25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01192 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_01192  kelch motif domain protein  100 
 
 		 401 aa  832    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.187168  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0984  kelch repeat-containing protein  56.63 
 
 		 358 aa  397  1e-109  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.998088  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3966  kelch domain-containing protein  54.95 
 
 		 402 aa  380  1e-104  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.422532  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0451  kelch repeat-containing protein  45.94 
 
 		 418 aa  341  1e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0493  kelch repeat-containing protein  49 
 
 		 376 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0397  kelch repeat-containing protein  50 
 
 		 162 aa  169  9e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0398  hypothetical protein  53.7 
 
 		 77 aa  59.7  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0657  Kelch repeat-containing protein  27.14 
 
 		 312 aa  52  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.951134  normal  0.331381 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1844  metallophosphoesterase  31.86 
 
 		 776 aa  52.4  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.213592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4451  Kelch repeat-containing protein  27.96 
 
 		 326 aa  50.4  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0538307  normal  0.756619 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0537  Kelch repeat-containing protein  26.79 
 
 		 1514 aa  49.7  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2899  Kelch repeat-containing protein  23.94 
 
 		 321 aa  48.9  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0230  hypothetical protein  25.19 
 
 		 339 aa  47.8  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02740  conserved hypothetical protein  29.45 
 
 		 1556 aa  45.4  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0474  response regulator receiver protein  24.61 
 
 		 471 aa  44.3  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.40168  normal  0.0487434 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4728  protein kinase  29.69 
 
 		 1017 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.423258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4434  protein kinase  29.69 
 
 		 1009 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0964194  normal  0.216448 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4348  serine/threonine protein kinase  29.69 
 
 		 1009 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.875806  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2670  glycosy hydrolase family protein  25.65 
 
 		 812 aa  44.7  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52303  protein involved in cell fusion and morphogenesis  26.96 
 
 		 970 aa  44.3  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.248654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1205  N-acetylneuraminic acid mutarotase  24.24 
 
 		 384 aa  44.3  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.9636  normal  0.260259 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1240  N-acetylneuraminic acid mutarotase  24.24 
 
 		 380 aa  43.1  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.187343  normal  0.36338 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1225  N-acetylneuraminic acid mutarotase  23.64 
 
 		 386 aa  42.7  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.293082  normal  0.60575 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1195  N-acetylneuraminic acid mutarotase  23.64 
 
 		 386 aa  42.7  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0752  kelch repeat-containing protein  23.81 
 
 		 368 aa  43.1  0.01  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>