21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3064 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3064  hypothetical protein  100 
 
 
168 aa  351  2.9999999999999997e-96  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.187552  normal  0.503908 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2931  cell surface protein  45.67 
 
 
940 aa  107  9.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750354  hitchhiker  0.00446431 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2198  hypothetical protein  37.93 
 
 
747 aa  90.9  8e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0450097  normal  0.656514 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0698  cell surface protein  40.46 
 
 
586 aa  90.5  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.497702 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3145  hypothetical protein  39.68 
 
 
1096 aa  87.8  6e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.404826  normal  0.106206 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3706  hypothetical protein  40.91 
 
 
771 aa  85.9  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2670  hypothetical protein  43.75 
 
 
635 aa  81.6  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.734137  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1549  Pyrrolo-quinoline quinone  40.37 
 
 
656 aa  70.1  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.259742  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1928  hypothetical protein  46.58 
 
 
525 aa  64.3  0.0000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.361746  normal  0.675694 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  30.66 
 
 
861 aa  62.4  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1644  hypothetical protein  47.17 
 
 
416 aa  54.7  0.0000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1069  PKD domain-containing protein  41.18 
 
 
1783 aa  51.6  0.000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.62393 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1743  hypothetical protein  43.28 
 
 
926 aa  51.6  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.274233  normal  0.78184 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1864  hypothetical protein  32.11 
 
 
656 aa  50.4  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.935351  normal  0.282908 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0314  cadherin  35.14 
 
 
1021 aa  50.4  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0125  hypothetical protein  38 
 
 
418 aa  49.7  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1197  hypothetical protein  41.79 
 
 
631 aa  49.3  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2108  hypothetical protein  27.27 
 
 
373 aa  48.5  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1797  hypothetical protein  28.87 
 
 
405 aa  47.4  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.000000000782574  normal 
 
 
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  38.16 
 
 
910 aa  46.2  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0284  LVIVD repeat-containing protein  38 
 
 
882 aa  44.7  0.0006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.635237  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>