48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0568 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0568  kelch repeat-containing protein  100 
 
 		 396 aa  795    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.558625  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0108  Kelch repeat protein  26.27 
 
 		 445 aa  74.7  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000075462  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3342  LuxR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 461 aa  73.6  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.7323  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0657  Kelch repeat-containing protein  25.32 
 
 		 312 aa  70.5  0.00000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.951134  normal  0.331381 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0474  response regulator receiver protein  29.73 
 
 		 471 aa  67.8  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.40168  normal  0.0487434 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1133  kelch repeat-containing protein  25.77 
 
 		 341 aa  66.2  0.000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0981995 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3426  Kelch repeat-containing protein  31.47 
 
 		 373 aa  64.7  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.261709  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2779  kelch repeat-containing protein  28.46 
 
 		 334 aa  64.7  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0178297 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1844  metallophosphoesterase  29.32 
 
 		 776 aa  62.4  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.213592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0230  hypothetical protein  24.46 
 
 		 339 aa  61.2  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2569  transcriptional regulator, LuxR family  23.46 
 
 		 508 aa  60.8  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1666  kelch repeat-containing protein  27.19 
 
 		 344 aa  60.5  0.00000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0145  LuxR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 454 aa  59.3  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2670  glycosy hydrolase family protein  29.33 
 
 		 812 aa  58.5  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4728  protein kinase  23.22 
 
 		 1017 aa  56.6  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.423258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1097  Kelch repeat-containing protein  25.81 
 
 		 1557 aa  56.6  0.0000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.612946  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4434  protein kinase  22.91 
 
 		 1009 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0964194  normal  0.216448 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2812  kelch repeat-containing protein  28.57 
 
 		 795 aa  55.5  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.743776  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4348  serine/threonine protein kinase  22.91 
 
 		 1009 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.875806  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0752  kelch repeat-containing protein  22.52 
 
 		 368 aa  55.1  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4361  kelch repeat-containing protein  26.29 
 
 		 717 aa  53.5  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.423968  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2665  glycosy hydrolase family protein  32.41 
 
 		 693 aa  53.5  0.000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.472135  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1076  protein kinase  26.4 
 
 		 993 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0548  Kelch repeat-containing protein  25.6 
 
 		 317 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1750  Kelch repeat-containing protein  25.17 
 
 		 450 aa  50.4  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0242608  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3052  YD repeat-containing protein  25.65 
 
 		 2942 aa  50.1  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4892  Kelch repeat-containing protein  30.54 
 
 		 318 aa  50.1  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0109077  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0506  Kelch repeat-containing protein  38.03 
 
 		 430 aa  49.7  0.00009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15262  predicted protein  27.7 
 
 		 336 aa  49.7  0.00009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2777  Kelch repeat-containing protein  23.11 
 
 		 1762 aa  48.9  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0574  kelch repeat-containing protein  29.61 
 
 		 321 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.904037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5187  hypothetical protein  23.48 
 
 		 646 aa  48.1  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.300235 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2899  Kelch repeat-containing protein  25.62 
 
 		 321 aa  47.8  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0025  kelch repeat-containing protein  24.58 
 
 		 667 aa  48.1  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42834  predicted protein  28.29 
 
 		 639 aa  48.1  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0447  kelch  26.02 
 
 		 382 aa  47.4  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.724357  normal  0.84708 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1811  kelch repeat-containing protein  31.33 
 
 		 1744 aa  47.4  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.524443  normal  0.65479 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0584  Kelch repeat-containing protein  29.73 
 
 		 321 aa  46.6  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32404  predicted protein  28.03 
 
 		 494 aa  46.6  0.0008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_23798  predicted protein  26.67 
 
 		 710 aa  45.8  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1953  kelch repeat-containing protein  17.9 
 
 		 460 aa  46.2  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_6820  predicted protein  25.9 
 
 		 236 aa  46.2  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.148371  hitchhiker  0.00500772 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_7153  predicted protein  25.98 
 
 		 180 aa  46.2  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.788569  normal  0.191003 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0935  kelch repeat-containing protein  29.25 
 
 		 990 aa  45.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.35348  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3414  Kelch repeat-containing protein  27.73 
 
 		 1407 aa  45.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1470  Kelch repeat-containing protein  30.38 
 
 		 586 aa  43.9  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00615821  normal  0.710404 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2580  Kelch repeat-containing protein  23.45 
 
 		 557 aa  44.3  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6725  Kelch repeat-containing protein  25.68 
 
 		 698 aa  42.7  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>