185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2774 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2774  cellulose-binding family II  100 
 
 
89 aa  174  3e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.691497  normal  0.395894 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4516  cellulose-binding family II  58.43 
 
 
349 aa  93.2  9e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0447786  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2633  PHB depolymerase family esterase  57.78 
 
 
422 aa  89  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.655829 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2830  family 6 glycoside hydrolase  62.03 
 
 
456 aa  89  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.426426  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  52.17 
 
 
474 aa  83.2  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0925  cellulose-binding family II  47.25 
 
 
460 aa  76.3  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.146256  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3037  chitin-binding domain-containing protein  51.11 
 
 
360 aa  75.5  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.245182  normal  0.198398 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0172  chitin-binding domain 3 protein  56.98 
 
 
362 aa  75.9  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.808366  hitchhiker  0.00471086 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1040  chitin-binding domain 3 protein  50 
 
 
372 aa  75.9  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0290504 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0900  mannan endo-1,4-beta-mannosidase  47.19 
 
 
453 aa  74.7  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.716591  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0935  hypothetical protein  48.35 
 
 
847 aa  74.7  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.619972  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3603  cellulose-binding family II  51.11 
 
 
460 aa  74.7  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.131796  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4152  cellulose-binding family II  48.28 
 
 
449 aa  73.9  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4682  cellulose-binding family II  49.41 
 
 
593 aa  73.2  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0242  cellulose-binding family II  56.41 
 
 
447 aa  72.4  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6407  Cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  52.7 
 
 
448 aa  72.4  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0259803 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3263  chitin-binding domain-containing protein  50 
 
 
358 aa  72.4  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.175629  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3222  cellulose-binding family II  49.44 
 
 
673 aa  72  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4174  serine/threonine protein kinase  48.31 
 
 
493 aa  72.4  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0993859  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5072  Endo-1,4-beta-xylanase  47.19 
 
 
451 aa  70.9  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1572  cellulose-binding family II  53.95 
 
 
702 aa  69.7  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0280577  hitchhiker  0.00883315 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0490  chitin-binding domain 3 protein  54.12 
 
 
313 aa  69.3  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0145571 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3169  cellulose-binding family II  50 
 
 
545 aa  68.6  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.111807 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1612  cellulose-binding family II protein  43.18 
 
 
925 aa  68.2  0.00000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1429  cellulose-binding family II  47.73 
 
 
471 aa  66.2  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0718119  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2441  Endo-1,4-beta-xylanase  48.86 
 
 
474 aa  66.6  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.637326  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3558  glycoside hydrolase family 10  54.65 
 
 
820 aa  66.6  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1074  endoglucanase  47.19 
 
 
441 aa  65.5  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0857507  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0620  cellobiohydrolase  43.59 
 
 
596 aa  64.7  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.250178  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5719  hypothetical protein  49.45 
 
 
353 aa  64.3  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0294  cellulose-binding family II protein  39.08 
 
 
609 aa  63.5  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.558691  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0538  glycoside hydrolase family 6  46.34 
 
 
446 aa  63.5  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.448554 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3168  cellulose-binding family II  44.94 
 
 
490 aa  63.2  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0614934 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4286  chitin-binding domain 3 protein  43.48 
 
 
347 aa  63.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0780  PHB depolymerase family esterase  45.88 
 
 
436 aa  62.4  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1666  cellulose-binding family II protein  40.54 
 
 
455 aa  62.4  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000449243  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2447  glycoside hydrolase family 10  42.7 
 
 
477 aa  62.4  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  42.55 
 
 
846 aa  61.6  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3461  cellulose-binding family II protein  43.02 
 
 
486 aa  62  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0338  cellulose-binding family II  44.83 
 
 
454 aa  61.2  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.247648  normal  0.0804617 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2913  1, 4-beta cellobiohydrolase  44.58 
 
 
469 aa  60.8  0.000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.489381  normal  0.473063 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0175  chitin-binding domain 3 protein  44.87 
 
 
400 aa  60.8  0.000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00242955 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2009  cellulose-binding family II protein  40.79 
 
 
669 aa  60.5  0.000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.872108  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2492  endo-1,4-beta-glucanase/xyloglucanase, putative, gly74A  53.76 
 
 
978 aa  60.8  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0351052  normal  0.027518 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1791  cellulose-binding family II  44.19 
 
 
913 aa  60.5  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381117  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2024  glycoside hydrolase family 10  39.08 
 
 
756 aa  59.7  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4558  glycoside hydrolase family 9  40 
 
 
864 aa  60.1  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213075  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3146  glycoside hydrolase family 6  42.86 
 
 
459 aa  59.3  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0388  PHB depolymerase family esterase  44.59 
 
 
442 aa  59.3  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.140919  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7565  hypothetical protein  47.78 
 
 
359 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2792  cellulose-binding family II  42.86 
 
 
681 aa  59.3  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2990  cellulose-binding family II protein  46.91 
 
 
366 aa  58.5  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.826139  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2136  glycoside hydrolase family protein  39.76 
 
 
1128 aa  58.5  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2646  glycoside hydrolase family protein  40 
 
 
812 aa  58.2  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00270036  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2912  1, 4-beta cellobiohydrolase  45.71 
 
 
491 aa  58.5  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.426935 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3462  cellulose-binding family II protein  40.7 
 
 
773 aa  58.2  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0281342  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2586  Endo-1,4-beta-xylanase  42.05 
 
 
454 aa  58.2  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2728  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  42.5 
 
 
499 aa  58.2  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0684443  normal  0.907122 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1493  cellulose-binding domain-containing protein  41.98 
 
 
1055 aa  57.8  0.00000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.498527  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2244  chitin-binding domain 3 protein  42.05 
 
 
351 aa  57.8  0.00000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.620526  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1219  cellulose-binding family II  42.27 
 
 
911 aa  57.4  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0349548 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1183  peptide chain release factor 2  42.86 
 
 
1042 aa  57.4  0.00000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.975079  normal  0.154806 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0735  glycoside hydrolase family 6  40 
 
 
623 aa  57.4  0.00000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0698323  normal  0.806764 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2509  esterase, PHB depolymerase family  39.19 
 
 
489 aa  57  0.00000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.821888  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1830  glycoside hydrolase family 5  38.1 
 
 
543 aa  57  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0179  PHB depolymerase family esterase  40.91 
 
 
656 aa  56.6  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.18087  normal  0.428012 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0180  glycoside hydrolase family protein  41.38 
 
 
678 aa  56.2  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.297284  normal  0.254971 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2446  chitin-binding domain 3 protein  36.26 
 
 
354 aa  56.2  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2684  glycoside hydrolase family protein  42.86 
 
 
658 aa  56.6  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.954713  normal  0.0577257 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0295  glycoside hydrolase family protein  39.76 
 
 
854 aa  56.6  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.271703  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1831  cellulose-binding family II  40.66 
 
 
374 aa  56.6  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8171  endo-chitinase, putative, chi18D  40.28 
 
 
532 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.714461 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  39.77 
 
 
743 aa  56.6  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2447  chitin-binding domain 3 protein  38.55 
 
 
389 aa  56.2  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0284927 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1897  glycoside hydrolase family 5  44.05 
 
 
597 aa  55.5  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.754177  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1134  glycoside hydrolase family 48  40 
 
 
842 aa  56.2  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2138  family 48 glycoside hydrolase  41.79 
 
 
785 aa  55.5  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.497206  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1150  glycoside hydrolase family 6  45.57 
 
 
655 aa  55.8  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0901469  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0905  glycoside hydrolase family 10  43.06 
 
 
690 aa  55.8  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.506442  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4194  1, 4-beta cellobiohydrolase  40 
 
 
437 aa  55.5  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.28585  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  41.67 
 
 
628 aa  55.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2811  glycoside hydrolase family 5  42.05 
 
 
478 aa  56.2  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.684544  normal  0.0568731 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2229  glycoside hydrolase family 5  46.91 
 
 
468 aa  55.8  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4288  cellulose-binding family II  39.73 
 
 
420 aa  55.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.016596 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1959  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  45.21 
 
 
984 aa  55.5  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1153  glycoside hydrolase family 48  45.57 
 
 
900 aa  55.1  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.420841  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2449  1, 4-beta cellobiohydrolase  37.65 
 
 
590 aa  55.5  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3105  glycoside hydrolase family 48  41.67 
 
 
854 aa  54.7  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0252708  hitchhiker  0.000502295 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0064  putative secreted beta-mannosidase  40 
 
 
561 aa  54.7  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000582452  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0731  cellulose-binding family II  38.55 
 
 
934 aa  54.3  0.0000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3519  1, 4-beta cellobiohydrolase  39.53 
 
 
588 aa  53.9  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0936  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  41.46 
 
 
979 aa  53.9  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  41.1 
 
 
688 aa  53.5  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  42.25 
 
 
778 aa  52.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4134  cellulose-binding family II  43.18 
 
 
536 aa  52.8  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.16612  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0474  glycoside hydrolase family 11  42.25 
 
 
494 aa  53.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3001  chitinase  38.67 
 
 
2310 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426725  normal  0.0460481 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0316  chitin-binding domain 3 protein  44.32 
 
 
368 aa  52.4  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.289013  hitchhiker  0.00214449 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2820  glycoside hydrolase family protein  40 
 
 
633 aa  52.8  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000391085  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0923  cellulose-binding family II  34.94 
 
 
746 aa  52.4  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0984309 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>