222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0242 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_0242  cellulose-binding family II  100 
 
 		 447 aa  900    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3303  glycoside hydrolase family 62  42.11 
 
 		 436 aa  300  3e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000382833  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4905  Ricin B lectin  50.5 
 
 		 461 aa  256  7e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05267  feruloyl esterase (Eurofung)  44.07 
 
 		 270 aa  207  2e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2830  family 6 glycoside hydrolase  56.86 
 
 		 456 aa  99.8  9e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.426426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  42.24 
 
 		 846 aa  99.8  9e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  48.28 
 
 		 474 aa  95.9  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4194  1, 4-beta cellobiohydrolase  41.67 
 
 		 437 aa  94.7  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.28585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0900  mannan endo-1,4-beta-mannosidase  52.53 
 
 		 453 aa  91.3  3e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.716591  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1040  chitin-binding domain 3 protein  51.02 
 
 		 372 aa  90.1  7e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0290504 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4174  serine/threonine protein kinase  42.55 
 
 		 493 aa  90.1  7e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0993859  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0294  cellulose-binding family II protein  39.04 
 
 		 609 aa  87  6e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.558691  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2447  glycoside hydrolase family 10  46.46 
 
 		 477 aa  86.7  7e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2646  glycoside hydrolase family protein  39.47 
 
 		 812 aa  86.7  9e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00270036  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0935  hypothetical protein  49 
 
 		 847 aa  86.3  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.619972  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3222  cellulose-binding family II  50 
 
 		 673 aa  85.5  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1074  endoglucanase  44 
 
 		 441 aa  82.8  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0857507  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0925  cellulose-binding family II  51.76 
 
 		 460 aa  82.4  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.146256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3146  glycoside hydrolase family 6  44.55 
 
 		 459 aa  81.6  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0538  glycoside hydrolase family 6  45.54 
 
 		 446 aa  81.3  0.00000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.448554 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2229  glycoside hydrolase family 5  37.61 
 
 		 468 aa  80.9  0.00000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1029  cellulose-binding family II  33.12 
 
 		 792 aa  80.1  0.00000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.746729 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4682  cellulose-binding family II  51.14 
 
 		 593 aa  80.1  0.00000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4152  cellulose-binding family II  41.18 
 
 		 449 aa  79.3  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0490  chitin-binding domain 3 protein  48.98 
 
 		 313 aa  77.8  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0145571 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4286  chitin-binding domain 3 protein  41.12 
 
 		 347 aa  76.3  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2024  glycoside hydrolase family 10  39.46 
 
 		 756 aa  75.5  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5719  hypothetical protein  43.68 
 
 		 353 aa  75.9  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3462  cellulose-binding family II protein  46.32 
 
 		 773 aa  74.7  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0281342  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1429  cellulose-binding family II  43.75 
 
 		 471 aa  74.3  0.000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0718119  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3558  glycoside hydrolase family 10  50 
 
 		 820 aa  74.3  0.000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5072  Endo-1,4-beta-xylanase  43.14 
 
 		 451 aa  73.6  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2990  cellulose-binding family II protein  45 
 
 		 366 aa  73.2  0.000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.826139  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5085  polyhydroxybutyrate depolymerase  31.17 
 
 		 313 aa  73.2  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0474117  normal  0.355318 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3461  cellulose-binding family II protein  45.26 
 
 		 486 aa  73.2  0.000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1612  cellulose-binding family II protein  39.81 
 
 		 925 aa  73.2  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2774  cellulose-binding family II  56.41 
 
 		 89 aa  72.8  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.691497  normal  0.395894 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3106  putative lipoprotein  30.99 
 
 		 341 aa  72.8  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0172  chitin-binding domain 3 protein  48 
 
 		 362 aa  72.4  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.808366  hitchhiker  0.00471086 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3037  chitin-binding domain-containing protein  41 
 
 		 360 aa  72  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.245182  normal  0.198398 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2492  endo-1,4-beta-glucanase/xyloglucanase, putative, gly74A  48.54 
 
 		 978 aa  71.2  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0351052  normal  0.027518 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2138  cellulose-binding family II protein  37.2 
 
 		 942 aa  71.2  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.368421  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4516  cellulose-binding family II  41.67 
 
 		 349 aa  71.2  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0447786  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3966  phospholipase/carboxylesterase  26.64 
 
 		 795 aa  70.1  0.00000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2684  glycoside hydrolase family protein  46.96 
 
 		 658 aa  69.7  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.954713  normal  0.0577257 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0295  glycoside hydrolase family protein  40.45 
 
 		 854 aa  69.3  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.271703  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1572  cellulose-binding family II  37.42 
 
 		 702 aa  69.3  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0280577  hitchhiker  0.00883315 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2811  glycoside hydrolase family 5  40.21 
 
 		 478 aa  68.6  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.684544  normal  0.0568731 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3169  cellulose-binding family II  32.56 
 
 		 545 aa  68.6  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.111807 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0324  cellulose-binding family II protein  38 
 
 		 694 aa  67.8  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1219  cellulose-binding family II  40.78 
 
 		 911 aa  67.8  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0349548 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2446  chitin-binding domain 3 protein  39.36 
 
 		 354 aa  67.4  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2040  esterase-like protein  25.7 
 
 		 1002 aa  67.4  0.0000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.400928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3263  chitin-binding domain-containing protein  39.6 
 
 		 358 aa  67.4  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.175629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1183  peptide chain release factor 2  42.45 
 
 		 1042 aa  67  0.0000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.975079  normal  0.154806 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1666  cellulose-binding family II protein  38.82 
 
 		 455 aa  67  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000449243  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1791  cellulose-binding family II  37.5 
 
 		 913 aa  67  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381117  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10685  lipoprotein lpqP  28.5 
 
 		 280 aa  67  0.0000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.132448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1150  glycoside hydrolase family 6  43.16 
 
 		 655 aa  66.6  0.0000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0901469  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1153  glycoside hydrolase family 48  41.67 
 
 		 900 aa  66.6  0.0000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.420841  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2728  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  45.35 
 
 		 499 aa  65.9  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0684443  normal  0.907122 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2470  chitin-binding domain 3 protein  36.97 
 
 		 443 aa  65.1  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.242229  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0175  chitin-binding domain 3 protein  41.49 
 
 		 400 aa  65.5  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00242955 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3487  hypothetical protein  23.83 
 
 		 332 aa  65.1  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2912  1, 4-beta cellobiohydrolase  40.19 
 
 		 491 aa  64.7  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.426935 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0923  cellulose-binding family II  40.45 
 
 		 746 aa  64.3  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0984309 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1573  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  27.51 
 
 		 326 aa  63.5  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1868  cellulose-binding family II  40.24 
 
 		 744 aa  63.5  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3495  cellulose-binding family II  31.16 
 
 		 495 aa  63.5  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3168  cellulose-binding family II  36.84 
 
 		 490 aa  63.5  0.000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0614934 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2372  cellulose-binding family II protein  37.23 
 
 		 842 aa  63.2  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2022  cellulose-binding family II  39.81 
 
 		 743 aa  63.2  0.000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.12733 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4460  polyhydroxybutyrate depolymerase  30.8 
 
 		 322 aa  62.8  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.403398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3854  putative lipoprotein  28.83 
 
 		 336 aa  62.8  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.496382  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7566  hypothetical protein  34.95 
 
 		 173 aa  62.4  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3301  glycoside hydrolase family 62  37.89 
 
 		 485 aa  63.2  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0111017  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2136  glycoside hydrolase family protein  38.37 
 
 		 1128 aa  62.8  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  41.84 
 
 		 628 aa  62.4  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0316  chitin-binding domain 3 protein  43.3 
 
 		 368 aa  62.8  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.289013  hitchhiker  0.00214449 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00180  conserved hypothetical protein  29.61 
 
 		 340 aa  62  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1665  cellulose-binding family II protein  43.75 
 
 		 438 aa  62  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.862652  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13327  esterase lipoprotein lpqC  28.36 
 
 		 304 aa  62  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000167103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1167  hypothetical protein  28.86 
 
 		 471 aa  62  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.428408  normal  0.287821 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1307  cellulose-binding family II  35 
 
 		 175 aa  61.6  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.530275  hitchhiker  0.00098691 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2729  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  38.54 
 
 		 479 aa  62  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400956  normal  0.406938 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0620  cellobiohydrolase  40.2 
 
 		 596 aa  61.6  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.250178  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1240  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  27.33 
 
 		 370 aa  61.2  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.194401 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2781  glycoside hydrolase family 5  36.46 
 
 		 681 aa  61.6  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.183868  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1559  family 62 glycoside hydrolase  39.33 
 
 		 488 aa  61.6  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.622478  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3043  cellulose-binding family II  37.8 
 
 		 774 aa  61.6  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3120  cellulose-binding family II  39.51 
 
 		 439 aa  61.6  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0893071  hitchhiker  0.00025616 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2009  cellulose-binding family II protein  40.23 
 
 		 669 aa  60.8  0.00000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.872108  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0139  glycoside hydrolase family 9  36.46 
 
 		 854 aa  60.8  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.877258 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0302  Lysozyme  41.25 
 
 		 507 aa  60.8  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7565  hypothetical protein  48.53 
 
 		 359 aa  60.5  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1651  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  26.54 
 
 		 323 aa  60.5  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0627752  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0633  hypothetical protein  34.83 
 
 		 436 aa  60.5  0.00000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.746615  normal  0.741737 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3519  1, 4-beta cellobiohydrolase  42.17 
 
 		 588 aa  60.1  0.00000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1493  cellulose-binding domain-containing protein  36.17 
 
 		 1055 aa  58.5  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.498527  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1182  hypothetical protein  38.46 
 
 		 371 aa  58.5  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.104267 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>