123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1651 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_1651  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  100 
 
 
323 aa  662    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0627752  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1573  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  85.58 
 
 
326 aa  582  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2301  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  91.57 
 
 
232 aa  345  7e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1969  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  32.75 
 
 
363 aa  129  6e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0935555 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3854  putative lipoprotein  37.56 
 
 
336 aa  124  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.496382  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1493  phospholipase/Carboxylesterase  32.45 
 
 
317 aa  119  7e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.030471  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0373  polyhydroxybutyrate depolymerase  35.44 
 
 
357 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0880654  hitchhiker  0.00622899 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2408  carbohydrate esterase family 1 protein  28.82 
 
 
316 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.211104  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1590  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  31.54 
 
 
353 aa  111  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255211  normal  0.12664 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4460  polyhydroxybutyrate depolymerase  30.91 
 
 
322 aa  109  7.000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.403398  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1400  phospholipase/Carboxylesterase  30.21 
 
 
325 aa  107  4e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10685  lipoprotein lpqP  33.61 
 
 
280 aa  107  4e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.132448  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5085  polyhydroxybutyrate depolymerase  32.03 
 
 
313 aa  106  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0474117  normal  0.355318 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1385  putative Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  27.34 
 
 
464 aa  102  1e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.516849  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3217  hypothetical protein  34.59 
 
 
282 aa  101  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3106  putative lipoprotein  31.09 
 
 
341 aa  101  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2752  phospholipase/carboxylesterase  30.38 
 
 
309 aa  101  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1953  putative hydrolase  30.8 
 
 
308 aa  100  5e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0001445  hitchhiker  0.00199711 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07050  hypothetical protein  29.86 
 
 
322 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3966  phospholipase/carboxylesterase  28.62 
 
 
795 aa  99  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5398  hypothetical protein  29.64 
 
 
302 aa  98.2  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.330044  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0579  esterase, putative  28.14 
 
 
324 aa  96.7  5e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0072  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  35.06 
 
 
392 aa  94.7  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0646  hypothetical protein  30.66 
 
 
322 aa  94  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.399454  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1204  phospholipase/carboxylesterase  28.43 
 
 
335 aa  92.4  9e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.299935  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7236  putative LpqP (hydrolase/esterase)  35.92 
 
 
405 aa  91.3  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0397136  normal  0.31443 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2261  putative esterase/lipase/thioesterase  30.36 
 
 
361 aa  90.1  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556081  normal  0.0820217 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1290  hypothetical protein  34.38 
 
 
305 aa  88.6  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0297  lpqC, putative  28.67 
 
 
306 aa  87  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.433259  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13327  esterase lipoprotein lpqC  32.97 
 
 
304 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000167103  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0726  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  29.81 
 
 
462 aa  83.6  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.401494  normal  0.100919 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3891  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  29.31 
 
 
298 aa  82.8  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.947481  normal  0.780646 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3127  phospholipase/Carboxylesterase  27.52 
 
 
314 aa  80.5  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.539584 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3566  phospholipase/carboxylesterase  25.98 
 
 
331 aa  79.7  0.00000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1167  hypothetical protein  26.53 
 
 
471 aa  79.3  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.428408  normal  0.287821 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1240  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  28.62 
 
 
370 aa  77.8  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.194401 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0967  putative esterase  32.74 
 
 
244 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.127871 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3576  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  26.98 
 
 
451 aa  75.9  0.0000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.875939  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2040  esterase-like protein  28.16 
 
 
1002 aa  75.1  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.400928  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_92192  predicted protein  29.17 
 
 
486 aa  75.5  0.000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.865019  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3487  hypothetical protein  27.3 
 
 
332 aa  74.7  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4595  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  31.3 
 
 
344 aa  73.2  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3303  glycoside hydrolase family 62  26.55 
 
 
436 aa  67  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000382833  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4905  Ricin B lectin  30.16 
 
 
461 aa  65.9  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00180  conserved hypothetical protein  28.57 
 
 
340 aa  65.5  0.000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33500  esterase, poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  25.74 
 
 
429 aa  65.1  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0713  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  28.57 
 
 
287 aa  63.9  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2906  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  25.43 
 
 
659 aa  63.9  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.686004  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3488  hypothetical protein  24.48 
 
 
447 aa  63.5  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1285  esterase, PHB depolymerase family  23.08 
 
 
367 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.29485  normal  0.060549 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3270  esterase, PHB depolymerase  23.72 
 
 
372 aa  62  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.67973 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3198  putative polyhydroxybutyrate depolymerase  27.18 
 
 
279 aa  61.6  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.396095  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0080  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  26.03 
 
 
286 aa  61.6  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2650  hypothetical protein  25.2 
 
 
355 aa  61.2  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.376354  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4027  PHB depolymerase family esterase  32.2 
 
 
387 aa  60.1  0.00000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.391886 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0242  cellulose-binding family II  25.27 
 
 
447 aa  59.7  0.00000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3857  PHB depolymerase family esterase  24.65 
 
 
414 aa  58.5  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26429  predicted protein  30.97 
 
 
363 aa  58.2  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000229905  normal  0.222049 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3990  Poly (3-hydroxybutyrate ) depolymerase  31.3 
 
 
396 aa  57  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1536  putative polyhydroxybutyrate depolymerase  26.72 
 
 
276 aa  57  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.26582  normal  0.221996 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2931  phospholipase/carboxylesterase  27.81 
 
 
222 aa  57  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05267  feruloyl esterase (Eurofung)  30.54 
 
 
270 aa  56.6  0.0000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3485  hypothetical protein  28.19 
 
 
269 aa  57  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1955  phospholipase/carboxylesterase  29.14 
 
 
222 aa  56.2  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4230  phospholipase/Carboxylesterase  37.84 
 
 
268 aa  55.5  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.58568  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2065  esterase, PHB depolymerase  25.2 
 
 
359 aa  54.3  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0523522  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1990  esterase, PHB depolymerase family  29.07 
 
 
406 aa  54.3  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000642829  normal  0.085302 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1211  esterase, PHB depolymerase family  25.42 
 
 
312 aa  54.7  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0349548 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2991  PHB depolymerase family esterase  26.94 
 
 
419 aa  53.1  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1020  hypothetical protein  35.06 
 
 
260 aa  53.1  0.000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2820  esterase, PHB depolymerase family  29.7 
 
 
352 aa  52.4  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000611867  hitchhiker  0.00921779 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3819  PHB depolymerase family esterase  26.03 
 
 
419 aa  52  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0568  esterase, PHB depolymerase family  28.47 
 
 
395 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1945  esterase, PHB depolymerase family  27.5 
 
 
344 aa  52.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.198099  normal  0.0353299 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2268  esterase, PHB depolymerase family  25.09 
 
 
344 aa  50.8  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.493113  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2056  esterase, PHB depolymerase family  24.19 
 
 
334 aa  50.8  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.10962  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3344  PHB depolymerase family esterase  29.88 
 
 
429 aa  50.4  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.335799  normal  0.68562 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4127  esterase, PHB depolymerase family  25.52 
 
 
419 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0711  esterase, PHB depolymerase  28.07 
 
 
392 aa  49.3  0.00008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.612274  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2257  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  27.47 
 
 
270 aa  49.3  0.00009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4749  esterase, PHB depolymerase family  27.97 
 
 
343 aa  49.3  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0364  putative polyhydroxybutyrate depolymerase  36.25 
 
 
265 aa  48.5  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.81916  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2149  hypothetical protein  24.01 
 
 
343 aa  48.1  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00000536767  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0137  esterase, PHB depolymerase  26.35 
 
 
392 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4087  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase  32 
 
 
556 aa  48.5  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.779957  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5409  phospholipase/Carboxylesterase  31.74 
 
 
468 aa  47.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.301225 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1969  esterase, PHB depolymerase  26 
 
 
373 aa  47.4  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.127109  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3823  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  26.8 
 
 
374 aa  47.4  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5706  PHB depolymerase family esterase  25.42 
 
 
438 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.137114  hitchhiker  0.00469436 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5020  phospholipase/Carboxylesterase  36.59 
 
 
563 aa  47.4  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.780509  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5249  phospholipase/carboxylesterase  48.94 
 
 
243 aa  47.4  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0855258  normal  0.417619 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3289  PHB depolymerase family esterase  30.15 
 
 
683 aa  47  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0658  PHB depolymerase family esterase  30.15 
 
 
683 aa  46.6  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.726264 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1940  PHB depolymerase family esterase  28.8 
 
 
433 aa  46.6  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4883  PHB depolymerase family esterase  24.06 
 
 
369 aa  46.2  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.103512  hitchhiker  0.0011428 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0523  putative esterase  33.85 
 
 
296 aa  46.2  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00718904  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26790  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  28.57 
 
 
290 aa  45.8  0.0009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.330263 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6990  phospholipase/Carboxylesterase  22.17 
 
 
276 aa  45.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0030979 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0371  esterase, PHB depolymerase  30.53 
 
 
394 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6025  PHB depolymerase family esterase  29.03 
 
 
416 aa  45.4  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.950963  normal  0.103792 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>