24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1457 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_1457  kelch repeat-containing protein  100 
 
 		 487 aa  940    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1750  Kelch repeat-containing protein  35.25 
 
 		 450 aa  107  4e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0242608  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1832  Kelch repeat protein  35.69 
 
 		 448 aa  92.8  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0801627  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2125  kelch repeat-containing protein  38.19 
 
 		 484 aa  92  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0602938  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3370  Kelch repeat-containing protein  32.15 
 
 		 642 aa  84  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.198533 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2642  kelch repeat-containing protein  30.91 
 
 		 366 aa  82.8  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.105005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3595  kelch domain-containing protein  26.97 
 
 		 833 aa  81.3  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.066444 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1470  Kelch repeat-containing protein  34.65 
 
 		 586 aa  79.7  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00615821  normal  0.710404 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5187  hypothetical protein  32.64 
 
 		 646 aa  75.9  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.300235 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2436  kelch repeat-containing protein  33.87 
 
 		 377 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.187004  normal  0.0867821 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4136  kelch repeat-containing protein  29.79 
 
 		 605 aa  75.1  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.378672  normal  0.701449 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3230  Ig-like, group 2  37.34 
 
 		 1245 aa  72  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16456  normal  0.0136569 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1811  kelch repeat-containing protein  27.25 
 
 		 1744 aa  66.2  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.524443  normal  0.65479 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0447  kelch  28.17 
 
 		 382 aa  54.3  0.000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.724357  normal  0.84708 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0859  PKD domain containing protein  23.77 
 
 		 488 aa  52  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0483  hypothetical protein  37.84 
 
 		 831 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.003873 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1426  Galactose oxidase  24.68 
 
 		 593 aa  47  0.0008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2029  kelch repeat-containing protein  40.22 
 
 		 514 aa  47  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.100771  normal  0.762762 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2777  Kelch repeat-containing protein  25.18 
 
 		 1762 aa  46.6  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2524  hypothetical protein  38.61 
 
 		 667 aa  44.7  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0230  hypothetical protein  25.09 
 
 		 339 aa  44.3  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2528  kelch repeat-containing protein  33.33 
 
 		 179 aa  43.5  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0657  Kelch repeat-containing protein  28.57 
 
 		 312 aa  43.5  0.009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.951134  normal  0.331381 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2166  galactose oxidase-like protein  42.5 
 
 		 759 aa  43.5  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.491286  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>