155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1969 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1969  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  100 
 
 		 363 aa  729    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0935555 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3217  hypothetical protein  40.07 
 
 		 282 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1400  phospholipase/Carboxylesterase  29.65 
 
 		 325 aa  145  1e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07050  hypothetical protein  36.82 
 
 		 322 aa  143  6e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0646  hypothetical protein  37.04 
 
 		 322 aa  139  6e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.399454  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2408  carbohydrate esterase family 1 protein  29.25 
 
 		 316 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.211104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3566  phospholipase/carboxylesterase  32.82 
 
 		 331 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1573  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  33.21 
 
 		 326 aa  133  5e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1651  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  32.75 
 
 		 323 aa  132  9e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0627752  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2752  phospholipase/carboxylesterase  32.75 
 
 		 309 aa  128  1.0000000000000001e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0297  lpqC, putative  36.4 
 
 		 306 aa  119  6e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.433259  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3127  phospholipase/Carboxylesterase  31.51 
 
 		 314 aa  119  6e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.539584 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3106  putative lipoprotein  34.02 
 
 		 341 aa  117  3e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5085  polyhydroxybutyrate depolymerase  31.45 
 
 		 313 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0474117  normal  0.355318 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1590  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  34.84 
 
 		 353 aa  114  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255211  normal  0.12664 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13327  esterase lipoprotein lpqC  35.38 
 
 		 304 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000167103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10685  lipoprotein lpqP  31.47 
 
 		 280 aa  107  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.132448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1493  phospholipase/Carboxylesterase  31.49 
 
 		 317 aa  107  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.030471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0726  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  32.74 
 
 		 462 aa  106  7e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.401494  normal  0.100919 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0967  putative esterase  33.18 
 
 		 244 aa  104  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.127871 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0579  esterase, putative  28.16 
 
 		 324 aa  103  5e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7236  putative LpqP (hydrolase/esterase)  34.39 
 
 		 405 aa  98.2  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0397136  normal  0.31443 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1204  phospholipase/carboxylesterase  27.7 
 
 		 335 aa  97.4  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.299935  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4460  polyhydroxybutyrate depolymerase  29.6 
 
 		 322 aa  97.1  4e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.403398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2261  putative esterase/lipase/thioesterase  31.34 
 
 		 361 aa  94.7  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556081  normal  0.0820217 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0072  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  33.16 
 
 		 392 aa  93.6  5e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2301  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  32.97 
 
 		 232 aa  90.9  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0373  polyhydroxybutyrate depolymerase  34.66 
 
 		 357 aa  90.1  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0880654  hitchhiker  0.00622899 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3854  putative lipoprotein  36.67 
 
 		 336 aa  87.8  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.496382  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1953  putative hydrolase  28.04 
 
 		 308 aa  86.7  6e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0001445  hitchhiker  0.00199711 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5398  hypothetical protein  25.41 
 
 		 302 aa  84.7  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.330044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4595  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  30 
 
 		 344 aa  81.6  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3966  phospholipase/carboxylesterase  23.86 
 
 		 795 aa  82  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1167  hypothetical protein  28.1 
 
 		 471 aa  80.9  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.428408  normal  0.287821 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3891  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  24.49 
 
 		 298 aa  80.5  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.947481  normal  0.780646 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3485  hypothetical protein  31.64 
 
 		 269 aa  80.1  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3576  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  29.48 
 
 		 451 aa  79  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.875939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2040  esterase-like protein  24.58 
 
 		 1002 aa  79  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.400928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1290  hypothetical protein  33.33 
 
 		 305 aa  75.9  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0713  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  29.46 
 
 		 287 aa  72.4  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0388  PHB depolymerase family esterase  23.75 
 
 		 442 aa  70.1  0.00000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.140919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1990  esterase, PHB depolymerase family  27.14 
 
 		 406 aa  68.9  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000642829  normal  0.085302 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3487  hypothetical protein  24.04 
 
 		 332 aa  68.6  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3990  Poly (3-hydroxybutyrate ) depolymerase  34.51 
 
 		 396 aa  67  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0493  esterase, PHB depolymerase family  32.32 
 
 		 378 aa  65.9  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00180  conserved hypothetical protein  27.9 
 
 		 340 aa  64.7  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1173  esterase, PHB depolymerase family  28.24 
 
 		 410 aa  64.7  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3823  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  27.53 
 
 		 374 aa  64.7  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0080  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  28.8 
 
 		 286 aa  64.3  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3270  esterase, PHB depolymerase  29.23 
 
 		 372 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.67973 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2991  PHB depolymerase family esterase  30 
 
 		 419 aa  63.2  0.000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3303  glycoside hydrolase family 62  26.73 
 
 		 436 aa  63.2  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000382833  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2650  hypothetical protein  29.33 
 
 		 355 aa  62.4  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.376354  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4230  phospholipase/Carboxylesterase  31.25 
 
 		 268 aa  62.4  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.58568  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2056  esterase, PHB depolymerase family  27.98 
 
 		 334 aa  62.4  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.10962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1240  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  27.45 
 
 		 370 aa  62  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.194401 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3488  hypothetical protein  23.47 
 
 		 447 aa  62  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1285  esterase, PHB depolymerase family  31.36 
 
 		 367 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.29485  normal  0.060549 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2257  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  27.36 
 
 		 270 aa  61.2  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4749  esterase, PHB depolymerase family  28.04 
 
 		 343 aa  61.6  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2576  esterase, PHB depolymerase  30.82 
 
 		 396 aa  61.2  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.225739  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33500  esterase, poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  25.64 
 
 		 429 aa  60.8  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_92192  predicted protein  25 
 
 		 486 aa  60.5  0.00000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.865019  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4362  PHB depolymerase family esterase  33.63 
 
 		 576 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26429  predicted protein  26.88 
 
 		 363 aa  59.7  0.00000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000229905  normal  0.222049 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6025  PHB depolymerase family esterase  36.15 
 
 		 416 aa  59.7  0.00000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.950963  normal  0.103792 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2149  hypothetical protein  34.11 
 
 		 343 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00000536767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4027  PHB depolymerase family esterase  34.17 
 
 		 387 aa  58.9  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.391886 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3857  PHB depolymerase family esterase  29.37 
 
 		 414 aa  59.3  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4102  hypothetical protein  30 
 
 		 385 aa  59.3  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.943667 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1984  esterase, PHB depolymerase family  26.02 
 
 		 337 aa  58.5  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000502853  normal  0.034342 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2065  esterase, PHB depolymerase  30.77 
 
 		 359 aa  58.5  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0523522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3959  esterase, PHB depolymerase family  24.74 
 
 		 423 aa  58.5  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2268  esterase, PHB depolymerase family  34.11 
 
 		 344 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.493113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3591  esterase, PHB depolymerase family  21.03 
 
 		 518 aa  58.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2770  PHB depolymerase family esterase  24.75 
 
 		 544 aa  57.8  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0048  esterase, PHB depolymerase family  25.3 
 
 		 417 aa  57.8  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616843 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4958  esterase, PHB depolymerase family  20 
 
 		 451 aa  57  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.348858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5379  putative esterase, PHB depolymerase  32.31 
 
 		 411 aa  57  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.449035 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1211  esterase, PHB depolymerase family  26.61 
 
 		 312 aa  56.6  0.0000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0349548 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1536  putative polyhydroxybutyrate depolymerase  25 
 
 		 276 aa  56.6  0.0000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.26582  normal  0.221996 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1945  esterase, PHB depolymerase family  35.11 
 
 		 344 aa  56.6  0.0000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.198099  normal  0.0353299 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0209  esterase, PHB depolymerase family  29.59 
 
 		 342 aa  56.2  0.0000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0137  esterase, PHB depolymerase  31.71 
 
 		 392 aa  55.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4273  esterase, PHB depolymerase  30.77 
 
 		 394 aa  55.8  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2906  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  24.47 
 
 		 659 aa  55.5  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.686004  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0082  esterase, PHB depolymerase  27.27 
 
 		 414 aa  54.7  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2179  esterase, PHB depolymerase family  27.27 
 
 		 419 aa  55.1  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.284097 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0711  esterase, PHB depolymerase  29.01 
 
 		 392 aa  54.3  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.612274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2269  hypothetical protein  26.64 
 
 		 261 aa  54.3  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.187168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7674  putative polyhydroxy-alkanoate/butyrate(PHA/PHB) depolymerase  32.46 
 
 		 529 aa  54.7  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6240  PHB depolymerase family esterase  28.89 
 
 		 466 aa  54.3  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.721378 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2245  esterase, PHB depolymerase family  23.02 
 
 		 432 aa  54.3  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.386893 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4615  PHB depolymerase family esterase  27.78 
 
 		 359 aa  53.1  0.000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34810  esterase, poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  29.5 
 
 		 501 aa  52.4  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5706  PHB depolymerase family esterase  32.31 
 
 		 438 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.137114  hitchhiker  0.00469436 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4301  PHB depolymerase family esterase  30.47 
 
 		 368 aa  51.6  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05267  feruloyl esterase (Eurofung)  26.5 
 
 		 270 aa  50.8  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4883  PHB depolymerase family esterase  33.64 
 
 		 369 aa  51.2  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.103512  hitchhiker  0.0011428 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1484  esterase, PHB depolymerase family  31.01 
 
 		 425 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0220911  normal  0.169097 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>