65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1240 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1240  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  100 
 
 		 370 aa  734    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.194401 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2261  putative esterase/lipase/thioesterase  61.48 
 
 		 361 aa  309  4e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556081  normal  0.0820217 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2408  carbohydrate esterase family 1 protein  28.92 
 
 		 316 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.211104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3966  phospholipase/carboxylesterase  32.64 
 
 		 795 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1493  phospholipase/Carboxylesterase  28.29 
 
 		 317 aa  117  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.030471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5085  polyhydroxybutyrate depolymerase  31.23 
 
 		 313 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0474117  normal  0.355318 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1167  hypothetical protein  32.47 
 
 		 471 aa  110  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.428408  normal  0.287821 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3576  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  32.63 
 
 		 451 aa  108  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.875939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1204  phospholipase/carboxylesterase  30.28 
 
 		 335 aa  100  5e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.299935  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4460  polyhydroxybutyrate depolymerase  30.46 
 
 		 322 aa  92.8  8e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.403398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3487  hypothetical protein  26.64 
 
 		 332 aa  89.7  6e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10685  lipoprotein lpqP  32.23 
 
 		 280 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.132448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0373  polyhydroxybutyrate depolymerase  34.6 
 
 		 357 aa  89.4  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0880654  hitchhiker  0.00622899 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1385  putative Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  26.64 
 
 		 464 aa  87  5e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.516849  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3854  putative lipoprotein  33.85 
 
 		 336 aa  85.1  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.496382  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13327  esterase lipoprotein lpqC  30.82 
 
 		 304 aa  84  0.000000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000167103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1590  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  28.42 
 
 		 353 aa  80.5  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255211  normal  0.12664 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1573  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  27.76 
 
 		 326 aa  79.7  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1400  phospholipase/Carboxylesterase  23.86 
 
 		 325 aa  79.3  0.00000000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1651  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  28.22 
 
 		 323 aa  77.8  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0627752  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07050  hypothetical protein  30.1 
 
 		 322 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0072  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  34.38 
 
 		 392 aa  75.1  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3106  putative lipoprotein  25.81 
 
 		 341 aa  74.7  0.000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7236  putative LpqP (hydrolase/esterase)  37.5 
 
 		 405 aa  74.3  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0397136  normal  0.31443 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3488  hypothetical protein  22.9 
 
 		 447 aa  73.6  0.000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0967  putative esterase  30.74 
 
 		 244 aa  73.2  0.000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.127871 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00180  conserved hypothetical protein  27.67 
 
 		 340 aa  72.8  0.000000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4905  Ricin B lectin  31.32 
 
 		 461 aa  72.4  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3217  hypothetical protein  30 
 
 		 282 aa  70.1  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3127  phospholipase/Carboxylesterase  26.04 
 
 		 314 aa  68.9  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.539584 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0646  hypothetical protein  29.35 
 
 		 322 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.399454  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1969  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  28.24 
 
 		 363 aa  63.9  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0935555 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1953  putative hydrolase  28.52 
 
 		 308 aa  63.2  0.000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0001445  hitchhiker  0.00199711 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3891  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  26.43 
 
 		 298 aa  62.4  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.947481  normal  0.780646 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05267  feruloyl esterase (Eurofung)  27.46 
 
 		 270 aa  62  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2301  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  34.27 
 
 		 232 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3566  phospholipase/carboxylesterase  29.63 
 
 		 331 aa  62  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0242  cellulose-binding family II  27.33 
 
 		 447 aa  60.5  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0726  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  31.2 
 
 		 462 aa  58.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.401494  normal  0.100919 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2752  phospholipase/carboxylesterase  28.7 
 
 		 309 aa  57.4  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3303  glycoside hydrolase family 62  25.57 
 
 		 436 aa  57  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000382833  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1536  putative polyhydroxybutyrate depolymerase  27.71 
 
 		 276 aa  55.8  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.26582  normal  0.221996 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1290  hypothetical protein  30.77 
 
 		 305 aa  55.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1211  esterase, PHB depolymerase family  30.47 
 
 		 312 aa  52  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0349548 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2056  esterase, PHB depolymerase family  31.3 
 
 		 334 aa  50.8  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.10962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2040  esterase-like protein  22.69 
 
 		 1002 aa  49.7  0.00009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.400928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0063  phospholipase/carboxylesterase  29.82 
 
 		 227 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.982882  normal  0.670301 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5398  hypothetical protein  23.56 
 
 		 302 aa  48.9  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.330044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5584  phospholipase/carboxylesterase  31.28 
 
 		 231 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3270  esterase, PHB depolymerase  25.73 
 
 		 372 aa  47  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.67973 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0080  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  22.39 
 
 		 286 aa  46.6  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6802  esterase, PHB depolymerase family  33.59 
 
 		 398 aa  46.6  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0419644  decreased coverage  0.000000125026 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1773  phospholipase/Carboxylesterase  30.06 
 
 		 239 aa  46.2  0.0009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0713  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  29.33 
 
 		 287 aa  45.8  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2846  esterase, PHB depolymerase  27.27 
 
 		 398 aa  45.8  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.222858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0579  esterase, putative  26.37 
 
 		 324 aa  45.8  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6025  PHB depolymerase family esterase  30.1 
 
 		 416 aa  45.1  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.950963  normal  0.103792 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4883  PHB depolymerase family esterase  32.81 
 
 		 369 aa  45.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.103512  hitchhiker  0.0011428 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4839  phospholipase/Carboxylesterase  29.17 
 
 		 232 aa  44.7  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3857  PHB depolymerase family esterase  26.83 
 
 		 414 aa  44.3  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0595  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  34.51 
 
 		 364 aa  43.9  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0822  hypothetical protein  27.32 
 
 		 565 aa  43.9  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.390074 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0297  lpqC, putative  27.67 
 
 		 306 aa  43.9  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.433259  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1208  phospholipase/carboxylesterase  29.53 
 
 		 239 aa  43.9  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.12535 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1148  phospholipase/Carboxylesterase  29.24 
 
 		 239 aa  43.9  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>