163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10685 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_10685  lipoprotein lpqP  100 
 
 		 280 aa  570  1e-161  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.132448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5085  polyhydroxybutyrate depolymerase  47.32 
 
 		 313 aa  281  8.000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0474117  normal  0.355318 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4460  polyhydroxybutyrate depolymerase  48.08 
 
 		 322 aa  262  4e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.403398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1590  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  49.45 
 
 		 353 aa  262  4e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255211  normal  0.12664 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3854  putative lipoprotein  40.23 
 
 		 336 aa  149  7e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.496382  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0373  polyhydroxybutyrate depolymerase  42.11 
 
 		 357 aa  141  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0880654  hitchhiker  0.00622899 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13327  esterase lipoprotein lpqC  36.81 
 
 		 304 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000167103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1493  phospholipase/Carboxylesterase  38.46 
 
 		 317 aa  130  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.030471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0646  hypothetical protein  35.31 
 
 		 322 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.399454  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1953  putative hydrolase  36.25 
 
 		 308 aa  125  6e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0001445  hitchhiker  0.00199711 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07050  hypothetical protein  35.51 
 
 		 322 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1400  phospholipase/Carboxylesterase  28.52 
 
 		 325 aa  117  3e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1290  hypothetical protein  35.47 
 
 		 305 aa  115  6e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0080  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  32.21 
 
 		 286 aa  111  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1573  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  34.43 
 
 		 326 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2408  carbohydrate esterase family 1 protein  29.22 
 
 		 316 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.211104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7236  putative LpqP (hydrolase/esterase)  35.78 
 
 		 405 aa  110  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0397136  normal  0.31443 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3217  hypothetical protein  41.89 
 
 		 282 aa  108  7.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1651  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  33.61 
 
 		 323 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0627752  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1969  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  31.47 
 
 		 363 aa  106  5e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0935555 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0072  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  31.86 
 
 		 392 aa  103  3e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3106  putative lipoprotein  32.57 
 
 		 341 aa  103  4e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3127  phospholipase/Carboxylesterase  31.6 
 
 		 314 aa  100  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.539584 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0297  lpqC, putative  38.07 
 
 		 306 aa  99.8  4e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.433259  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1167  hypothetical protein  32.45 
 
 		 471 aa  99  7e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.428408  normal  0.287821 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4595  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  34.4 
 
 		 344 aa  97.4  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1204  phospholipase/carboxylesterase  34 
 
 		 335 aa  97.8  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.299935  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2261  putative esterase/lipase/thioesterase  32.96 
 
 		 361 aa  97.1  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556081  normal  0.0820217 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2040  esterase-like protein  29.3 
 
 		 1002 aa  91.7  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.400928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0967  putative esterase  32.58 
 
 		 244 aa  90.9  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.127871 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3487  hypothetical protein  27.98 
 
 		 332 aa  90.1  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3576  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  31.42 
 
 		 451 aa  85.5  9e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.875939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1385  putative Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  27.59 
 
 		 464 aa  83.6  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.516849  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1240  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  35.12 
 
 		 370 aa  82.4  0.000000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.194401 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0713  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  31.87 
 
 		 287 aa  80.1  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0579  esterase, putative  30.33 
 
 		 324 aa  78.6  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3966  phospholipase/carboxylesterase  27.14 
 
 		 795 aa  77  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2301  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  39.16 
 
 		 232 aa  76.3  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0493  esterase, PHB depolymerase family  30.5 
 
 		 378 aa  75.9  0.0000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00180  conserved hypothetical protein  28.76 
 
 		 340 aa  73.6  0.000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2770  PHB depolymerase family esterase  31.22 
 
 		 544 aa  72.4  0.000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3891  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  26.61 
 
 		 298 aa  69.7  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.947481  normal  0.780646 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0726  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  29.13 
 
 		 462 aa  69.3  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.401494  normal  0.100919 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1285  esterase, PHB depolymerase family  31.25 
 
 		 367 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.29485  normal  0.060549 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1990  esterase, PHB depolymerase family  29.74 
 
 		 406 aa  68.9  0.00000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000642829  normal  0.085302 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_92192  predicted protein  26.7 
 
 		 486 aa  68.6  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.865019  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2056  esterase, PHB depolymerase family  27.43 
 
 		 334 aa  67.8  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.10962  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0242  cellulose-binding family II  28.5 
 
 		 447 aa  67.8  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3303  glycoside hydrolase family 62  26.88 
 
 		 436 aa  67.4  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000382833  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0284  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  34.25 
 
 		 215 aa  67  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3566  phospholipase/carboxylesterase  26.36 
 
 		 331 aa  67  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05267  feruloyl esterase (Eurofung)  27.51 
 
 		 270 aa  65.9  0.0000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3270  esterase, PHB depolymerase  32.65 
 
 		 372 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.67973 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1173  esterase, PHB depolymerase family  33.53 
 
 		 410 aa  65.5  0.0000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4905  Ricin B lectin  26.64 
 
 		 461 aa  65.5  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2752  phospholipase/carboxylesterase  28.38 
 
 		 309 aa  63.5  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5398  hypothetical protein  28.96 
 
 		 302 aa  63.5  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.330044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1211  esterase, PHB depolymerase family  29.14 
 
 		 312 aa  62.8  0.000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0349548 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4027  PHB depolymerase family esterase  32 
 
 		 387 aa  62.8  0.000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.391886 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33500  esterase, poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  34.33 
 
 		 429 aa  62.4  0.000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0082  esterase, PHB depolymerase  29.38 
 
 		 414 aa  62  0.000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9052  polyhydroxybutyrate depolymerase  32.28 
 
 		 366 aa  61.6  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2149  hypothetical protein  34.07 
 
 		 343 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00000536767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0364  putative polyhydroxybutyrate depolymerase  30.3 
 
 		 265 aa  60.8  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.81916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0137  esterase, PHB depolymerase  30.73 
 
 		 392 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3485  hypothetical protein  32.1 
 
 		 269 aa  60.5  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4602  esterase, PHB depolymerase  31.78 
 
 		 317 aa  60.5  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.462256  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2268  esterase, PHB depolymerase family  32.62 
 
 		 344 aa  60.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.493113  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1945  esterase, PHB depolymerase family  32.62 
 
 		 344 aa  59.7  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.198099  normal  0.0353299 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1984  esterase, PHB depolymerase family  33.1 
 
 		 337 aa  59.7  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000502853  normal  0.034342 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0048  esterase, PHB depolymerase family  38.64 
 
 		 417 aa  59.3  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616843 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3344  PHB depolymerase family esterase  29.76 
 
 		 429 aa  59.3  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.335799  normal  0.68562 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1536  putative polyhydroxybutyrate depolymerase  26.72 
 
 		 276 aa  59.3  0.00000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.26582  normal  0.221996 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3990  Poly (3-hydroxybutyrate ) depolymerase  32.09 
 
 		 396 aa  58.9  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6240  PHB depolymerase family esterase  38.56 
 
 		 466 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.721378 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3819  PHB depolymerase family esterase  33.12 
 
 		 419 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4127  esterase, PHB depolymerase family  32.5 
 
 		 419 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3857  PHB depolymerase family esterase  32.09 
 
 		 414 aa  56.2  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0209  esterase, PHB depolymerase family  34.59 
 
 		 342 aa  55.5  0.0000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7065  esterase, PHB depolymerase family  38.52 
 
 		 426 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.185362  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31730  esterase, PHB depolymerase family  35.94 
 
 		 331 aa  55.5  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2179  esterase, PHB depolymerase family  29.95 
 
 		 419 aa  55.5  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.284097 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4281  PHB depolymerase family esterase  35.82 
 
 		 403 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0631571 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2059  phospholipase/carboxylesterase  27.04 
 
 		 343 aa  54.3  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.550035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3660  PHB depolymerase family esterase  28.24 
 
 		 381 aa  54.7  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.741995  normal  0.231581 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4883  PHB depolymerase family esterase  33.58 
 
 		 369 aa  53.5  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.103512  hitchhiker  0.0011428 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6025  PHB depolymerase family esterase  29.61 
 
 		 416 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.950963  normal  0.103792 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2234  esterase, PHB depolymerase  33.57 
 
 		 369 aa  53.1  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.111052  normal  0.321017 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4502  esterase, PHB depolymerase  33.58 
 
 		 365 aa  53.1  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.42248  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3862  PHB depolymerase family esterase  33.58 
 
 		 365 aa  53.1  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0810078  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3665  PHB depolymerase family esterase  33.58 
 
 		 365 aa  53.1  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.131134  normal  0.75521 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3488  hypothetical protein  29.07 
 
 		 447 aa  52.8  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2650  hypothetical protein  35.42 
 
 		 355 aa  52.8  0.000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.376354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2846  esterase, PHB depolymerase  33.33 
 
 		 398 aa  52  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.222858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7674  putative polyhydroxy-alkanoate/butyrate(PHA/PHB) depolymerase  31.09 
 
 		 529 aa  52  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1698  phospholipase/Carboxylesterase  29.19 
 
 		 222 aa  51.6  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.675921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6802  esterase, PHB depolymerase family  34.97 
 
 		 398 aa  52  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0419644  decreased coverage  0.000000125026 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2257  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  25 
 
 		 270 aa  51.6  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4407  PHB depolymerase family esterase  32.84 
 
 		 398 aa  51.6  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.32684  normal  0.707171 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4301  PHB depolymerase family esterase  34.92 
 
 		 368 aa  50.8  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>