103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13327 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_13327  esterase lipoprotein lpqC  100 
 
 
304 aa  608  1e-173  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000167103  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1400  phospholipase/Carboxylesterase  34.41 
 
 
325 aa  196  3e-49  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5085  polyhydroxybutyrate depolymerase  37.3 
 
 
313 aa  160  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0474117  normal  0.355318 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2408  carbohydrate esterase family 1 protein  32.36 
 
 
316 aa  154  2e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.211104  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10685  lipoprotein lpqP  36.81 
 
 
280 aa  152  7e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.132448  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1493  phospholipase/Carboxylesterase  33.92 
 
 
317 aa  146  4.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.030471  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3854  putative lipoprotein  38.15 
 
 
336 aa  139  6e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.496382  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0579  esterase, putative  33.69 
 
 
324 aa  137  2e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3217  hypothetical protein  34.9 
 
 
282 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1590  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  34.16 
 
 
353 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255211  normal  0.12664 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4460  polyhydroxybutyrate depolymerase  34.88 
 
 
322 aa  126  5e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.403398  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0967  putative esterase  34.96 
 
 
244 aa  126  6e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.127871 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1969  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  35.38 
 
 
363 aa  122  8e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0935555 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3127  phospholipase/Carboxylesterase  33.93 
 
 
314 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.539584 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1953  putative hydrolase  31.85 
 
 
308 aa  120  3e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0001445  hitchhiker  0.00199711 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07050  hypothetical protein  31.94 
 
 
322 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0373  polyhydroxybutyrate depolymerase  33.96 
 
 
357 aa  116  5e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0880654  hitchhiker  0.00622899 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0646  hypothetical protein  32.99 
 
 
322 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.399454  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3106  putative lipoprotein  33.33 
 
 
341 aa  115  8.999999999999998e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1204  phospholipase/carboxylesterase  33.6 
 
 
335 aa  114  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.299935  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3891  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  28.67 
 
 
298 aa  111  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.947481  normal  0.780646 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4595  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  33.7 
 
 
344 aa  109  6e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3966  phospholipase/carboxylesterase  28.11 
 
 
795 aa  104  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0072  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  37.35 
 
 
392 aa  102  6e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1167  hypothetical protein  32.14 
 
 
471 aa  97.8  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.428408  normal  0.287821 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2261  putative esterase/lipase/thioesterase  30.45 
 
 
361 aa  95.1  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556081  normal  0.0820217 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2752  phospholipase/carboxylesterase  30.83 
 
 
309 aa  94.4  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5398  hypothetical protein  29.91 
 
 
302 aa  94.7  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.330044  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3566  phospholipase/carboxylesterase  29.48 
 
 
331 aa  93.6  3e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1573  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  30.65 
 
 
326 aa  92.4  8e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7236  putative LpqP (hydrolase/esterase)  35.57 
 
 
405 aa  92  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0397136  normal  0.31443 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0297  lpqC, putative  32.5 
 
 
306 aa  91.7  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.433259  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0726  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  30.69 
 
 
462 aa  89.7  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.401494  normal  0.100919 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1651  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  28.37 
 
 
323 aa  88.2  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0627752  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3487  hypothetical protein  24.38 
 
 
332 aa  86.7  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1385  putative Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  23.72 
 
 
464 aa  85.5  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.516849  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1240  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  30.82 
 
 
370 aa  80.5  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.194401 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00180  conserved hypothetical protein  27.73 
 
 
340 aa  79.3  0.00000000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1536  putative polyhydroxybutyrate depolymerase  30.29 
 
 
276 aa  79  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.26582  normal  0.221996 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2301  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  35.71 
 
 
232 aa  77.4  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2040  esterase-like protein  26.54 
 
 
1002 aa  77  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.400928  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3485  hypothetical protein  35.59 
 
 
269 aa  76.6  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05267  feruloyl esterase (Eurofung)  30.08 
 
 
270 aa  74.7  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3488  hypothetical protein  28.79 
 
 
447 aa  74.3  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1290  hypothetical protein  33.33 
 
 
305 aa  73.2  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0242  cellulose-binding family II  28.36 
 
 
447 aa  72.4  0.000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3576  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  27.78 
 
 
451 aa  71.2  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.875939  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0080  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  29.66 
 
 
286 aa  68.6  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_92192  predicted protein  23.35 
 
 
486 aa  67.4  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.865019  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2257  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  27.09 
 
 
270 aa  63.9  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26429  predicted protein  36.17 
 
 
363 aa  63.5  0.000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000229905  normal  0.222049 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1285  esterase, PHB depolymerase family  25.76 
 
 
367 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.29485  normal  0.060549 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4905  Ricin B lectin  26.92 
 
 
461 aa  58.9  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3303  glycoside hydrolase family 62  28.33 
 
 
436 aa  58.5  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000382833  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3198  putative polyhydroxybutyrate depolymerase  28.98 
 
 
279 aa  57.8  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.396095  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0713  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  27.01 
 
 
287 aa  58.2  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0364  putative polyhydroxybutyrate depolymerase  26.38 
 
 
265 aa  57  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.81916  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2633  PHB depolymerase family esterase  32.39 
 
 
422 aa  56.6  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.655829 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0780  PHB depolymerase family esterase  25.18 
 
 
436 aa  56.6  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0493  esterase, PHB depolymerase family  25.91 
 
 
378 aa  55.8  0.0000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2906  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  27.08 
 
 
659 aa  54.3  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.686004  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3990  Poly (3-hydroxybutyrate ) depolymerase  26.56 
 
 
396 aa  53.5  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3270  esterase, PHB depolymerase  25.74 
 
 
372 aa  53.5  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.67973 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4027  PHB depolymerase family esterase  26.41 
 
 
387 aa  53.5  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.391886 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3959  esterase, PHB depolymerase family  30.61 
 
 
423 aa  53.5  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2991  PHB depolymerase family esterase  30.82 
 
 
419 aa  52  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2770  PHB depolymerase family esterase  26.53 
 
 
544 aa  52.4  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2056  esterase, PHB depolymerase family  25.36 
 
 
334 aa  51.6  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.10962  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3591  esterase, PHB depolymerase family  26.53 
 
 
518 aa  51.6  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229813  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4958  esterase, PHB depolymerase family  24.91 
 
 
451 aa  51.6  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.348858  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0209  esterase, PHB depolymerase family  27 
 
 
342 aa  51.6  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4230  phospholipase/Carboxylesterase  27.33 
 
 
268 aa  51.2  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.58568  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3660  PHB depolymerase family esterase  26.17 
 
 
381 aa  50.4  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.741995  normal  0.231581 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33500  esterase, poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  24.67 
 
 
429 aa  50.8  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1368  phospholipase/Carboxylesterase  27.27 
 
 
239 aa  49.7  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2204  esterase, PHB depolymerase  28.43 
 
 
367 aa  49.7  0.00007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.667331  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5166  putative esterase  36.67 
 
 
295 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.140239 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0388  PHB depolymerase family esterase  27.91 
 
 
442 aa  48.5  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.140919  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3253  putative esterase  36.67 
 
 
295 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5115  putative esterase  36.67 
 
 
295 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.913321  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4526  putative esterase  37.07 
 
 
286 aa  46.6  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5051  putative esterase  37.07 
 
 
282 aa  46.6  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1173  esterase, PHB depolymerase family  25.3 
 
 
410 aa  46.6  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1208  phospholipase/carboxylesterase  26.62 
 
 
239 aa  46.6  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.12535 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3857  PHB depolymerase family esterase  27.63 
 
 
414 aa  46.2  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0523  putative esterase  36.21 
 
 
296 aa  45.8  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00718904  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2713  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  28.85 
 
 
492 aa  45.4  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.381426  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1020  hypothetical protein  29.24 
 
 
260 aa  44.7  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6025  PHB depolymerase family esterase  27.24 
 
 
416 aa  44.3  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.950963  normal  0.103792 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1211  esterase, PHB depolymerase family  25.97 
 
 
312 aa  44.7  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0349548 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2287  phospholipase/Carboxylesterase  30.06 
 
 
263 aa  44.3  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.191504  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1547  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  28.21 
 
 
492 aa  43.5  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2245  esterase, PHB depolymerase family  31.86 
 
 
432 aa  43.1  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.386893 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0824  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  28.21 
 
 
492 aa  43.5  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0168099  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1740  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  28.21 
 
 
492 aa  43.5  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.548806  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1342  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase precursor  28.21 
 
 
492 aa  43.5  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.968046  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0529  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  28.21 
 
 
492 aa  43.5  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0624  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase precursor  28.21 
 
 
492 aa  43.5  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.520528  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3048  phospholipase/Carboxylesterase  24.64 
 
 
405 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3823  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  30.23 
 
 
374 aa  43.1  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>