137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1290 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1290  hypothetical protein  100 
 
 		 305 aa  606  9.999999999999999e-173  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3854  putative lipoprotein  31.69 
 
 		 336 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.496382  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10685  lipoprotein lpqP  33.98 
 
 		 280 aa  116  6e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.132448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5085  polyhydroxybutyrate depolymerase  35.5 
 
 		 313 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0474117  normal  0.355318 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1590  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  43.75 
 
 		 353 aa  100  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255211  normal  0.12664 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7236  putative LpqP (hydrolase/esterase)  38.01 
 
 		 405 aa  98.6  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0397136  normal  0.31443 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1573  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  35.9 
 
 		 326 aa  97.1  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0072  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  39.16 
 
 		 392 aa  96.3  5e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0373  polyhydroxybutyrate depolymerase  35.78 
 
 		 357 aa  95.9  7e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0880654  hitchhiker  0.00622899 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1493  phospholipase/Carboxylesterase  34.87 
 
 		 317 aa  94.4  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.030471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1651  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  34.38 
 
 		 323 aa  88.2  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0627752  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3106  putative lipoprotein  38.71 
 
 		 341 aa  87.8  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4460  polyhydroxybutyrate depolymerase  37.42 
 
 		 322 aa  87.8  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.403398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3217  hypothetical protein  35.42 
 
 		 282 aa  87.8  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0967  putative esterase  38.41 
 
 		 244 aa  84.7  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.127871 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07050  hypothetical protein  39.47 
 
 		 322 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0297  lpqC, putative  36.97 
 
 		 306 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.433259  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3127  phospholipase/Carboxylesterase  33.33 
 
 		 314 aa  81.6  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.539584 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0646  hypothetical protein  44.76 
 
 		 322 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.399454  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0080  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  26.89 
 
 		 286 aa  76.6  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1969  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  33.33 
 
 		 363 aa  75.5  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0935555 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2408  carbohydrate esterase family 1 protein  32.21 
 
 		 316 aa  74.7  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.211104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4749  esterase, PHB depolymerase family  28.57 
 
 		 343 aa  73.6  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1204  phospholipase/carboxylesterase  30.72 
 
 		 335 aa  72  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.299935  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0048  esterase, PHB depolymerase family  34.52 
 
 		 417 aa  70.5  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616843 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2752  phospholipase/carboxylesterase  29.31 
 
 		 309 aa  70.5  0.00000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0713  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  31.63 
 
 		 287 aa  70.1  0.00000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1400  phospholipase/Carboxylesterase  27.92 
 
 		 325 aa  67  0.0000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6529  hypothetical protein  37.93 
 
 		 222 aa  66.6  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0555425 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1167  hypothetical protein  28.28 
 
 		 471 aa  66.2  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.428408  normal  0.287821 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0579  esterase, putative  28.39 
 
 		 324 aa  65.9  0.0000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4595  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  34.76 
 
 		 344 aa  65.5  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0284  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  37.5 
 
 		 215 aa  64.7  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1953  putative hydrolase  30.89 
 
 		 308 aa  64.3  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0001445  hitchhiker  0.00199711 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3966  phospholipase/carboxylesterase  27.22 
 
 		 795 aa  64.3  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3576  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  28.67 
 
 		 451 aa  63.9  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.875939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0082  esterase, PHB depolymerase  36.51 
 
 		 414 aa  63.2  0.000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13327  esterase lipoprotein lpqC  33.33 
 
 		 304 aa  62.8  0.000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000167103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1990  esterase, PHB depolymerase family  35.11 
 
 		 406 aa  63.2  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000642829  normal  0.085302 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3270  esterase, PHB depolymerase  29.94 
 
 		 372 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.67973 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2040  esterase-like protein  26.17 
 
 		 1002 aa  62  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.400928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2261  putative esterase/lipase/thioesterase  31.94 
 
 		 361 aa  62.4  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556081  normal  0.0820217 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3566  phospholipase/carboxylesterase  27.18 
 
 		 331 aa  62  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26429  predicted protein  35.23 
 
 		 363 aa  60.8  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000229905  normal  0.222049 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4602  esterase, PHB depolymerase  30.43 
 
 		 317 aa  59.7  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.462256  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1285  esterase, PHB depolymerase family  30.34 
 
 		 367 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.29485  normal  0.060549 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3344  PHB depolymerase family esterase  35.21 
 
 		 429 aa  59.3  0.00000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.335799  normal  0.68562 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1536  putative polyhydroxybutyrate depolymerase  27.21 
 
 		 276 aa  57.8  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.26582  normal  0.221996 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0137  esterase, PHB depolymerase  33.33 
 
 		 392 aa  57.4  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7674  putative polyhydroxy-alkanoate/butyrate(PHA/PHB) depolymerase  32.28 
 
 		 529 aa  57.8  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1173  esterase, PHB depolymerase family  35.88 
 
 		 410 aa  57.4  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3146  PHB depolymerase family esterase  34.48 
 
 		 308 aa  57  0.0000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.616621  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3195  PHB depolymerase family esterase  34.48 
 
 		 308 aa  57  0.0000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3660  PHB depolymerase family esterase  32.03 
 
 		 381 aa  56.6  0.0000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.741995  normal  0.231581 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3990  Poly (3-hydroxybutyrate ) depolymerase  32.82 
 
 		 396 aa  56.2  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1211  esterase, PHB depolymerase family  31.25 
 
 		 312 aa  56.2  0.0000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0349548 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2991  PHB depolymerase family esterase  31.82 
 
 		 419 aa  54.7  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1984  esterase, PHB depolymerase family  33.59 
 
 		 337 aa  54.3  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000502853  normal  0.034342 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1208  phospholipase/Carboxylesterase  25.32 
 
 		 223 aa  54.7  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2204  esterase, PHB depolymerase  26.87 
 
 		 367 aa  53.9  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.667331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1940  PHB depolymerase family esterase  33.33 
 
 		 433 aa  53.9  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3857  PHB depolymerase family esterase  35 
 
 		 414 aa  53.9  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0364  putative polyhydroxybutyrate depolymerase  38.55 
 
 		 265 aa  53.5  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.81916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1463  esterase, PHB depolymerase family  27.16 
 
 		 363 aa  53.5  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0308241  normal  0.241375 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4027  PHB depolymerase family esterase  35.29 
 
 		 387 aa  53.5  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.391886 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33500  esterase, poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  32.58 
 
 		 429 aa  52.8  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0371  esterase, PHB depolymerase  31.9 
 
 		 394 aa  52.8  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00180  conserved hypothetical protein  26.7 
 
 		 340 aa  52.4  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2301  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  38.2 
 
 		 232 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1240  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  30 
 
 		 370 aa  52  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.194401 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3198  putative polyhydroxybutyrate depolymerase  27.33 
 
 		 279 aa  52  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.396095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9052  polyhydroxybutyrate depolymerase  28.33 
 
 		 366 aa  52  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2770  PHB depolymerase family esterase  28.64 
 
 		 544 aa  51.6  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3487  hypothetical protein  29.01 
 
 		 332 aa  52  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1658  hypothetical protein  31.25 
 
 		 342 aa  51.2  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.32348  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4102  hypothetical protein  30.85 
 
 		 385 aa  51.6  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.943667 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3303  glycoside hydrolase family 62  32.61 
 
 		 436 aa  51.6  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000382833  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2576  esterase, PHB depolymerase  30 
 
 		 396 aa  50.4  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.225739  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3290  esterase, PHB depolymerase family  25.6 
 
 		 450 aa  50.8  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.195473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0209  esterase, PHB depolymerase family  32.28 
 
 		 342 aa  49.7  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0568  esterase, PHB depolymerase family  28.45 
 
 		 395 aa  50.1  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3485  hypothetical protein  29.76 
 
 		 269 aa  49.7  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2066  phospholipase/carboxylesterase  27.1 
 
 		 238 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.565731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2650  hypothetical protein  35.38 
 
 		 355 aa  49.3  0.00008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.376354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3522  phospholipase/carboxylesterase  27.27 
 
 		 237 aa  49.3  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.406594  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0711  esterase, PHB depolymerase  29.31 
 
 		 392 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.612274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2906  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  26.58 
 
 		 659 aa  48.5  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.686004  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3891  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  23.95 
 
 		 298 aa  48.9  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.947481  normal  0.780646 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1385  putative Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  22.15 
 
 		 464 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.516849  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5954  PHB depolymerase family esterase  30.15 
 
 		 438 aa  48.1  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.159743 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1969  esterase, PHB depolymerase  35.21 
 
 		 373 aa  47.4  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.127109  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3866  hypothetical protein  29.09 
 
 		 302 aa  47.4  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.178954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4905  Ricin B lectin  26.79 
 
 		 461 aa  47.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3488  hypothetical protein  42.86 
 
 		 447 aa  47.4  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0179  PHB depolymerase family esterase  31.78 
 
 		 656 aa  47.4  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.18087  normal  0.428012 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_92192  predicted protein  24.04 
 
 		 486 aa  47.4  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.865019  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2149  hypothetical protein  30.71 
 
 		 343 aa  47  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00000536767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2537  phospholipase/carboxylesterase  25.16 
 
 		 219 aa  47  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.311842  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31730  esterase, PHB depolymerase family  31.03 
 
 		 331 aa  46.6  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1484  esterase, PHB depolymerase family  31.3 
 
 		 425 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0220911  normal  0.169097 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>