15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0397 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0397  kelch repeat-containing protein  100 
 
 		 162 aa  338  1e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0451  kelch repeat-containing protein  71.6 
 
 		 418 aa  265  2e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0493  kelch repeat-containing protein  65.43 
 
 		 376 aa  238  2.9999999999999997e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3966  kelch domain-containing protein  52.83 
 
 		 402 aa  184  6e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.422532  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01192  kelch motif domain protein  50 
 
 		 401 aa  168  2e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.187168  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0984  kelch repeat-containing protein  45.68 
 
 		 358 aa  164  5.9999999999999996e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.998088  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0537  Kelch repeat-containing protein  32 
 
 		 1514 aa  50.4  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0657  Kelch repeat-containing protein  31.07 
 
 		 312 aa  48.1  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.951134  normal  0.331381 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0752  kelch repeat-containing protein  29.36 
 
 		 368 aa  47  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0474  response regulator receiver protein  31.78 
 
 		 471 aa  43.9  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.40168  normal  0.0487434 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0574  kelch repeat-containing protein  27.27 
 
 		 321 aa  43.9  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.904037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0548  Kelch repeat-containing protein  32.91 
 
 		 317 aa  43.5  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0584  Kelch repeat-containing protein  32.91 
 
 		 321 aa  41.2  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2777  Kelch repeat-containing protein  28.7 
 
 		 1762 aa  40.8  0.008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1076  protein kinase  29.66 
 
 		 993 aa  40.4  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>