72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0726 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0726  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  100 
 
 		 462 aa  888    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.401494  normal  0.100919 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3966  phospholipase/carboxylesterase  31.02 
 
 		 795 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2408  carbohydrate esterase family 1 protein  29.18 
 
 		 316 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.211104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1400  phospholipase/Carboxylesterase  27.91 
 
 		 325 aa  116  7.999999999999999e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1969  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  32.74 
 
 		 363 aa  112  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0935555 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3217  hypothetical protein  30.89 
 
 		 282 aa  101  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1573  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  32.44 
 
 		 326 aa  95.9  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1651  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  30.13 
 
 		 323 aa  93.2  8e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0627752  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2040  esterase-like protein  28.29 
 
 		 1002 aa  91.3  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.400928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3487  hypothetical protein  28.86 
 
 		 332 aa  90.9  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13327  esterase lipoprotein lpqC  33.17 
 
 		 304 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000167103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0579  esterase, putative  29.14 
 
 		 324 aa  87.8  4e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2752  phospholipase/carboxylesterase  31.28 
 
 		 309 aa  87.4  5e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1204  phospholipase/carboxylesterase  27.52 
 
 		 335 aa  81.3  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.299935  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1167  hypothetical protein  29.67 
 
 		 471 aa  81.3  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.428408  normal  0.287821 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4460  polyhydroxybutyrate depolymerase  28.97 
 
 		 322 aa  80.5  0.00000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.403398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2301  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  32.61 
 
 		 232 aa  80.1  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3576  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  28.73 
 
 		 451 aa  79  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.875939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1590  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  31.23 
 
 		 353 aa  77.8  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255211  normal  0.12664 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5085  polyhydroxybutyrate depolymerase  30.07 
 
 		 313 aa  76.3  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0474117  normal  0.355318 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3854  putative lipoprotein  30.26 
 
 		 336 aa  72  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.496382  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10685  lipoprotein lpqP  30.43 
 
 		 280 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.132448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1493  phospholipase/Carboxylesterase  27.06 
 
 		 317 aa  71.2  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.030471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2261  putative esterase/lipase/thioesterase  31.87 
 
 		 361 aa  69.7  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556081  normal  0.0820217 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3566  phospholipase/carboxylesterase  28.25 
 
 		 331 aa  67  0.0000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1240  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  30.52 
 
 		 370 aa  65.9  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.194401 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3106  putative lipoprotein  28.74 
 
 		 341 aa  65.5  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4595  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  29.56 
 
 		 344 aa  65.1  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4905  Ricin B lectin  28.62 
 
 		 461 aa  64.3  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07050  hypothetical protein  32.34 
 
 		 322 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0967  putative esterase  28.82 
 
 		 244 aa  60.8  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.127871 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0080  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  27.46 
 
 		 286 aa  60.8  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7236  putative LpqP (hydrolase/esterase)  30.05 
 
 		 405 aa  60.5  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0397136  normal  0.31443 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0297  lpqC, putative  28.93 
 
 		 306 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.433259  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3488  hypothetical protein  26.76 
 
 		 447 aa  57.4  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2633  PHB depolymerase family esterase  27.93 
 
 		 422 aa  55.5  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.655829 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0646  hypothetical protein  31.68 
 
 		 322 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.399454  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3127  phospholipase/Carboxylesterase  25.46 
 
 		 314 aa  54.7  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.539584 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3891  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  23.15 
 
 		 298 aa  53.9  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.947481  normal  0.780646 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3303  glycoside hydrolase family 62  30.25 
 
 		 436 aa  53.5  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000382833  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0388  PHB depolymerase family esterase  25.11 
 
 		 442 aa  52.4  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.140919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1953  putative hydrolase  30.8 
 
 		 308 aa  52  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0001445  hitchhiker  0.00199711 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33500  esterase, poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  24.05 
 
 		 429 aa  52.4  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0780  PHB depolymerase family esterase  24.28 
 
 		 436 aa  51.2  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1536  putative polyhydroxybutyrate depolymerase  26.58 
 
 		 276 aa  50.8  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.26582  normal  0.221996 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1385  putative Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  23.4 
 
 		 464 aa  50.8  0.00006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.516849  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5398  hypothetical protein  21.47 
 
 		 302 aa  50.4  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.330044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0373  polyhydroxybutyrate depolymerase  25.37 
 
 		 357 aa  50.1  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0880654  hitchhiker  0.00622899 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2056  esterase, PHB depolymerase family  24.44 
 
 		 334 aa  49.7  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.10962  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4018  hypothetical protein  25.27 
 
 		 355 aa  49.3  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF00180  conserved hypothetical protein  27.4 
 
 		 340 aa  48.5  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05267  feruloyl esterase (Eurofung)  26.59 
 
 		 270 aa  47.8  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0242  cellulose-binding family II  27.81 
 
 		 447 aa  47.8  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2059  phospholipase/carboxylesterase  23.86 
 
 		 343 aa  47.8  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.550035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3270  esterase, PHB depolymerase  22.8 
 
 		 372 aa  47.8  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.67973 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0595  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  29.74 
 
 		 364 aa  47.4  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5706  PHB depolymerase family esterase  27.76 
 
 		 438 aa  46.6  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.137114  hitchhiker  0.00469436 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0179  PHB depolymerase family esterase  24.79 
 
 		 656 aa  45.8  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.18087  normal  0.428012 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4502  esterase, PHB depolymerase  27.64 
 
 		 365 aa  44.7  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.42248  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3360  esterase, PHB depolymerase family  27.24 
 
 		 419 aa  44.7  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.995755 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3959  esterase, PHB depolymerase family  25.17 
 
 		 423 aa  44.7  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3862  PHB depolymerase family esterase  27.64 
 
 		 365 aa  44.7  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0810078  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3665  PHB depolymerase family esterase  27.64 
 
 		 365 aa  44.7  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.131134  normal  0.75521 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2245  esterase, PHB depolymerase family  26.99 
 
 		 432 aa  43.9  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.386893 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4883  PHB depolymerase family esterase  26.09 
 
 		 369 aa  43.9  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.103512  hitchhiker  0.0011428 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2650  hypothetical protein  28.65 
 
 		 355 aa  43.9  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.376354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3819  PHB depolymerase family esterase  27.17 
 
 		 419 aa  43.5  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4127  esterase, PHB depolymerase family  25.86 
 
 		 419 aa  43.5  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0364  putative polyhydroxybutyrate depolymerase  30.3 
 
 		 265 aa  43.5  0.008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.81916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0072  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  30.82 
 
 		 392 aa  43.5  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2234  esterase, PHB depolymerase  27.8 
 
 		 369 aa  43.5  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.111052  normal  0.321017 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3485  hypothetical protein  31.71 
 
 		 269 aa  43.5  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>