92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3198 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_3198  putative polyhydroxybutyrate depolymerase  100 
 
 
279 aa  570  1.0000000000000001e-162  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.396095  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1536  putative polyhydroxybutyrate depolymerase  43.33 
 
 
276 aa  210  2e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.26582  normal  0.221996 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0364  putative polyhydroxybutyrate depolymerase  26.64 
 
 
265 aa  72.8  0.000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.81916  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00180  conserved hypothetical protein  25.42 
 
 
340 aa  68.9  0.00000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3106  putative lipoprotein  29.69 
 
 
341 aa  67.8  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1400  phospholipase/Carboxylesterase  25 
 
 
325 aa  65.5  0.000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1493  phospholipase/Carboxylesterase  26.75 
 
 
317 aa  65.1  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.030471  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1573  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  29.41 
 
 
326 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0373  polyhydroxybutyrate depolymerase  30.32 
 
 
357 aa  64.3  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0880654  hitchhiker  0.00622899 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1651  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  27.18 
 
 
323 aa  61.6  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0627752  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3857  PHB depolymerase family esterase  32.26 
 
 
414 aa  59.7  0.00000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_92192  predicted protein  27.44 
 
 
486 aa  58.5  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.865019  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4905  Ricin B lectin  33.58 
 
 
461 aa  57  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1167  hypothetical protein  25.53 
 
 
471 aa  56.2  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.428408  normal  0.287821 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0967  putative esterase  29.81 
 
 
244 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.127871 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3217  hypothetical protein  26.75 
 
 
282 aa  54.7  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0242  cellulose-binding family II  27.59 
 
 
447 aa  53.5  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2065  esterase, PHB depolymerase  29.84 
 
 
359 aa  53.9  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0523522  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13327  esterase lipoprotein lpqC  32.74 
 
 
304 aa  52.8  0.000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000167103  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1290  hypothetical protein  27.33 
 
 
305 aa  52.4  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4301  PHB depolymerase family esterase  27.66 
 
 
368 aa  52.4  0.000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1385  putative Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  22.92 
 
 
464 aa  52  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.516849  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3966  phospholipase/carboxylesterase  25.64 
 
 
795 aa  52  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2301  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  30.12 
 
 
232 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2257  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  25 
 
 
270 aa  51.6  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1204  phospholipase/carboxylesterase  24.57 
 
 
335 aa  50.8  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.299935  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1773  phospholipase/Carboxylesterase  28.74 
 
 
239 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2204  esterase, PHB depolymerase  29.79 
 
 
367 aa  51.2  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.667331  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26429  predicted protein  29.59 
 
 
363 aa  50.8  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000229905  normal  0.222049 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0713  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  26.95 
 
 
287 aa  50.1  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3854  putative lipoprotein  24.02 
 
 
336 aa  48.9  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.496382  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10685  lipoprotein lpqP  29.17 
 
 
280 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.132448  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1373  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  32.59 
 
 
620 aa  48.1  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0272535 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3660  PHB depolymerase family esterase  28.28 
 
 
381 aa  48.9  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.741995  normal  0.231581 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1285  esterase, PHB depolymerase family  25.4 
 
 
367 aa  48.5  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.29485  normal  0.060549 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2056  esterase, PHB depolymerase family  25.98 
 
 
334 aa  48.9  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.10962  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5020  phospholipase/Carboxylesterase  27 
 
 
563 aa  48.1  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.780509  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2820  esterase, PHB depolymerase family  27.41 
 
 
352 aa  47.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000611867  hitchhiker  0.00921779 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2408  carbohydrate esterase family 1 protein  25.75 
 
 
316 aa  47.8  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.211104  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0137  esterase, PHB depolymerase  27.45 
 
 
392 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07050  hypothetical protein  28.74 
 
 
322 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0080  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  26.9 
 
 
286 aa  47  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3270  esterase, PHB depolymerase  26.77 
 
 
372 aa  47  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.67973 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2590  hypothetical protein  29.47 
 
 
341 aa  47.4  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4595  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  31.29 
 
 
344 aa  47  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4027  PHB depolymerase family esterase  30.23 
 
 
387 aa  46.6  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.391886 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1590  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  28.92 
 
 
353 aa  45.8  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255211  normal  0.12664 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1463  esterase, PHB depolymerase family  22.46 
 
 
363 aa  45.8  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0308241  normal  0.241375 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4713  putative lipoprotein signal peptide  29.92 
 
 
365 aa  45.8  0.0008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.405813 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3048  phospholipase/Carboxylesterase  22.44 
 
 
405 aa  45.8  0.0009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3576  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  26.92 
 
 
451 aa  45.8  0.0009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.875939  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0686  phospholipase/carboxylesterase  30.58 
 
 
232 aa  45.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3990  Poly (3-hydroxybutyrate ) depolymerase  29.03 
 
 
396 aa  45.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7213  putative dienelactone hydrolase  28.95 
 
 
284 aa  45.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.125525  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2040  esterase-like protein  25.52 
 
 
1002 aa  45.4  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.400928  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1368  phospholipase/Carboxylesterase  26.85 
 
 
239 aa  45.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2954  phospholipase/carboxylesterase  24.24 
 
 
223 aa  45.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.231462  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33500  esterase, poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  27.2 
 
 
429 aa  44.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4407  PHB depolymerase family esterase  28.77 
 
 
398 aa  44.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.32684  normal  0.707171 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1148  phospholipase/Carboxylesterase  27.52 
 
 
239 aa  44.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3891  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  26.79 
 
 
298 aa  44.3  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.947481  normal  0.780646 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2906  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  26.21 
 
 
659 aa  44.3  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.686004  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1052  phospholipase/carboxylesterase  33.1 
 
 
365 aa  44.3  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2650  hypothetical protein  28.8 
 
 
355 aa  44.7  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.376354  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4903  hypothetical protein  29.17 
 
 
372 aa  44.3  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3303  glycoside hydrolase family 62  31.37 
 
 
436 aa  44.3  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000382833  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0072  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  27.32 
 
 
392 aa  43.9  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3127  phospholipase/Carboxylesterase  24.43 
 
 
314 aa  43.9  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.539584 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0711  esterase, PHB depolymerase  25 
 
 
392 aa  43.9  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.612274  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1208  phospholipase/carboxylesterase  26.17 
 
 
239 aa  44.3  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.12535 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7236  putative LpqP (hydrolase/esterase)  26.26 
 
 
405 aa  44.3  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0397136  normal  0.31443 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0365  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  32.03 
 
 
664 aa  43.5  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4749  esterase, PHB depolymerase family  27.97 
 
 
343 aa  43.5  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2739  hypothetical protein  25.75 
 
 
238 aa  43.1  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1953  putative hydrolase  25.68 
 
 
308 aa  43.1  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0001445  hitchhiker  0.00199711 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0501  hypothetical protein  25 
 
 
436 aa  43.1  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.672777  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1990  esterase, PHB depolymerase family  28.25 
 
 
406 aa  43.1  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000642829  normal  0.085302 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2576  esterase, PHB depolymerase  25.2 
 
 
396 aa  42.7  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.225739  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5584  phospholipase/carboxylesterase  26.42 
 
 
231 aa  42.7  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0395  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.83 
 
 
617 aa  42.7  0.007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3244  phospholipase/carboxylesterase  22.5 
 
 
245 aa  42.7  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1211  esterase, PHB depolymerase family  27.92 
 
 
312 aa  42.7  0.007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0349548 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0548  phospholipase/Carboxylesterase  25.62 
 
 
358 aa  42.7  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.185297  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2757  hypothetical protein  30.23 
 
 
351 aa  42.7  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.140498 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4883  PHB depolymerase family esterase  29.46 
 
 
369 aa  42.7  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.103512  hitchhiker  0.0011428 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0773  seryl-tRNA synthetase  31.13 
 
 
414 aa  42.7  0.007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.749517  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4602  esterase, PHB depolymerase  28.33 
 
 
317 aa  42.4  0.009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.462256  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4502  esterase, PHB depolymerase  29.46 
 
 
365 aa  42.4  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.42248  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3665  PHB depolymerase family esterase  29.46 
 
 
365 aa  42.4  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.131134  normal  0.75521 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2128  phospholipase/carboxylesterase  27.56 
 
 
231 aa  42.4  0.009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000282469  hitchhiker  0.000267211 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3862  PHB depolymerase family esterase  29.46 
 
 
365 aa  42.4  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0810078  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2537  phospholipase/carboxylesterase  24.85 
 
 
219 aa  42  0.01  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.311842  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>