162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5085 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5085  polyhydroxybutyrate depolymerase  100 
 
 		 313 aa  640    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0474117  normal  0.355318 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4460  polyhydroxybutyrate depolymerase  58.06 
 
 		 322 aa  354  1e-96  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.403398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1590  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  55.59 
 
 		 353 aa  319  3.9999999999999996e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255211  normal  0.12664 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10685  lipoprotein lpqP  47.32 
 
 		 280 aa  281  9e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.132448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1493  phospholipase/Carboxylesterase  38.05 
 
 		 317 aa  176  4e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.030471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3854  putative lipoprotein  37.35 
 
 		 336 aa  147  3e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.496382  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13327  esterase lipoprotein lpqC  36.98 
 
 		 304 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000167103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3127  phospholipase/Carboxylesterase  34.01 
 
 		 314 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.539584 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7236  putative LpqP (hydrolase/esterase)  37.57 
 
 		 405 aa  127  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0397136  normal  0.31443 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1400  phospholipase/Carboxylesterase  30.95 
 
 		 325 aa  126  6e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1573  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  33.43 
 
 		 326 aa  124  1e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0646  hypothetical protein  32.62 
 
 		 322 aa  123  5e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.399454  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3487  hypothetical protein  30.43 
 
 		 332 aa  122  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07050  hypothetical protein  32.98 
 
 		 322 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0373  polyhydroxybutyrate depolymerase  35.96 
 
 		 357 aa  121  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0880654  hitchhiker  0.00622899 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0072  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  37.56 
 
 		 392 aa  119  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1953  putative hydrolase  31.73 
 
 		 308 aa  117  3e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0001445  hitchhiker  0.00199711 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0579  esterase, putative  31.06 
 
 		 324 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1167  hypothetical protein  33.57 
 
 		 471 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.428408  normal  0.287821 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1204  phospholipase/carboxylesterase  33.92 
 
 		 335 aa  114  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.299935  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1969  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  31.45 
 
 		 363 aa  114  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0935555 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3217  hypothetical protein  32.95 
 
 		 282 aa  112  8.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0297  lpqC, putative  35.02 
 
 		 306 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.433259  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2408  carbohydrate esterase family 1 protein  29.14 
 
 		 316 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.211104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0967  putative esterase  34.13 
 
 		 244 aa  109  6e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.127871 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1240  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  30.88 
 
 		 370 aa  107  3e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.194401 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1651  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  32.03 
 
 		 323 aa  106  5e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0627752  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1290  hypothetical protein  35.5 
 
 		 305 aa  104  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3106  putative lipoprotein  31.87 
 
 		 341 aa  103  6e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2261  putative esterase/lipase/thioesterase  31.21 
 
 		 361 aa  102  6e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556081  normal  0.0820217 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3576  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  30.21 
 
 		 451 aa  99.4  7e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.875939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2040  esterase-like protein  28.69 
 
 		 1002 aa  91.7  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.400928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3966  phospholipase/carboxylesterase  26.87 
 
 		 795 aa  92  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4595  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  30.17 
 
 		 344 aa  90.9  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1385  putative Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  27.74 
 
 		 464 aa  88.2  2e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.516849  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3566  phospholipase/carboxylesterase  25.81 
 
 		 331 aa  86.3  6e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0713  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  33.52 
 
 		 287 aa  86.3  6e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00180  conserved hypothetical protein  28.92 
 
 		 340 aa  84.3  0.000000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3891  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  33.69 
 
 		 298 aa  84.3  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.947481  normal  0.780646 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0080  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  26.74 
 
 		 286 aa  85.1  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2301  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  37.57 
 
 		 232 aa  82.4  0.000000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2752  phospholipase/carboxylesterase  25.62 
 
 		 309 aa  80.1  0.00000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5398  hypothetical protein  27.86 
 
 		 302 aa  78.2  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.330044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0726  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  30.07 
 
 		 462 aa  75.1  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.401494  normal  0.100919 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1285  esterase, PHB depolymerase family  26.42 
 
 		 367 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.29485  normal  0.060549 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_92192  predicted protein  28.63 
 
 		 486 aa  73.6  0.000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.865019  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0493  esterase, PHB depolymerase family  29.61 
 
 		 378 aa  72  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0048  esterase, PHB depolymerase family  33.33 
 
 		 417 aa  69.3  0.00000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616843 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4905  Ricin B lectin  25.69 
 
 		 461 aa  68.9  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3270  esterase, PHB depolymerase  26.95 
 
 		 372 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.67973 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0364  putative polyhydroxybutyrate depolymerase  30.63 
 
 		 265 aa  67.4  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.81916  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0242  cellulose-binding family II  32.95 
 
 		 447 aa  67.4  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3485  hypothetical protein  31.88 
 
 		 269 aa  67.4  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3488  hypothetical protein  23.29 
 
 		 447 aa  63.2  0.000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4362  PHB depolymerase family esterase  27.91 
 
 		 576 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33500  esterase, poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  27.06 
 
 		 429 aa  62.4  0.000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2056  esterase, PHB depolymerase family  30.94 
 
 		 334 aa  62.4  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.10962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4602  esterase, PHB depolymerase  35.51 
 
 		 317 aa  61.6  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.462256  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1211  esterase, PHB depolymerase family  24.92 
 
 		 312 aa  61.2  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0349548 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1990  esterase, PHB depolymerase family  29.6 
 
 		 406 aa  60.8  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000642829  normal  0.085302 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0179  PHB depolymerase family esterase  25.36 
 
 		 656 aa  60.5  0.00000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.18087  normal  0.428012 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4027  PHB depolymerase family esterase  26.33 
 
 		 387 aa  60.8  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.391886 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2179  esterase, PHB depolymerase family  35.48 
 
 		 419 aa  60.8  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.284097 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9052  polyhydroxybutyrate depolymerase  34.71 
 
 		 366 aa  60.5  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3857  PHB depolymerase family esterase  27.52 
 
 		 414 aa  59.7  0.00000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26429  predicted protein  31.06 
 
 		 363 aa  59.7  0.00000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000229905  normal  0.222049 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05267  feruloyl esterase (Eurofung)  27.57 
 
 		 270 aa  58.9  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0082  esterase, PHB depolymerase  32.52 
 
 		 414 aa  58.5  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2906  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  29.05 
 
 		 659 aa  58.2  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.686004  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2770  PHB depolymerase family esterase  25.45 
 
 		 544 aa  58.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2650  hypothetical protein  27.72 
 
 		 355 aa  57.8  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.376354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3344  PHB depolymerase family esterase  30.89 
 
 		 429 aa  57.4  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.335799  normal  0.68562 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3990  Poly (3-hydroxybutyrate ) depolymerase  30.69 
 
 		 396 aa  57  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4301  PHB depolymerase family esterase  39.06 
 
 		 368 aa  56.6  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0595  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  25.8 
 
 		 364 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1945  esterase, PHB depolymerase family  31.69 
 
 		 344 aa  54.7  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.198099  normal  0.0353299 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2268  esterase, PHB depolymerase family  31.69 
 
 		 344 aa  54.3  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.493113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1940  PHB depolymerase family esterase  34.72 
 
 		 433 aa  55.1  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3303  glycoside hydrolase family 62  24.63 
 
 		 436 aa  54.7  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000382833  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2257  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  29.22 
 
 		 270 aa  54.3  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2149  hypothetical protein  31.97 
 
 		 343 aa  54.3  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00000536767  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34810  esterase, poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  22.29 
 
 		 501 aa  54.3  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3660  PHB depolymerase family esterase  33.61 
 
 		 381 aa  53.5  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.741995  normal  0.231581 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1484  esterase, PHB depolymerase family  27.67 
 
 		 425 aa  53.1  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0220911  normal  0.169097 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4407  PHB depolymerase family esterase  24.3 
 
 		 398 aa  53.5  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.32684  normal  0.707171 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0137  esterase, PHB depolymerase  31.67 
 
 		 392 aa  53.1  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4018  hypothetical protein  26.21 
 
 		 355 aa  53.1  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5113  esterase, PHB depolymerase  30.92 
 
 		 370 aa  52.8  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.841359  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6240  PHB depolymerase family esterase  27.96 
 
 		 466 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.721378 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2234  esterase, PHB depolymerase  25.36 
 
 		 369 aa  51.2  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.111052  normal  0.321017 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0335  phospholipase/carboxylesterase  26.88 
 
 		 357 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.64094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0209  esterase, PHB depolymerase family  28.24 
 
 		 342 aa  51.2  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0388  PHB depolymerase family esterase  30.23 
 
 		 442 aa  51.2  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.140919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4883  PHB depolymerase family esterase  25.86 
 
 		 369 aa  51.6  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.103512  hitchhiker  0.0011428 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1052  phospholipase/carboxylesterase  30.97 
 
 		 365 aa  50.8  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2576  esterase, PHB depolymerase  34.78 
 
 		 396 aa  50.4  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.225739  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1536  putative polyhydroxybutyrate depolymerase  24.89 
 
 		 276 aa  50.4  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.26582  normal  0.221996 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1463  esterase, PHB depolymerase family  31.97 
 
 		 363 aa  50.4  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0308241  normal  0.241375 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3290  esterase, PHB depolymerase family  29.13 
 
 		 450 aa  50.4  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.195473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4102  hypothetical protein  28.29 
 
 		 385 aa  49.7  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.943667 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>