31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3966 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3966  kelch domain-containing protein  100 
 
 		 402 aa  830    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.422532  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01192  kelch motif domain protein  54.95 
 
 		 401 aa  379  1e-104  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.187168  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0984  kelch repeat-containing protein  51.35 
 
 		 358 aa  359  4e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.998088  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0451  kelch repeat-containing protein  45.11 
 
 		 418 aa  320  3e-86  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0493  kelch repeat-containing protein  48 
 
 		 376 aa  319  6e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0397  kelch repeat-containing protein  52.83 
 
 		 162 aa  184  3e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0574  kelch repeat-containing protein  24.32 
 
 		 321 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.904037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4451  Kelch repeat-containing protein  24.47 
 
 		 326 aa  58.9  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0538307  normal  0.756619 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0584  Kelch repeat-containing protein  23.53 
 
 		 321 aa  57  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1844  metallophosphoesterase  23.89 
 
 		 776 aa  57  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.213592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1133  kelch repeat-containing protein  22.22 
 
 		 341 aa  54.7  0.000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0981995 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0474  response regulator receiver protein  25.49 
 
 		 471 aa  53.1  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.40168  normal  0.0487434 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0230  hypothetical protein  22.81 
 
 		 339 aa  53.1  0.000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0537  Kelch repeat-containing protein  26.02 
 
 		 1514 aa  50.4  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1666  kelch repeat-containing protein  24.31 
 
 		 344 aa  50.8  0.00005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0386  kelch repeat-containing protein  24.53 
 
 		 406 aa  50.1  0.00007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0398  hypothetical protein  56.1 
 
 		 77 aa  49.7  0.00009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2899  Kelch repeat-containing protein  25 
 
 		 321 aa  48.9  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0548  Kelch repeat-containing protein  26.74 
 
 		 317 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0752  kelch repeat-containing protein  22.89 
 
 		 368 aa  47  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1240  N-acetylneuraminic acid mutarotase  22.8 
 
 		 380 aa  47  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.187343  normal  0.36338 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1205  N-acetylneuraminic acid mutarotase  22.8 
 
 		 384 aa  47  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.9636  normal  0.260259 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2670  glycosy hydrolase family protein  23.33 
 
 		 812 aa  45.8  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1195  N-acetylneuraminic acid mutarotase  22.89 
 
 		 386 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3426  Kelch repeat-containing protein  23.45 
 
 		 373 aa  45.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.261709  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2812  kelch repeat-containing protein  27.41 
 
 		 795 aa  44.3  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.743776  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4348  serine/threonine protein kinase  25.23 
 
 		 1009 aa  44.3  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.875806  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4434  protein kinase  25.23 
 
 		 1009 aa  44.3  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0964194  normal  0.216448 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4728  protein kinase  25.23 
 
 		 1017 aa  44.3  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.423258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0145  LuxR family transcriptional regulator  22 
 
 		 454 aa  43.5  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0657  Kelch repeat-containing protein  22.45 
 
 		 312 aa  43.1  0.008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.951134  normal  0.331381 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>