72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1811 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_1811  kelch repeat-containing protein  100 
 
 
1744 aa  3475    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.524443  normal  0.65479 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0849  hypothetical protein  33.6 
 
 
957 aa  160  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1489  hypothetical protein  34.15 
 
 
833 aa  156  2.9999999999999998e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.499572 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0819  hypothetical protein  33.98 
 
 
1030 aa  150  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.984927  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1141  hypothetical protein  30.43 
 
 
1088 aa  124  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2642  kelch repeat-containing protein  30.18 
 
 
366 aa  122  9e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.105005  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1745  hypothetical protein  35.1 
 
 
986 aa  116  4.0000000000000004e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0343775  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3595  kelch domain-containing protein  36.32 
 
 
833 aa  104  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.066444 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1750  Kelch repeat-containing protein  32.78 
 
 
450 aa  103  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0242608  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2436  kelch repeat-containing protein  30.63 
 
 
377 aa  104  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.187004  normal  0.0867821 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4136  kelch repeat-containing protein  37.56 
 
 
605 aa  103  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.378672  normal  0.701449 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2552  hypothetical protein  36.18 
 
 
939 aa  101  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108717 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3230  Ig-like, group 2  30.68 
 
 
1245 aa  92.4  7e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16456  normal  0.0136569 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2125  kelch repeat-containing protein  33.33 
 
 
484 aa  92  8e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0602938  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1832  Kelch repeat protein  33.33 
 
 
448 aa  92.4  8e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0801627  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1470  Kelch repeat-containing protein  32.17 
 
 
586 aa  90.1  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00615821  normal  0.710404 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5187  hypothetical protein  30.08 
 
 
646 aa  89  7e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.300235 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3608  hypothetical protein  33.67 
 
 
1008 aa  87.8  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.607062  hitchhiker  0.00290746 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1950  hypothetical protein  34.6 
 
 
651 aa  86.3  0.000000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.134895  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2528  kelch repeat-containing protein  38.46 
 
 
179 aa  86.7  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3370  Kelch repeat-containing protein  30.21 
 
 
642 aa  86.7  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.198533 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1512  hypothetical protein  23.1 
 
 
1203 aa  85.5  0.000000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0987  hypothetical protein  26.23 
 
 
1119 aa  77  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.365158  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1417  hypothetical protein  27.46 
 
 
650 aa  76.3  0.000000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.677247  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0947  hypothetical protein  25.87 
 
 
469 aa  75.1  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.024118  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1490  hypothetical protein  34.75 
 
 
833 aa  75.1  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0766  hypothetical protein  24.69 
 
 
1101 aa  74.3  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3832  hypothetical protein  25.87 
 
 
469 aa  73.6  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0850  hypothetical protein  35.82 
 
 
1183 aa  72.4  0.00000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0447  kelch  32.03 
 
 
382 aa  71.2  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.724357  normal  0.84708 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1874  hypothetical protein  26.04 
 
 
469 aa  70.1  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0205022  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2269  Baseplate J family protein  28.35 
 
 
647 aa  69.3  0.0000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.260983  hitchhiker  0.000831197 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0856  hypothetical protein  37.59 
 
 
503 aa  69.3  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1865  hypothetical protein  24.91 
 
 
1080 aa  68.9  0.0000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3046  hypothetical protein  28.28 
 
 
760 aa  68.9  0.0000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000814337 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5381  hypothetical protein  25.59 
 
 
644 aa  68.2  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0666  hypothetical protein  33.78 
 
 
503 aa  66.2  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1813  hypothetical protein  34.27 
 
 
792 aa  66.2  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.530677  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1872  hypothetical protein  35.66 
 
 
730 aa  65.9  0.000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.214082  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26610  conserved hypothetical protein, phage tail-like region  31.22 
 
 
649 aa  64.7  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.894944 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0859  PKD domain containing protein  24.4 
 
 
488 aa  62.8  0.00000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1457  kelch repeat-containing protein  34.07 
 
 
487 aa  59.7  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0820  hypothetical protein  31.43 
 
 
1168 aa  59.3  0.0000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4392  hypothetical protein  29.78 
 
 
656 aa  58.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.642574  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1136  hypothetical protein  26.7 
 
 
737 aa  55.5  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1097  Kelch repeat-containing protein  26.06 
 
 
1557 aa  54.3  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.612946  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1049  hypothetical protein  31.63 
 
 
653 aa  54.3  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0657  Kelch repeat-containing protein  27.05 
 
 
312 aa  53.9  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.951134  normal  0.331381 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1666  hypothetical protein  24.71 
 
 
676 aa  53.9  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0108  Kelch repeat protein  21.53 
 
 
445 aa  53.5  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000075462  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1844  metallophosphoesterase  25.88 
 
 
776 aa  53.1  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.213592  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2814  hypothetical protein  25.07 
 
 
676 aa  53.1  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2779  kelch repeat-containing protein  31.5 
 
 
334 aa  53.1  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0178297 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1909  hypothetical protein  27.42 
 
 
647 aa  52.8  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.026445  hitchhiker  0.00137339 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2777  Kelch repeat-containing protein  26.97 
 
 
1762 aa  52  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0584  Kelch repeat-containing protein  34.13 
 
 
321 aa  50.8  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2488  hypothetical protein  31.33 
 
 
433 aa  50.8  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0574  kelch repeat-containing protein  34.13 
 
 
321 aa  50.4  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.904037  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4361  kelch repeat-containing protein  41.54 
 
 
717 aa  50.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.423968  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0765  hypothetical protein  27.78 
 
 
649 aa  50.1  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.877447  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0548  Kelch repeat-containing protein  34.4 
 
 
317 aa  49.7  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4352  hypothetical protein  31.22 
 
 
796 aa  49.7  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0800102  normal  0.244923 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0988  hypothetical protein  28.34 
 
 
677 aa  49.3  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0935  kelch repeat-containing protein  25.52 
 
 
990 aa  49.3  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.35348  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1814  hypothetical protein  38.27 
 
 
814 aa  48.9  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80234  carboxymethyltransferase  28.98 
 
 
692 aa  47.4  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.363907 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2812  kelch repeat-containing protein  23.97 
 
 
795 aa  47.8  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.743776  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2527  kelch repeat-containing protein  26.54 
 
 
154 aa  47.8  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3825  hypothetical protein  31.71 
 
 
706 aa  46.6  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.150333  normal  0.0425607 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2524  hypothetical protein  26.29 
 
 
667 aa  46.2  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0923  hypothetical protein  27.65 
 
 
652 aa  45.4  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.566647  normal  0.221882 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2569  transcriptional regulator, LuxR family  24.07 
 
 
508 aa  45.4  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>