100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2261 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2261  putative esterase/lipase/thioesterase  100 
 
 		 361 aa  705    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556081  normal  0.0820217 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1240  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  58.89 
 
 		 370 aa  302  6.000000000000001e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.194401 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3576  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  34.51 
 
 		 451 aa  125  8.000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.875939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1167  hypothetical protein  33.97 
 
 		 471 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.428408  normal  0.287821 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3966  phospholipase/carboxylesterase  30.65 
 
 		 795 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1493  phospholipase/Carboxylesterase  30.15 
 
 		 317 aa  113  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.030471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2408  carbohydrate esterase family 1 protein  26.62 
 
 		 316 aa  105  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.211104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5085  polyhydroxybutyrate depolymerase  30.87 
 
 		 313 aa  103  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0474117  normal  0.355318 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1385  putative Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  31.89 
 
 		 464 aa  103  7e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.516849  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1573  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  31.94 
 
 		 326 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10685  lipoprotein lpqP  32.32 
 
 		 280 aa  99.4  9e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.132448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1969  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  31.34 
 
 		 363 aa  94  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0935555 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1590  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  34.69 
 
 		 353 aa  93.6  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255211  normal  0.12664 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1400  phospholipase/Carboxylesterase  24.65 
 
 		 325 aa  92.8  7e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3217  hypothetical protein  32.04 
 
 		 282 aa  91.3  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3487  hypothetical protein  25.9 
 
 		 332 aa  90.9  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1651  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  29.55 
 
 		 323 aa  91.3  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0627752  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0967  putative esterase  33.33 
 
 		 244 aa  89.7  7e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.127871 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13327  esterase lipoprotein lpqC  30.41 
 
 		 304 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000167103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0373  polyhydroxybutyrate depolymerase  35.75 
 
 		 357 aa  89  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0880654  hitchhiker  0.00622899 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1953  putative hydrolase  32 
 
 		 308 aa  87.4  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0001445  hitchhiker  0.00199711 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1204  phospholipase/carboxylesterase  28.17 
 
 		 335 aa  87.4  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.299935  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3106  putative lipoprotein  28.46 
 
 		 341 aa  87  4e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3854  putative lipoprotein  33.05 
 
 		 336 aa  85.5  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.496382  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3303  glycoside hydrolase family 62  27.95 
 
 		 436 aa  77.8  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000382833  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3488  hypothetical protein  23.18 
 
 		 447 aa  78.6  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0072  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  33.7 
 
 		 392 aa  77.8  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7236  putative LpqP (hydrolase/esterase)  36.42 
 
 		 405 aa  77  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0397136  normal  0.31443 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07050  hypothetical protein  36 
 
 		 322 aa  73.2  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4460  polyhydroxybutyrate depolymerase  31.76 
 
 		 322 aa  72.8  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.403398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0646  hypothetical protein  35.23 
 
 		 322 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.399454  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4905  Ricin B lectin  28.73 
 
 		 461 aa  70.9  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00180  conserved hypothetical protein  26.47 
 
 		 340 aa  67  0.0000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05267  feruloyl esterase (Eurofung)  26.02 
 
 		 270 aa  65.9  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0080  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  27.27 
 
 		 286 aa  65.9  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0726  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  31.87 
 
 		 462 aa  64.7  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.401494  normal  0.100919 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3127  phospholipase/Carboxylesterase  26.4 
 
 		 314 aa  64.3  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.539584 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3566  phospholipase/carboxylesterase  26.83 
 
 		 331 aa  64.3  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0242  cellulose-binding family II  24.73 
 
 		 447 aa  64.3  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0297  lpqC, putative  30.36 
 
 		 306 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.433259  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1290  hypothetical protein  31.94 
 
 		 305 aa  62.4  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0579  esterase, putative  23.61 
 
 		 324 aa  61.6  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2301  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  33.1 
 
 		 232 aa  60.8  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3891  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  25.24 
 
 		 298 aa  57.8  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.947481  normal  0.780646 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1208  phospholipase/carboxylesterase  29.88 
 
 		 239 aa  56.2  0.0000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.12535 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5584  phospholipase/carboxylesterase  31.03 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2056  esterase, PHB depolymerase family  30 
 
 		 334 aa  55.8  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.10962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1368  phospholipase/Carboxylesterase  30.72 
 
 		 239 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2149  hypothetical protein  32.53 
 
 		 343 aa  53.5  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00000536767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2770  PHB depolymerase family esterase  22.36 
 
 		 544 aa  53.5  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2752  phospholipase/carboxylesterase  24.29 
 
 		 309 aa  53.1  0.000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3270  esterase, PHB depolymerase  28.78 
 
 		 372 aa  53.1  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.67973 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1173  esterase, PHB depolymerase family  29.25 
 
 		 410 aa  52.4  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1990  esterase, PHB depolymerase family  30.97 
 
 		 406 aa  52.4  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000642829  normal  0.085302 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1984  esterase, PHB depolymerase family  34.38 
 
 		 337 aa  52.4  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000502853  normal  0.034342 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1285  esterase, PHB depolymerase family  25.56 
 
 		 367 aa  52.4  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.29485  normal  0.060549 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2040  esterase-like protein  21.98 
 
 		 1002 aa  50.1  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.400928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0364  putative polyhydroxybutyrate depolymerase  29.89 
 
 		 265 aa  50.1  0.00006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.81916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1773  phospholipase/Carboxylesterase  31.09 
 
 		 239 aa  50.1  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0713  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  27.69 
 
 		 287 aa  49.7  0.00009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2268  esterase, PHB depolymerase family  33.07 
 
 		 344 aa  48.9  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.493113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2287  phospholipase/Carboxylesterase  31.87 
 
 		 263 aa  48.9  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.191504  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2257  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  30 
 
 		 270 aa  48.9  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3344  PHB depolymerase family esterase  30.4 
 
 		 429 aa  48.9  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.335799  normal  0.68562 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1536  putative polyhydroxybutyrate depolymerase  25.91 
 
 		 276 aa  48.9  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.26582  normal  0.221996 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1945  esterase, PHB depolymerase family  32.85 
 
 		 344 aa  48.9  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.198099  normal  0.0353299 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33500  esterase, poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  31.09 
 
 		 429 aa  49.3  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4839  phospholipase/Carboxylesterase  30.65 
 
 		 232 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1148  phospholipase/Carboxylesterase  26.26 
 
 		 239 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4595  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  28.8 
 
 		 344 aa  48.1  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6802  esterase, PHB depolymerase family  30.29 
 
 		 398 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0419644  decreased coverage  0.000000125026 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0822  hypothetical protein  29.19 
 
 		 565 aa  47.8  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.390074 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3857  PHB depolymerase family esterase  28.72 
 
 		 414 aa  47  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2846  esterase, PHB depolymerase  28.95 
 
 		 398 aa  47  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.222858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1211  esterase, PHB depolymerase family  29.5 
 
 		 312 aa  47  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0349548 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6240  PHB depolymerase family esterase  31.53 
 
 		 466 aa  47  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.721378 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4055  phospholipase/carboxylesterase  30.72 
 
 		 242 aa  47  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.342724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4883  PHB depolymerase family esterase  30.27 
 
 		 369 aa  46.6  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.103512  hitchhiker  0.0011428 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2611  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.77 
 
 		 308 aa  46.2  0.0008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.985192 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3862  PHB depolymerase family esterase  29.39 
 
 		 365 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0810078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5398  hypothetical protein  24.1 
 
 		 302 aa  45.8  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.330044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3360  esterase, PHB depolymerase family  29.25 
 
 		 419 aa  45.8  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.995755 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4502  esterase, PHB depolymerase  29.39 
 
 		 365 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.42248  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3665  PHB depolymerase family esterase  29.39 
 
 		 365 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.131134  normal  0.75521 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2234  esterase, PHB depolymerase  32.11 
 
 		 369 aa  45.4  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.111052  normal  0.321017 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5706  PHB depolymerase family esterase  29.73 
 
 		 438 aa  45.1  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.137114  hitchhiker  0.00469436 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4127  esterase, PHB depolymerase family  29.82 
 
 		 419 aa  44.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3819  PHB depolymerase family esterase  29.82 
 
 		 419 aa  45.1  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1105  phospholipase/carboxylesterase  27.84 
 
 		 253 aa  45.1  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.320599  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4614  phospholipase/Carboxylesterase  27.22 
 
 		 238 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.376672 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0493  esterase, PHB depolymerase family  26.92 
 
 		 378 aa  44.3  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2065  esterase, PHB depolymerase  26.98 
 
 		 359 aa  44.3  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0523522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1940  PHB depolymerase family esterase  31.73 
 
 		 433 aa  44.3  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2059  phospholipase/carboxylesterase  25.56 
 
 		 343 aa  44.3  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.550035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0063  phospholipase/carboxylesterase  29.22 
 
 		 227 aa  44.3  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.982882  normal  0.670301 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2906  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  35.06 
 
 		 659 aa  44.3  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.686004  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7221  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  33.12 
 
 		 363 aa  43.9  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201442  normal  0.80823 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0284  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  29.77 
 
 		 215 aa  43.5  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3485  hypothetical protein  30.05 
 
 		 269 aa  43.5  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4027  PHB depolymerase family esterase  27.34 
 
 		 387 aa  43.1  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.391886 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>