.0000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000111545 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2929  surface layer protein B  50.62 
 
 		 471 aa  77.4  0.0000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0075773  hitchhiker  0.00586153 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  42.62 
 
 		 685 aa  76.6  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3325  cell surface protein  34.48 
 
 		 938 aa  76.6  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00941994 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2569  surface layer protein B  40.43 
 
 		 505 aa  76.3  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.390258  normal  0.0285129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2931  cell surface protein  46.94 
 
 		 940 aa  76.6  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750354  hitchhiker  0.00446431 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  53.33 
 
 		 1667 aa  76.3  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2442  PKD  34.1 
 
 		 941 aa  75.9  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000335997  normal  0.167692 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3575  putative surface layer protein  50.54 
 
 		 561 aa  75.9  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840675  normal  0.236267 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  48.04 
 
 		 752 aa  75.9  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2918  hypothetical protein  49.02 
 
 		 791 aa  75.5  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2670  PKD domain containing protein  49 
 
 		 1387 aa  75.1  0.000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0865  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  51.28 
 
 		 2065 aa  74.7  0.000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1485  putative surface layer protein  49.38 
 
 		 184 aa  73.9  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.461481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  46.53 
 
 		 859 aa  73.9  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2441  PKD  45 
 
 		 996 aa  73.2  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000010419  normal  0.547756 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0753  PKD domain-containing protein  36.9 
 
 		 528 aa  72.8  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.095216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0726  hypothetical protein  42.74 
 
 		 560 aa  72  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3706  hypothetical protein  36.97 
 
 		 771 aa  71.6  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0970  PKD  44.57 
 
 		 1528 aa  71.6  0.00000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1955  hypothetical protein  43.88 
 
 		 1282 aa  71.2  0.00000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  47.31 
 
 		 675 aa  70.9  0.00000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  45.63 
 
 		 669 aa  70.9  0.00000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  43.1 
 
 		 713 aa  70.1  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  42.2 
 
 		 679 aa  70.1  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  55.38 
 
 		 861 aa  70.5  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1970  periplasmic copper-binding  49.38 
 
 		 1931 aa  70.1  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.21259 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  46.07 
 
 		 581 aa  70.1  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  34.93 
 
 		 823 aa  69.7  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3131  peptidase C1A, papain  31.15 
 
 		 1096 aa  69.7  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.34084  hitchhiker  0.000341484 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1626  hypothetical protein  49.38 
 
 		 644 aa  68.6  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50321  predicted protein  25.94 
 
 		 424 aa  68.6  0.0000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1440  PKD domain-containing protein  39.69 
 
 		 460 aa  68.6  0.0000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.094364  hitchhiker  0.00229761 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1686  periplasmic copper-binding  34.56 
 
 		 1056 aa  68.2  0.0000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.482609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  40.5 
 
 		 963 aa  68.2  0.0000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  45.16 
 
 		 658 aa  67.8  0.0000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1796  PKD domain containing protein  48.15 
 
 		 848 aa  67.8  0.0000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  46.94 
 
 		 958 aa  67.4  0.0000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26082  predicted protein  27.98 
 
 		 272 aa  67.4  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0135575 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  43.14 
 
 		 615 aa  67  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  44.25 
 
 		 719 aa  67  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3145  hypothetical protein  41.18 
 
 		 1096 aa  67  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.404826  normal  0.106206 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1069  PKD domain-containing protein  47.37 
 
 		 1783 aa  67  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.62393 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0426  PKD  48.1 
 
 		 816 aa  66.6  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  44.12 
 
 		 845 aa  67  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  46.24 
 
 		 930 aa  67  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2588  PKD domain containing protein  34.18 
 
 		 815 aa  66.2  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0382453 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  41.67 
 
 		 786 aa  66.2  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3143  cell surface protein  49.32 
 
 		 819 aa  65.5  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.302282  normal  0.566596 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  43.75 
 
 		 735 aa  65.5  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  30.41 
 
 		 802 aa  65.1  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  33.97 
 
 		 840 aa  65.1  0.000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2071  Carbohydrate binding family 6  44.83 
 
 		 1380 aa  64.3  0.000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.306385  normal  0.362656 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4005  peptidase C1A, papain  31.58 
 
 		 619 aa  64.3  0.000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  42.27 
 
 		 1094 aa  63.5  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2170  hypothetical protein  41.46 
 
 		 525 aa  63.5  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1163  PKD  42.7 
 
 		 1189 aa  63.9  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.185385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0639  PKD domain-containing protein  38.46 
 
 		 769 aa  62.8  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.292646  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>