58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNF00180 on replicon NC_006691
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006691  CNF00180  conserved hypothetical protein  100 
 
 
340 aa  708    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2408  carbohydrate esterase family 1 protein  31.72 
 
 
316 aa  110  3e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.211104  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3966  phospholipase/carboxylesterase  32.4 
 
 
795 aa  87.4  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5085  polyhydroxybutyrate depolymerase  28.92 
 
 
313 aa  84.3  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0474117  normal  0.355318 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1493  phospholipase/Carboxylesterase  26.19 
 
 
317 aa  77.4  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.030471  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1167  hypothetical protein  28.79 
 
 
471 aa  74.7  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.428408  normal  0.287821 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10685  lipoprotein lpqP  28.76 
 
 
280 aa  73.9  0.000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.132448  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3106  putative lipoprotein  25.99 
 
 
341 aa  73.2  0.000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3487  hypothetical protein  25.42 
 
 
332 aa  70.1  0.00000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4460  polyhydroxybutyrate depolymerase  29 
 
 
322 aa  69.7  0.00000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.403398  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3198  putative polyhydroxybutyrate depolymerase  25 
 
 
279 aa  68.9  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.396095  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3576  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  26.04 
 
 
451 aa  68.9  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.875939  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1400  phospholipase/Carboxylesterase  23.72 
 
 
325 aa  68.6  0.0000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0373  polyhydroxybutyrate depolymerase  27.23 
 
 
357 aa  68.2  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0880654  hitchhiker  0.00622899 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1385  putative Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  26.92 
 
 
464 aa  67.4  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.516849  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1573  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  28.4 
 
 
326 aa  66.2  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2261  putative esterase/lipase/thioesterase  26.88 
 
 
361 aa  66.2  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556081  normal  0.0820217 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5020  phospholipase/Carboxylesterase  32.18 
 
 
563 aa  65.9  0.0000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.780509  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13327  esterase lipoprotein lpqC  26.95 
 
 
304 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000167103  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1240  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  27.27 
 
 
370 aa  65.9  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.194401 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3854  putative lipoprotein  27.07 
 
 
336 aa  65.1  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.496382  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1651  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  28.57 
 
 
323 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0627752  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0242  cellulose-binding family II  30.34 
 
 
447 aa  62.4  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1969  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  27.9 
 
 
363 aa  62  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0935555 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1590  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  26.94 
 
 
353 aa  62.4  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255211  normal  0.12664 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0297  lpqC, putative  32.37 
 
 
306 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.433259  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3488  hypothetical protein  25.24 
 
 
447 aa  60.1  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1953  putative hydrolase  25.98 
 
 
308 aa  60.1  0.00000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0001445  hitchhiker  0.00199711 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07050  hypothetical protein  30.1 
 
 
322 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2906  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  30.22 
 
 
659 aa  58.2  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.686004  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3303  glycoside hydrolase family 62  24.22 
 
 
436 aa  58.2  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000382833  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_92192  predicted protein  21.91 
 
 
486 aa  58.5  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.865019  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0713  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  28.79 
 
 
287 aa  58.2  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4905  Ricin B lectin  26.41 
 
 
461 aa  57.4  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2040  esterase-like protein  27.94 
 
 
1002 aa  55.8  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.400928  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0646  hypothetical protein  30.04 
 
 
322 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.399454  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0579  esterase, putative  28.47 
 
 
324 aa  55.1  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0967  putative esterase  26.7 
 
 
244 aa  53.9  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.127871 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1204  phospholipase/carboxylesterase  28.15 
 
 
335 aa  52.8  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.299935  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1290  hypothetical protein  26.7 
 
 
305 aa  52.4  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1536  putative polyhydroxybutyrate depolymerase  23.08 
 
 
276 aa  52.8  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.26582  normal  0.221996 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1105  phospholipase/carboxylesterase  29.76 
 
 
253 aa  50.8  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.320599  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4839  phospholipase/Carboxylesterase  29.94 
 
 
232 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0335  phospholipase/carboxylesterase  24.66 
 
 
357 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.64094  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3127  phospholipase/Carboxylesterase  31.36 
 
 
314 aa  48.9  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.539584 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2287  phospholipase/Carboxylesterase  26.95 
 
 
263 aa  47.4  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.191504  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3217  hypothetical protein  25.85 
 
 
282 aa  47  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0726  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  29 
 
 
462 aa  46.6  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.401494  normal  0.100919 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2257  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  30.4 
 
 
270 aa  46.6  0.0007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0822  hypothetical protein  27.61 
 
 
565 aa  46.6  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.390074 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1603  pyrroline-5-carboxylate reductase  23.81 
 
 
328 aa  46.2  0.0007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05267  feruloyl esterase (Eurofung)  25.84 
 
 
270 aa  45.8  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2770  PHB depolymerase family esterase  24.09 
 
 
544 aa  45.8  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0185  hypothetical protein  29.58 
 
 
446 aa  45.1  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000162284  hitchhiker  0.000128495 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5584  phospholipase/carboxylesterase  27.98 
 
 
231 aa  45.1  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0080  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  25.36 
 
 
286 aa  43.5  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7236  putative LpqP (hydrolase/esterase)  27.78 
 
 
405 aa  43.5  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0397136  normal  0.31443 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2301  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  29.19 
 
 
232 aa  42.7  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>